GLYCAM1 (glycosylation dependent cell adhesion molecule 1 (pseudogene))

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
GLYCAM1
locus group:
pseudogene
location:
12q13.2
gene_family:
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None
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HGNC:18023
approved reserved:
2006-01-23

基因染色体位置

基因染色体位置

12q13.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

GLYCAM1（Glycosylation Dependent Cell Adhesion Molecule 1）是一种编码糖基化依赖性细胞黏附分子的基因，属于选择素配体家族。该基因主要表达于淋巴组织和内皮细胞，其编码的蛋白质是一种高度糖基化的黏蛋白，通过与选择素（如L-选择素）结合，参与白细胞与内皮细胞的黏附过程，从而在免疫应答和炎症反应中发挥关键作用。GLYCAM1的生物学功能主要体现在介导淋巴细胞归巢（homing）到淋巴结的过程，帮助免疫细胞在体内定向迁移。该基因的表达产物具有多个O-糖基化位点，这些糖基化修饰对其功能至关重要，因为选择素识别的是特定的糖链结构（如sLex抗原）。如果GLYCAM1发生突变，可能导致糖基化异常，进而影响其与选择素的结合能力，削弱免疫细胞的迁移功能，可能引发免疫缺陷或炎症性疾病。研究表明，GLYCAM1的异常表达与某些自身免疫性疾病和慢性炎症相关，例如类风湿性关节炎和炎症性肠病。当GLYCAM1过表达时，可能增强白细胞的黏附与迁移，导致过度的炎症反应或自身免疫攻击；而降低表达则可能削弱免疫监视功能，增加感染风险或影响淋巴结的免疫细胞募集。GLYCAM1属于选择素配体基因家族，该家族成员（如CD34、Podocalyxin等）的共同特点是编码高度糖基化的细胞表面蛋白，均含有大量O-糖基化修饰，并能与选择素家族受体结合，参与细胞间识别和黏附过程。这些基因在免疫调节、炎症反应和胚胎发育中具有重要作用。

None

无

OMIM数据库中对GLYCAM1基因的介绍     Wikipedia数据库中对GLYCAM1基因的介绍

基因序列

基因序列

GLYCAM1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

GLYCAM1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs882419       rs882420       rs937308       rs937309       rs937310       rs939463       rs1495353       rs1532371       rs1691625       rs1691626       rs1691627       rs1716353       rs1716354       rs1716355       rs1716356       rs1795818       rs1795819      

基因表达

基因表达

GLYCAM1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CATCCTTGATGAAGAATGCTG
57
TGTAGTCTCTTCTAATTGGAGC
57
TGCAGATGCCTTACTCCTC
59
TTGTCCAGATTCTTCCCGA
58
TCCTTTAGATACTCCTCAGCA
58
TTTGTCCAGATTCTTCCCG
58
AGAAAGGGCCTTCCTTAATCC
60
CTTCTGGCTCTAGGTCATCC
59
AGAAAGGGCCTTCCTTAATCC
60
CTTCTGGCTCTAGGTCATCC
59
AGATGCCTTACTCCTCAGC
59
CTTTGTCCAGATTCTTCCCG
59
AGAAGGTGAAATTCACTCGG
58
TTGCTGAGGAGTATCTAAAGG
57
CATCCTTGATGAAGAATGCTG
57
GTAGTCTCTTCTAATTGGAGCT
57
GAAAGGGCCTTCCTTAATCCT
60
CTTCTGGCTCTAGGTCATCC
59
GAAAGGGCCTTCCTTAATCCT
60
CTTCTGGCTCTAGGTCATCC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

GLYCAM1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

GLYCAM1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005886
Q8IVK1 (UniProtKB)
TAS
GO:0050776
Q8IVK1 (UniProtKB)
TAS

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 GLYCAM1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Mammary Neoplasms, Experimental 0.12 1 0 CTD_human
Neoplasm Invasiveness 0.12 1 0 CTD_human
Animal Mammary Neoplasms 0.12 1 0 CTD_human

基因相关服务

基因相关服务

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