GPHN (gephyrin)

symbol:
GPHN
locus group:
protein-coding gene
location:
14q23.3
gene_family:
alias symbol:
KIAA1385
alias name:
None
entrez id:
10243
ensembl gene id:
ENSG00000171723
ucsc gene id:
uc001xix.4
refseq accession:
NM_020806
hgnc_id:
HGNC:15465
approved reserved:
2001-03-30
14q23.3
基因染色体位置图

GPHN基因(全称Gephyrin,中文常译为"桥蛋白"或"支架蛋白")是一种在神经系统中发挥关键作用的支架蛋白基因,属于细胞骨架相关蛋白家族。该基因编码的Gephyrin蛋白主要功能是在抑制性突触(使用GABA或甘氨酸作为神经递质的突触)后膜上形成支架结构,帮助锚定抑制性神经递质受体(如GABA_A受体和甘氨酸受体)到神经元细胞膜上,从而维持神经信号的正常传递。GPHN基因的表达产物具有两个重要结构域:一个N端的G结构域(与微管结合有关)和一个C端的E结构域(与受体聚集有关),这两个结构域共同参与突触后致密区的形成。当GPHN基因发生突变时,可能导致蛋白功能异常,影响抑制性突触的正常组装,这与多种神经系统疾病相关,包括癫痫、自闭症谱系障碍、精神分裂症和智力障碍等。GPHN基因的过表达可能导致抑制性突触过度形成,引起神经信号传递失衡;而表达降低则可能导致抑制性突触减少,使神经兴奋性异常增高。该基因属于细胞骨架组织蛋白家族,这类蛋白的共同特点是能够介导细胞骨架与其他蛋白的相互作用,参与细胞形态维持和信号转导。研究还发现GPHN参与钼辅因子(Moco)的生物合成,这是某些代谢酶活性所必需的,因此GPHN缺陷也可能导致罕见的钼辅因子缺乏症。在分子水平上,GPHN通过与多种突触蛋白(如collybistin、neuroligin-2)相互作用来调节突触可塑性。目前针对GPHN相关疾病的研究主要集中在通过调节其表达或功能来恢复抑制性突触的平衡,这为相关神经系统疾病的治疗提供了潜在靶点。

This gene encodes a neuronal assembly protein that anchors inhibitory neurotransmitter receptors to the postsynaptic cytoskeleton via high affinity binding to a receptor subunit domain and tubulin dimers. In nonneuronal tissues, the encoded protein is also required for molybdenum cofactor biosynthesis. Mutations in this gene may be associated with the neurological condition hyperplexia and also lead to molybdenum cofactor deficiency. Numerous alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described; however, the full-length nature of all transcript variants is not currently known. [provided by RefSeq, Jul 2008]

这个基因编码经由高亲和力结合到一个受体亚基域和微管蛋白二聚体锚抑制性神经递质受体的突触后细胞骨架神经元装配蛋白。在非神经组织中,也需要钼辅生物合成的编??码的蛋白质。在这个基因的突变可以与神经系统疾病hyperplexia相关联,并且也导致钼辅因子缺乏症。编码不同同种型众多可变剪接转录物变体已有描述;然而,所有的转录物变体的全长性质不是目前公知的。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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GPHN基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs383421       rs414919       rs523845       rs720148       rs720382       rs723431       rs723432       rs728647       rs763286       rs766527       rs768770       rs928553       rs941808       rs957261       rs957262       rs971883       rs995374      

GPHN基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CAATTACCGAGATGGAATGGG
59
TTTACTGATGCTGGGAAGGG
60
TCGGAGTCCTTACAGTGAG
58
GGATCTTGTACGAGATCTTTGAG
59
AGTGGTGTTGCTTCAACAG
59
TGTAGAATGGATGCTTCTTGG
58
GTTGGATCCCTCAAAGTCC
58
GGTGATATCGACAGCACTG
58
ACCTATAGTGTATCTGAGGTCC
58
GATATCGACAGCACTGTGAC
59
CAAGAAATTCCCAACATTCCC
58
TTCCACATACAGGCCTAGAG
59
ACTATCTCAAGCAGGTGCTG
60
AATGTTGTTGGCAAGCCTG
60
CTGCCAAGATTCCAGACTC
58
TGAAGGAGTAGTGCTGAGG
58
AGTGGTGTTGCTTCAACAG
59
TGTAGAATGGATGCTTCTTGG
58
AACTGTAGGTGTCACAGAGG
59
GGATTTAGCAGCTCATTCCC
59
      尚未收录相关数据

GPHN基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

GPHN基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0006777
F5H039 (UniProtKB)
IEA
GO:0006777
H0YJ30 (UniProtKB)
IEA
GO:0006777
H0YJR5 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q9NQX3 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9NQX3 (UniProtKB)
IPI
GO:0005524
Q9NQX3 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
Q9NQX3 (UniProtKB)
IBA
GO:0005856
Q9NQX3 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
Q9NQX3 (UniProtKB)
TAS
GO:0006777
Q9NQX3 (UniProtKB)
IBA
GO:0018315
Q9NQX3 (UniProtKB)
IBA
GO:0030054
Q9NQX3 (UniProtKB)
IEA
GO:0030425
Q9NQX3 (UniProtKB)
IDA
GO:0032324
Q9NQX3 (UniProtKB)
IDA
GO:0032324
Q9NQX3 (UniProtKB)
TAS
GO:0045211
Q9NQX3 (UniProtKB)
IDA
GO:0046872
Q9NQX3 (UniProtKB)
IEA
GO:0061598
Q9NQX3 (UniProtKB)
IBA
GO:0061599
Q9NQX3 (UniProtKB)
IBA
GO:0061599
Q9NQX3 (UniProtKB)
TAS
GO:0072579
Q9NQX3 (UniProtKB)
IBA
GO:0097112
Q9NQX3 (UniProtKB)
IDA

可能调控 GPHN基因的相关microRNA:     

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Molybdenum Cofactor Deficiency, Complementation Group C 0.44 1 1 CLINVAR_MGD_ORPHANET_UNIPROT
Hereditary Hyperexplexia 0.24 0 1 CLINVAR_CTD_human
Combined molybdoflavoprotein enzyme deficiency 0.120542884 2 0 BeFree_CTD_human
Cocaine-Related Disorders 0.12 1 0 CTD_human
Alcoholic Intoxication, Chronic 0.12 1 0 CTD_human
Systemic arterial pressure 0.002367032 1 1 GAD
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Blood pressure finding 0.002367032 1 1 GAD
Dyskinesia, Drug-Induced 0.002367032 1 0 GAD
Epilepsy 0.001085767 4 0 BeFree

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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