GPD1 (glycerol-3-phosphate dehydrogenase 1)

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GPD1
locus group:
protein-coding gene
location:
12q13.12
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None
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2819
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NM_001257199
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HGNC:4455
approved reserved:
2001-06-22
12q13.12
基因染色体位置图

GPD1(甘油-3-磷酸脱氢酶1)是一种编码细胞质甘油-3-磷酸脱氢酶的基因,属于GPD基因家族。该家族成员(如GPD1和GPD2)的共同特点是参与甘油代谢和能量平衡,通过催化甘油-3-磷酸与二羟基丙酮磷酸(DHAP)之间的可逆转化,在糖酵解和甘油合成中起关键作用。GPD1主要在肝脏、脂肪组织和肌肉中表达,其产物通过调节甘油三酯合成和糖代谢影响能量储存与释放。GPD1的功能障碍或突变可能导致代谢异常,例如突变可能降低酶活性,干扰甘油代谢,与肥胖、胰岛素抵抗和2型糖尿病相关。过表达GPD1可能增加甘油三酯合成,促进脂肪积累,而表达降低则可能减少脂肪生成,但可能导致代偿性代谢紊乱。此外,GPD1与线粒体GPD2协同维持还原当量(NAD+/NADH)平衡,影响氧化还原状态。研究表明,GPD1在非酒精性脂肪肝(NAFLD)等代谢疾病中表达异常,可能成为治疗靶点。该基因的调控还涉及缺氧和激素信号(如胰岛素),进一步连接代谢与环境应激响应。

This gene encodes a member of the NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase family. The encoded protein plays a critical role in carbohydrate and lipid metabolism by catalyzing the reversible conversion of dihydroxyacetone phosphate (DHAP) and reduced nicotine adenine dinucleotide (NADH) to glycerol-3-phosphate (G3P) and NAD+. The encoded cytosolic protein and mitochondrial glycerol-3-phosphate dehydrogenase also form a glycerol phosphate shuttle that facilitates the transfer of reducing equivalents from the cytosol to mitochondria. Mutations in this gene are a cause of transient infantile hypertriglyceridemia. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Mar 2012]

该基因编码的依赖NAD的甘油-3-磷酸脱氢酶家族的一个成员。所编码的蛋白质通过催化磷酸二羟丙酮(DHAP),并减少尼古丁腺嘌呤二核苷酸(NADH)为甘油-3-磷酸(G3P)和NAD +的可逆转换起着碳水化合物和脂质代谢的关键作用。所编码的胞质蛋白和线粒体甘油-3-磷酸脱氢酶也可以形成一个甘油磷酸穿梭便于从细胞质到线粒体还原当量的转移。在这个基因的突变是瞬时婴儿血症的原因。编码多种亚型选择性剪接的转录物变体已经观察到这种基因。 [由RefSeq的,2012年3月提供]

GPD1基因的碱基序列:[NCBI]
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GPD1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs836179       rs836180       rs2232209       rs34013306       rs34926030       rs34944386       rs55975153       rs60633091       rs73123516       rs74449483       rs77437968       rs78070861       rs78153953       rs79544019       rs112053189       rs112371855       rs115532318      

GPD1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGAAAGTCTGCATTGTAGGC
58
CCACTCCCATGACAAATAGTC
59
AATGTCAAATACCTGCCAGG
58
ATGTCAGCATCCTCTGCAG
60
AGTCTGCATTGTAGGCTCC
59
CCCTTCCTTATCACCTCCAC
59
GTGAGACAACCATTGGCTG
59
CTGTGATACGGAAGTTTGGTG
59
GCTGACCTGATCACTACCT
59
CTCAATGGACTTTCCTGTACG
59
ATGCAGACACCAAACTTCC
58
GCTCAATGGACTTTAAGGCT
58
CTCTTATTAAGGCTGCAAGGA
58
ACTGTGATACGGAAGTTTGG
58
GCTGACTGAGATCATCAACAC
59
GCCGATGAACACATTTGGG
60
GTGAGACAACCATTGGCTG
59
CTGTGATACGGAAGTTTGGTG
59
ATGCAGACACCAAACTTCC
58
CACTACATTCTTTAAGGCTCCA
58
      尚未收录相关数据

GPD1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

GPD1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0004367
P21695 (UniProtKB)
TAS
GO:0004368
P21695 (UniProtKB)
IEA
GO:0005739
P21695 (UniProtKB)
IEA
GO:0005829
P21695 (UniProtKB)
TAS
GO:0006094
P21695 (UniProtKB)
IEA
GO:0006127
P21695 (UniProtKB)
IEA
GO:0006654
P21695 (UniProtKB)
TAS
GO:0009331
P21695 (UniProtKB)
IEA
GO:0019432
P21695 (UniProtKB)
TAS
GO:0042803
P21695 (UniProtKB)
IEA
GO:0045821
P21695 (UniProtKB)
IEA
GO:0046168
P21695 (UniProtKB)
IEA
GO:0051287
P21695 (UniProtKB)
IEA
GO:0070062
P21695 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
P21695 (UniProtKB)
IDA
GO:0071320
P21695 (UniProtKB)
IEA
GO:0071356
P21695 (UniProtKB)
IEA

可能调控 GPD1基因的相关microRNA:     

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
HYPERTRIGLYCERIDEMIA, TRANSIENT INFANTILE 0.36 1 0 CLINVAR_ORPHANET_UNIPROT
Diabetes Mellitus, Non-Insulin-Dependent 0.003810118 5 0 BeFree_LHGDN
Maturity onset diabetes mellitus in young 0.000271442 1 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Hepatomegaly 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000271442 1 0 BeFree
Liver carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

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