GPATCH2 (G-patch domain containing 2)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
GPATCH2
locus group:
protein-coding gene
location:
1q41
gene_family:
G patch domain containing|Protein phosphatase 1 regulatory subunits
alias symbol:
FLJ10252|CT110|PPP1R30|Pfa1
alias name:
cancer/testis antigen 110|protein …
entrez id:
55105
ensembl gene id:
ENSG00000092978
ucsc gene id:
uc001hlf.2
refseq accession:
NM_018040
hgnc_id:
HGNC:25499
approved reserved:
2004-05-12

基因染色体位置

基因染色体位置

1q41
基因染色体位置图

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

GPATCH2基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs166449       rs169085       rs171946       rs187845       rs265114       rs265123       rs265124       rs265125       rs265126       rs265127       rs265128       rs265129       rs265130       rs265131       rs265132       rs265133       rs265134      

基因表达

基因表达

GPATCH2基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TACTGCAGGATTTGTAGGTG
57
CAGCCCATATTCTGAAGCA
58
TTTCCAAGCTAGACTCAGTCG
60
GTTTGTAGCCATTGAAGTTGGA
60
TCCAACTTCAATGGTACCCA
59
TCATGGTGATGAGAATCCGG
59
TGAAAGTTGGAAGCATCAGC
59
TTACCTGCTGGCTGTTCTC
60
TCCAACTTCAATGGTACCCA
59
TCATGGTGATGAGAATCCGG
60
ACGAACCAGACCAATAAGGA
58
TGCTGGAATCACTTTCACTC
58
TAGGTTCCCTCTAACTGCCT
59
ATTAGTGACCTGGTCATGCT
58
TCTGAAAGTTGGAAGGTGG
57
GCTTTACCATTTACAACCTGTG
58
ACTACTGCAGGATTTGTAGGT
59
GCCCATATTCTGAAGCATTCG
60
GAAAGTTGGAAGCATCAGCT
59
TTACCTGCTGGCTGTTCTC
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

GPATCH2基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

GPATCH2基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003676
Q9NW75 (UniProtKB)
IEA
GO:0005730
Q9NW75 (UniProtKB)
IEA
GO:0010923
Q9NW75 (UniProtKB)
IDA
GO:0016607
Q9NW75 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 GPATCH2基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Carcinogenesis 0.000271442 1 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of testis 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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