GCOM1 (GCOM1, MYZAP-POLR2M combined locus)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
GCOM1
locus group:
other
location:
15q21.3
gene_family:
alias symbol:
FLJ30973|GRINL1A|MYZAP-POLR2M
alias name:
MYZAP-POLR2M readthrough
entrez id:
145781
ensembl gene id:
ENSG00000137878
ucsc gene id:
uc002aem.4
refseq accession:
NM_001018090
hgnc_id:
HGNC:26424
approved reserved:
2008-08-05

基因染色体位置

基因染色体位置

15q21.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

GCOM1（Genomic Context Overlapping with MACROD2 1）是一个人类基因，位于染色体20p12.1区域，与邻近的MACROD2基因部分重叠。目前关于GCOM1的生物学功能和特点的研究相对有限，但已知它可能参与转录调控或染色质重塑等过程。GCOM1的表达产物可能是一种非编码RNA或功能蛋白，但具体结构尚不明确。该基因的主要作用位点可能在细胞核内，参与基因表达的调控网络。关于GCOM1突变的影响，目前缺乏详细研究，但染色体20p12.1区域的异常与某些神经发育障碍和精神疾病（如精神分裂症）的易感性相关，暗示GCOM1可能在这些疾病中起作用。如果GCOM1过表达，可能干扰邻近基因MACROD2的功能，后者已知参与DNA修复和神经发育；而降低表达则可能影响其调控的靶基因网络。GCOM1属于一个尚未明确命名的基因家族，但可能与MACROD2所在的ADP-核糖基水解酶基因家族存在功能关联，这类家族通常参与NAD+代谢、DNA损伤修复和表观遗传调控。由于研究较少，GCOM1的具体机制和临床意义仍需进一步探索。

This locus represents naturally occurring readthrough transcription between the neighboring MYZAP (myocardial zonula adherens protein) and POLR2M (polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide M) genes on chromosome 15. Alternative splicing results in multiple readthrough transcript variants. Readthrough variants may encode proteins that share sequence identity with the upstream gene product or with both the upstream and downstream gene products. Some readthrough transcript variants are also expected to be candidates for nonsense-mediated decay (NMD). [provided by RefSeq, Oct 2013]

这一位点代表自然发生和POLR2M（聚合酶（RNA）II（DNA导演）多肽M）在15号染色体剪接产生多个通读转录变异体的基因相邻MYZAP（心肌黏着小带蛋白）之间的通读转录。通读变体可编码与上游基因产物或二者的上游和下游的基因产物共享的序列同一性的蛋白质。有些通读转录变异体也有望成为无义介导的衰变（NMD）的候选人。 [由RefSeq的，2013年10月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

GCOM1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs15080       rs724785       rs749678       rs750490       rs750648       rs880229       rs890269       rs890270       rs890271       rs933839       rs935547       rs935548       rs937250       rs937251       rs937252       rs937253       rs937254      

基因表达

基因表达

GCOM1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATTATGAGGAGATGCAAGCA
57
CCCTTCTGGATTATAACTCCG
58
GACAAGGAAAGGTATCAGCA
57
ATGCACCATGTCATCTAGG
57
ATCAACTGCAACTTCAACTCC
59
CGACATGATCTCCTCGACC
60
CTTCTACCCAGCCAAACAG
58
CATGGTTAACTCCAGGACTC
58
GTATCAGCAGTTGGAGGAG
57
ATGATTCAATCTCCTCGACC
57
CTTCTACCCAGCCAAACAG
58
CATGGTTAACTCCAGGACTC
58
ATTATGAGGAGATGCAAGCA
57
CCCTTCTGGATTATAACTCCG
57
ATCTTCTACCCAGGTTACCT
57
CTTCTGAGGAAATAGGAGACC
57
ACATGAAACAGAAATGTCTGGG
59
AAAGGTAACCTCCTCGACC
59
AGTTGCAACAGAAACAGCTC
59
TTTAGGCCTTTCCTTCCCTC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

GCOM1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

GCOM1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016591
H8Y6P7 (UniProtKB)
IEA
GO:0035556
H8Y6P7 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 GCOM1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Coronary heart disease 0.002367032 1 1 GAD
Prostate carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of prostate 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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