GYPB (glycophorin B (MNS blood group))

symbol:
GYPB
locus group:
protein-coding gene
location:
4q31.21
gene_family:
Blood group antigens|CD molecules
alias symbol:
GPB|SS|CD235b|PAS-3
alias name:
Ss sialoglycoprotein|Sialoglycop...
entrez id:
2994
ensembl gene id:
ENSG00000250361
ucsc gene id:
uc003ijm.2
refseq accession:
NM_002100
hgnc_id:
HGNC:4703
approved reserved:
1988-08-31
4q31.21
基因染色体位置图

GYPB(Glycophorin B)是糖蛋白家族的重要成员,主要存在于人类红细胞膜上,与GYPA(Glycophorin A)和GYPE(Glycophorin E)共同构成糖蛋白家族。该家族的特点是编码红细胞表面的唾液酸糖蛋白,参与细胞膜稳定性、细胞间相互作用及病原体识别。GYPB基因位于4号染色体(4q31.21),编码的GYPB蛋白携带MN血型系统的S/s抗原,是输血医学中的重要血型标志物。GYPB的生物学功能包括维持红细胞形态、调节膜机械稳定性,并可能参与疟原虫(如恶性疟原虫)的入侵过程。GYPB突变可能导致血型变异(如MNSs系统的罕见型)或缺失表型(如GYPB缺失引起的S-s-U-表型),通常不会引起疾病,但可能影响输血相容性或疟疾易感性。GYPB过表达的研究较少,但理论上可能改变红细胞膜特性;表达降低则可能导致膜脆性增加或影响血型抗原表达。该基因与GYPA高度同源,两者通过基因重组事件形成杂交基因(如GYPB-A或GYPA-B),导致MNS血型系统的复杂变异。某些GYPB变异(如GYP*Mur)在东南亚人群中高频出现,与疟疾抵抗相关。在疾病关联方面,GYPB多态性可能影响疟疾感染风险,但与其他疾病的直接关联证据有限。糖蛋白家族的共性包括:编码跨膜蛋白、富含唾液酸修饰、参与细胞黏附与信号转导,并在红细胞生物学中发挥核心作用。

Glycophorins A (GYPA) and B (GYPB) are major sialoglycoproteins of the human erythrocyte membrane which bear the antigenic determinants for the MN and Ss blood groups. GYPB gene consists of 5 exons and has 97% sequence homology with GYPA from the 5' UTR to the coding sequence encoding the first 45 amino acids. In addition to the M or N and S or s antigens, that commonly occur in all populations, about 40 related variant phenotypes have been identified. These variants include all the variants of the Miltenberger complex and several isoforms of Sta; also, Dantu, Sat, He, Mg, and deletion variants Ena, S-s-U- and Mk. Most of the variants are the result of gene recombinations between GYPA and GYPB. Alternate splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jan 2015]

Glycophorins A(GYPA)和B(GYPB)是人红细胞膜的主要sialoglycoproteins其承担的MN和SS血型的抗原决定簇。 GYPB基因由5个外显子的并具有从5‘端非编码区与编码前45个氨基酸的编码序列GYPA 97%的序列同源性。除了M或N和S或s抗原,即通常发生在所有人群,约40相关变体的表型也已确定。这些变体包括站的Miltenberger复合和几个同种型的所有的变体同时,丹徒,星期六,他,Mg和缺失变异体婀娜,S-S-U-和MK。大多数变体是GYPA和GYPB之间基因的重组的结果。选择性剪接结果在多个抄本变形。 [由RefSeq的,2015年1月提供]

GYPB基因的碱基序列:[NCBI]
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GYPB基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs13040       rs1053396       rs1132783       rs1444985       rs1473055       rs1806700       rs1828506       rs1828507       rs1849110       rs1849119       rs1912746       rs1980037       rs2013452       rs2323377       rs2323378       rs2323429       rs2458014      

GYPB基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
GATA1
GYPB
Activation

GYPB基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

GYPB基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
E7ERJ5 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
P06028 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P06028 (UniProtKB)
IPI
GO:0005886
P06028 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
P06028 (UniProtKB)
TAS
GO:0005887
P06028 (UniProtKB)
TAS

可能调控 GYPB基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malaria 0.000542884 2 0 BeFree
Alcoholic Intoxication, Chronic 0.000542884 2 0 BeFree
Hypertensive disease 0.000542884 2 0 BeFree
Hereditary spherocytosis 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant hyperpyrexia due to anesthesia 0.000271442 1 0 BeFree
Anterior segment mesenchymal dysgenesis 0.000271442 1 0 BeFree
Ichthyosis linearis circumflexa 0.000271442 1 0 BeFree
Bronchitis, Chronic 0.000271442 1 0 BeFree
Graves Disease 0.000271442 1 0 BeFree
Bronchitis 0.000271442 1 0 BeFree

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