GEN1 (GEN1 Holliday junction 5' flap endonuclease)

symbol:
GEN1
locus group:
protein-coding gene
location:
2p24.2
gene_family:
alias symbol:
FLJ40869|Gen
alias name:
Holliday junction resolvase
entrez id:
348654
ensembl gene id:
ENSG00000178295
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uc002rct.3
refseq accession:
NM_182625
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HGNC:26881
approved reserved:
2007-11-14
2p24.2
基因染色体位置图

GEN1(也称为GEN1 Holliday junction 5' flap endonuclease)是一种关键的DNA修复蛋白,属于RAD2/XPG核酸酶家族。它的主要功能是参与DNA同源重组修复(HRR)和Holliday junction(HJ)的分解,确保基因组稳定性。GEN1通过切割DNA交叉结构(如Holliday junction)来促进染色体正确分离,防止DNA损伤积累。它在细胞周期的G2/M期活跃,与BLM、MUS81等核酸酶协同作用。GEN1突变可能导致DNA修复缺陷,与癌症(如乳腺癌、卵巢癌)和遗传性疾病(如范可尼贫血)相关。GEN1过表达可能引起基因组不稳定性,增加染色体异常风险,而降低表达则会导致DNA损伤修复效率下降,引发细胞凋亡或癌变。作为RAD2/XPG家族成员,该家族共性为具有保守的核酸酶结构域,参与DNA修复、复制和重组。GEN1的功能丧失可能影响其他修复通路(如NHEJ)的平衡,导致细胞对辐射或化疗药物敏感。研究还发现GEN1与BRCA1/2通路存在交叉作用,提示其在遗传性癌症中的潜在调控角色。

None

GEN1基因的碱基序列:[NCBI]
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GEN1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs300165       rs300166       rs300167       rs300168       rs300169       rs300170       rs300171       rs300172       rs300173       rs300174       rs300175       rs300176       rs300177       rs300178       rs300179       rs750772       rs1031768      

GEN1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TCGGTATGGGTCTTCTGGA
59
AGCATATGGAGGCACTCTC
59
CTTCCTTGGCTTAGGTTTCAG
59
GTGTAAAGACTGAAGCGGG
58
AGGCAACTCAGTGAAGTAGAG
59
CTTGAATAACCTCATGGAATGGG
59
ATCTGGCCTTGTTGTAACC
57
AAGTGACATGTAAGTAGGGAC
57
TTGATCTGAGTCTCTGGGT
57
AAATAAGTTCCTGAGGTGGG
57
TAGGCAACTCAGTGAAGTAGAG
59
TTGAATAACCTCATGGAATGGG
58
TGATCTGAGTCTCTGGGTG
58
AAATAAGTTCCTGAGGTGGG
57
TTTATCTGCAGTCTCACTTACC
58
TAATGGAAGATCAAGCCCTG
57
GGCAACTCAGTGAAGTAGAG
58
CTTGAATAACCTCATGGAATGG
57
      尚未收录相关数据

GEN1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

GEN1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003677
A0A087WXY3 (UniProtKB)
IEA
GO:0004518
A0A087WXY3 (UniProtKB)
IEA
GO:0006281
A0A087WXY3 (UniProtKB)
IEA
GO:0090305
A0A087WXY3 (UniProtKB)
IEA
GO:0004518
E9PLG0 (UniProtKB)
IEA
GO:0006281
E9PLG0 (UniProtKB)
IEA
GO:0090305
E9PLG0 (UniProtKB)
IEA
GO:0004518
E9PM30 (UniProtKB)
IEA
GO:0006281
E9PM30 (UniProtKB)
IEA
GO:0090305
E9PM30 (UniProtKB)
IEA
GO:0000724
Q17RS7 (UniProtKB)
IMP
GO:0003677
Q17RS7 (UniProtKB)
IEA
GO:0004520
Q17RS7 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q17RS7 (UniProtKB)
TAS
GO:0005813
Q17RS7 (UniProtKB)
IDA
GO:0008821
Q17RS7 (UniProtKB)
IMP
GO:0010824
Q17RS7 (UniProtKB)
IMP
GO:0010824
Q17RS7 (UniProtKB)
IMP
GO:0046872
Q17RS7 (UniProtKB)
IEA
GO:0070062
Q17RS7 (UniProtKB)
IDA
GO:0071139
Q17RS7 (UniProtKB)
IMP
GO:0071140
Q17RS7 (UniProtKB)
IMP
GO:0090267
Q17RS7 (UniProtKB)
IMP
GO:0090305
Q17RS7 (UniProtKB)
IEA
GO:0090305
Q17RS7 (UniProtKB)
IEA

可能调控 GEN1基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malignant neoplasm of breast 0,002909916 2 0 BeFree_GAD
Tobacco Use Disorder 0,002367032 1 0 GAD
Glioma 0,002367032 1 0 GAD
Brain Neoplasms 0,002367032 1 0 GAD
Breast Carcinoma 0,000542884 2 0 BeFree
Prostate carcinoma 0,000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of ovary 0,000271442 1 0 BeFree
Ovarian Carcinoma 0,000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of prostate 0,000271442 1 0 BeFree

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山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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