GPKOW (G-patch domain and KOW motifs)

symbol:
GPKOW
locus group:
protein-coding gene
location:
Xp11.23
gene_family:
G patch domain containing
alias symbol:
T54|GPATC5|GPATCH5|Spp2|Mos2
alias name:
G patch domain containing 5
entrez id:
27238
ensembl gene id:
ENSG00000068394
ucsc gene id:
uc004dmr.5
refseq accession:
NM_015698
hgnc_id:
HGNC:30677
approved reserved:
2004-05-11
Xp11.23
基因染色体位置图

GPKOW(也称为G-patch domain and KOW motifs-containing protein)是一个编码含有G-patch结构域和KOW基序的蛋白质的基因。G-patch结构域通常参与RNA结合和RNA代谢过程,而KOW基序常见于参与转录和翻译调控的蛋白质中,表明GPKOW可能在RNA加工或基因表达调控中发挥作用。GPKOW属于一个较大的RNA结合蛋白家族,该家族成员通常参与转录延伸、RNA剪接或核糖体生物发生等过程。GPKOW的具体功能尚未完全阐明,但研究表明它可能参与pre-mRNA剪接或转录调控,通过与RNA或其它蛋白质相互作用来影响基因表达。GPKOW的突变或表达异常可能干扰RNA代谢,导致细胞功能紊乱。目前尚未明确GPKOW与特定疾病的直接关联,但鉴于其在RNA处理中的潜在作用,其异常表达可能与某些遗传性疾病或癌症有关。GPKOW过表达可能通过异常调控RNA加工或转录过程而影响细胞增殖或分化,而降低表达可能导致RNA代谢缺陷,进而影响基因表达网络的稳定性。GPKOW所在的基因家族成员通常具有保守的RNA结合域,并在转录后调控中发挥重要作用。进一步研究GPKOW的功能将有助于理解其在细胞过程中的精确作用及其在疾病中的潜在影响。

This gene encodes a putative RNA-binding protein containing G-patch and KOW (Kyprides, Ouzounis, Woese) domains. The encoded protein interacts directly with protein kinase A and protein kinase X and is also found associated with the spliceosome. [provided by RefSeq, Aug 2013]

该基??因编码含有G-贴片和KOW(Kyprides,Ouzounis,Woese)域的推测的RNA结合蛋白。所编码的蛋白质直接与蛋白激酶A和蛋白激酶点?x相互作用并且还发现与剪接体相关联。 [由RefSeq的,2013年8月提供]

GPKOW基因的碱基序列:[NCBI]
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GPKOW基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs782821117       rs782807258       rs782810297       rs782802093       rs782804751       rs782798457       rs782801273       rs782797460       rs782788007       rs782792236       rs782796046       rs782784483       rs782778080       rs782780348       rs782775157       rs782776441       rs782769414      

GPKOW基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTTGGATCTCAGGCAACAG
58
TTGTCCTGCTGGATGTAGAG
59
GTGACTGTTAGTGAGTACTACCT
59
GTTCTGTTGCCTGAGATCC
58
GTGACTGTTAGTGAGTACTACC
58
GTTCTGTTGCCTGAGATCC
58
      尚未收录相关数据

GPKOW基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

GPKOW基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000398
Q92917 (UniProtKB)
TAS
GO:0003674
Q92917 (UniProtKB)
ND
GO:0003676
Q92917 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q92917 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q92917 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q92917 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q92917 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q92917 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q92917 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q92917 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q92917 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q92917 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q92917 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q92917 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q92917 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q92917 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q92917 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q92917 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q92917 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q92917 (UniProtKB)
IPI
GO:0005654
Q92917 (UniProtKB)
IDA
GO:0005654
Q92917 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q92917 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q92917 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q92917 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q92917 (UniProtKB)
TAS
GO:0008150
Q92917 (UniProtKB)
ND

可能调控 GPKOW基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Psoriasis 0.000271442 1 0 BeFree

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