GIMAP6 (GTPase, IMAP family member 6)

symbol:
GIMAP6
locus group:
protein-coding gene
location:
7q36.1
gene_family:
GTPases, IMAP
alias symbol:
FLJ22690|IAN6
alias name:
immune-associated nucleotide-bindi…
entrez id:
474344
ensembl gene id:
ENSG00000133561
ucsc gene id:
uc003whn.4
refseq accession:
NM_024711
hgnc_id:
HGNC:21918
approved reserved:
2004-10-29
7q36.1
基因染色体位置图

GIMAP6(GTPase of the immunity-associated protein family member 6)属于GIMAP基因家族,该家族主要编码与免疫系统相关的GTP酶蛋白,在淋巴细胞发育、存活和功能调控中发挥重要作用。GIMAP家族成员通常含有保守的GTP结合结构域,并在免疫细胞(如T细胞、B细胞)中高表达,参与细胞凋亡、自噬和信号转导等过程。GIMAP6作为一种免疫相关GTP酶,可能在T细胞稳态维持中起作用,其表达水平变化会影响淋巴细胞的存活或功能。研究表明,GIMAP6可能通过调控内质网应激反应或线粒体功能来影响免疫细胞的命运决定。若GIMAP6发生突变或表达异常,可能导致免疫功能紊乱,例如与自身免疫性疾病(如类风湿关节炎)或淋巴系统异常相关。过表达GIMAP6可能增强淋巴细胞存活,而表达降低则可能诱发免疫细胞凋亡,从而影响机体免疫应答能力。此外,GIMAP家族成员(如GIMAP1、GIMAP5)的缺失已在小鼠模型中证实会导致严重的T细胞缺陷,提示GIMAP6可能具有类似的免疫调控功能。目前关于GIMAP6的具体分子机制仍需进一步研究,但其在免疫系统中的保守性暗示其在进化过程中对宿主防御的重要性。

This gene encodes a member of the GTPases of immunity-associated proteins (GIMAP) family. GIMAP proteins contain GTP-binding and coiled-coil motifs, and may play roles in the regulation of cell survival. Decreased expression of this gene may play a role in non-small cell lung cancer. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene, which is found in a cluster with seven additional GIMAP genes on the long arm of chromosome 7. [provided by RefSeq, Sep 2011]

这个基因编码免疫相关蛋白(GIMAP)家族的GTP酶的成员。 GIMAP蛋白含有GTP结合和卷曲螺旋图案,并在细胞存活的调控可能发挥作用。降低该基因的表达可能在非小细胞肺癌的作用。另外剪接转录变体编码多种亚型已经观察到这种基因,这是在一个集群中发现了另外七GIMAP基因上[由RefSeq的,2011年9月提供]的7号染色体长臂

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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GIMAP6基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs15634       rs3088115       rs3735082       rs3735083       rs3735084       rs3735085       rs3735086       rs4615473       rs4725925       rs6946579       rs7784767       rs9691508       rs10235151       rs10248039       rs10272462       rs11762727       rs11974345      

GIMAP6基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTGTCAGGAGGTCTAAGGG
59
TTTCCTGTTGCACTCTTCC
58
TGTTCATACACTGTGGAAGC
58
TCTTCCTCCATCTCTGCAC
59
TGTTCATACACTGTGGAAGC
58
TCTTCCTCCATCTCTGCAC
59
GTTCATACACTGTGGAAGCT
58
TCTTCCTCCATCTCTGCAC
59
GTTCATACACTGTGGAAGCT
58
TCTTCCTCCATCTCTGCAC
59
TGTCAGGAGGTCTAAGGGA
59
TTTCCTGTTGCACTCTTCC
58
GTCAGGAGGTCTAAGGGAG
58
TTTCCTGTTGCACTCTTCC
58
TGTTCATACACTGTGGAAGCT
60
CTTCCTCCATCTCTGCACC
60
TGTTCATACACTGTGGAAGCT
60
CTTCCTCCATCTCTGCACC
60
      尚未收录相关数据

GIMAP6基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

GIMAP6基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005525
B4DH95 (UniProtKB)
IEA
GO:0005525
Q6P9H5 (UniProtKB)
IEA
GO:0005829
Q6P9H5 (UniProtKB)
IDA

可能调控 GIMAP6基因的相关microRNA:     

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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