GKN1 (gastrokine 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
GKN1
locus group:
protein-coding gene
location:
2p13.3
gene_family:
BRICHOS domain containing
alias symbol:
AMP18|CA11|BRICD1
alias name:
BRICHOS domain containing 1
entrez id:
56287
ensembl gene id:
ENSG00000169605
ucsc gene id:
uc002sfc.4
refseq accession:
NM_019617
hgnc_id:
HGNC:23217
approved reserved:
2003-10-24

基因染色体位置

基因染色体位置

2p13.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

The protein encoded by this gene is found to be down-regulated in human gastric cancer tissue as compared to normal gastric mucosa. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基??因编码的蛋白质被发现在胃癌组织中下调相比正常胃粘膜。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

GKN1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs4072127       rs4417751       rs4430980       rs4456735       rs4458243       rs4462818       rs4575760       rs4610084       rs5831951       rs5831955       rs6712635       rs6741400       rs6752867       rs6758950       rs7586849       rs7587050       rs9808077      

基因表达

基因表达

GKN1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATGGAAATGGCTTTGCTGC
60
AATGGAGGGCATGACTTCC
60
GCCCTAGCTAACTATAATATCAACG
59
TCATTGTTGACACTCACTGAC
59
GCCCTAGCTAACTATAATATCAACG
59
TCATTGTTGACACTCACTGAC
59
ACAATGAACACAATGTGGCC
60
AGCAAAGCCATTTCCATAATCC
60
GCCCTAGCTAACTATAATATCAACG
59
CATTGTTGACACTCACTGACTG
60
GCCCTAGCTAACTATAATATCAACG
59
CATTGTTGACACTCACTGACTG
60
GCCCTAGCTAACTATAATATCAACG
59
ATTGTTGACACTCACTGACTG
59
GCCCTAGCTAACTATAATATCAACG
59
ATTGTTGACACTCACTGACTG
59
CAATGAACACAATGTGGCCA
60
AGCAAAGCCATTTCCATAATCC
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

GKN1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

GKN1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003674
Q9NS71 (UniProtKB)
ND
GO:0005575
Q9NS71 (UniProtKB)
ND
GO:0005615
Q9NS71 (UniProtKB)
IBA
GO:0007586
Q9NS71 (UniProtKB)
NAS
GO:0042127
Q9NS71 (UniProtKB)
IBA
GO:0051781
Q9NS71 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 GKN1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Adenocarcinoma 0.12272435 2 0 CTD_human_LHGDN
Stomach Neoplasms 0.120542884 3 0 BeFree_CTD_human
Ovarian Cysts 0.12 1 0 CTD_human
Malignant neoplasm of stomach 0.00434307 16 0 BeFree
Stomach Carcinoma 0.003800186 14 0 BeFree
Infection 0.00272435 1 0 LHGDN
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Helicobacter pylori (H. pylori) infection in conditions classified elsewhere and of unspecified site 0.001628651 6 0 BeFree
Carcinogenesis 0.001357209 5 0 BeFree
Chronic gastritis 0.000542884 2 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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