GPA33 (glycoprotein A33)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
GPA33
locus group:
protein-coding gene
location:
1q24.1
gene_family:
V-set domain containing|Immunoglobulin-like domain containing
alias symbol:
A33
alias name:
None
entrez id:
10223
ensembl gene id:
ENSG00000143167
ucsc gene id:
uc001gea.2
refseq accession:
NM_005814
hgnc_id:
HGNC:4445
approved reserved:
2000-05-05

基因染色体位置

基因染色体位置

1q24.1

基因简述

基因简述

GPA33（Glycoprotein A33）是一种细胞表面糖蛋白，属于免疫球蛋白超家族（IgSF）成员，主要在上皮细胞中表达，尤其在胃肠道上皮细胞中高表达。它的生物学功能与细胞间黏附、信号传导和免疫调节相关，可能在维持上皮屏障完整性和细胞间通讯中发挥作用。GPA33通过其胞外免疫球蛋白样结构域与其他分子相互作用，参与细胞识别和黏附过程。该基因的突变或异常表达可能影响上皮组织的稳态，但目前对其突变的具体影响研究较少。GPA33与某些疾病的关系备受关注，特别是在结直肠癌中，它常作为肿瘤相关抗原过度表达，可能参与肿瘤细胞的增殖、迁移或免疫逃逸，因此成为潜在的诊断标志物或免疫治疗靶点。当GPA33过表达时，可能促进肿瘤进展或影响免疫微环境；而降低其表达可能抑制肿瘤生长或增强免疫系统对癌细胞的识别。GPA33属于免疫球蛋白超家族，该家族的共性是其成员均含有免疫球蛋白样结构域，参与细胞间相互作用、免疫应答和信号转导等过程。这一家族包括许多重要的免疫相关分子（如抗体、T细胞受体等）和细胞黏附分子，在免疫防御、细胞通讯和组织发育中发挥核心作用。

The glycoprotein encoded by this gene is a cell surface antigen that is expressed in greater than 95% of human colon cancers. The open reading frame encodes a 319-amino acid polypeptide having a putative secretory signal sequence and 3 potential glycosylation sites. The predicted mature protein has a 213-amino acid extracellular region, a single transmembrane domain, and a 62-amino acid intracellular tail. The sequence of the extracellular region contains 2 domains characteristic of the CD2 subgroup of the immunoglobulin (Ig) superfamily. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由该基因编码的糖蛋白是在人结肠癌的大于95％表达的细胞表面抗原。的开放阅读框编码具有推定的分泌信号序列和3潜在糖基化位点的319个氨基酸的多肽。预测的成熟蛋白质具有一个213个氨基酸的胞外区，一个跨膜结构域，以及一个62个氨基酸的胞内尾。胞外区的序列包含免疫球蛋白（Ig）超家族的CD2子组的2域特性。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对GPA33基因的介绍     Wikipedia数据库中对GPA33基因的介绍

基因序列

基因序列

GPA33基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

GPA33基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs3753915       rs71630375       rs111275908       rs112060538       rs112939557       rs113737072       rs143655684       rs147197212       rs192544497       rs527350007       rs531564622       rs532814475       rs536751921       rs543706490       rs544645829       rs548878038       rs549072046      

基因表达

基因表达

GPA33基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GGTTACTACATCTGTACCTCC
57
TCATGGAGGGAGATCTGAC
58
TCACTCATACGGAAAGGGTG
59
TGACGCGATTCTTATAAAGCTC
59
CTCTGTGCAGAGCATTTGG
59
GAGTTTCCACAGAGATGGC
58
AGAATGAACGAGTGTCAGGG
60
GAGGTGGAAGTGTGGTAGG
59
CTCATACGGAAAGGGTGGT
59
AGACAGAACACTCGTAGGTG
59
AATGAACGAGTGTCAGGGT
59
GAGGTGGAAGTGTGGTAGG
59
ACTCATACGGAAAGGGTGG
59
ACAGAACACTCGTAGGTGC
60
CACTCATACGGAAAGGGTG
58
CTGACGCGATTCTTATAAAGC
57
TTACTACATCTGTACCTCCAGC
59
TTCATGGAGGGAGATCTGAC
59
CTCTGTGCAGAGCATTTGG
59
AGTTTCCACAGAGATGGCA
59

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
KLF4
GPA33
Activation
19551868

基因本体信息

GPA33基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

GPA33基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016337
Q99795 (UniProtKB)
IBA
 
名称：
receptor activity
 
本体信息：
molecular_function
 
基因本体信息
详细说明：
"Combining with an extracellular or intracellular messenger to initiate a change in cell activity." [GOC:ceb, ISBN:0198506732]
 
上级：
GO:0060089 ! molecular transducer activity

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 GPA33基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Hypertensive disease 0.002367032 1 0 GAD
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Osteoporosis 0.002367032 1 0 GAD
Malignant tumor of colon 0.001357209 5 0 BeFree
Colon Carcinoma 0.001085767 4 0 BeFree
Mycoses 0.000542884 2 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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