GKN2 (gastrokine 2)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
GKN2
locus group:
protein-coding gene
location:
2p13.3
gene_family:
BRICHOS domain containing
alias symbol:
TFIZ1|PRO813|VLTI465|blottin|GDDR|BRICD1B
alias name:
down regulated in gastric cancer G…
entrez id:
200504
ensembl gene id:
ENSG00000183607
ucsc gene id:
uc002sfa.3
refseq accession:
NM_182536
hgnc_id:
HGNC:24588
approved reserved:
2007-01-29

基因染色体位置

基因染色体位置

2p13.3
基因染色体位置图

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

GKN2基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1128272       rs4514909       rs4516463       rs4854469       rs4854534       rs4854535       rs5022949       rs5831949       rs6720209       rs6720316       rs6742850       rs6744407       rs7561266       rs7600351       rs7600753       rs10048657       rs10048698      

基因表达

基因表达

GKN2基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TATGAGAAACAGGCTCTGGA
58
TTTGATCAGAGACTCCAGAGG
59
TATGAGAAACAGGCTCTGGA
58
TTTGATCAGAGACTCCAGAGG
59
AGACGTGGATTGGTTCCTG
60
CCAGCACCGACATTATGTG
59
TATGAGAAACAGGCTCTGGAC
59
TTTGATCAGAGACTCCAGAGG
59
GGTCACCCATTGAGAAACTC
59
CCAGCACCGACATTATGTG
59
TATGAGAAACAGGCTCTGGAC
60
TTTGATCAGAGACTCCAGAGG
59
CTATGAGAAACAGGCTCTGG
58
TTGATCAGAGACTCCAGAGG
58
GTCACCCATTGAGAAACTCTG
59
CCAGCACCGACATTATGTG
59
CTATGAGAAACAGGCTCTGG
57
TTGATCAGAGACTCCAGAGG
58

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
NFKB1
GKN2
Repression
17595528
RELA
GKN2
Repression
17595528

基因本体信息

GKN2基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

GKN2基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005615
Q86XP6 (UniProtKB)
IBA
GO:0042127
Q86XP6 (UniProtKB)
IBA
GO:0045178
Q86XP6 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 GKN2基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Adenocarcinoma 0.00272435 1 0 LHGDN
Lung Neoplasms 0.002367032 1 1 GAD
Stomach Carcinoma 0.001085767 4 0 BeFree
Malignant neoplasm of stomach 0.001085767 4 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.000542884 2 0 BeFree
Mucosa-Associated Lymphoid Tissue Lymphoma 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000271442 1 0 BeFree
Prostate carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of prostate 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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