GCM1 (glial cells missing transcription factor 1)

symbol:
GCM1
locus group:
protein-coding gene
location:
6p12.1
gene_family:
alias symbol:
hGCMa
alias name:
None
entrez id:
8521
ensembl gene id:
ENSG00000137270
ucsc gene id:
uc003pbp.4
refseq accession:
NM_003643
hgnc_id:
HGNC:4197
approved reserved:
1998-10-02
6p12.1
基因染色体位置图

GCM1(胶质细胞缺失同源物1)是一种转录因子,属于GCM基因家族,该家族在脊椎动物中包括GCM1和GCM2两个成员。GCM家族基因的共同特点是编码含有GCM结构域的蛋白质,这种结构域能够特异性结合DNA并调控下游基因的表达,主要参与胚胎发育和组织分化的过程。GCM1在胎盘发育中起关键作用,特别是在滋养层细胞的分化和胎盘形成中。它通过调控合胞体滋养层细胞的融合,促进胎盘屏障的建立,确保母胎间的物质交换和妊娠维持。GCM1的表达主要局限于胎盘,但在某些肿瘤中也可能异常表达。GCM1的突变或功能缺失可能导致严重的胎盘发育缺陷,如绒毛膜发育不全,进而引发妊娠并发症甚至流产。研究表明,GCM1的缺失或功能异常与子痫前期和胎儿生长受限等妊娠相关疾病密切相关。当GCM1过表达时,可能促进滋养层细胞的过度增殖和侵袭,增加妊娠相关疾病的风险;而表达降低则可能导致胎盘功能不全,影响胎儿发育。此外,GCM1还参与调控其他基因的表达,如合胞素(syncytin)等与细胞融合相关的基因,进一步影响胎盘的正常功能。在非生理条件下,GCM1的异常表达可能与某些肿瘤的发生发展相关,但其具体机制仍需进一步研究。GCM1作为GCM家族的重要成员,不仅在胎盘发育中不可或缺,还可能在其他生理和病理过程中发挥作用,是生殖生物学和妊娠相关疾病研究的重要靶点。

This gene encodes a DNA-binding protein with a gcm-motif (glial cell missing motif). The encoded protein is a homolog of the Drosophila glial cells missing gene (gcm). This protein binds to the GCM-motif (A/G)CCCGCAT, a novel sequence among known targets of DNA-binding proteins. The N-terminal DNA-binding domain confers the unique DNA-binding activity of this protein. [provided by RefSeq, Jul 2008]

这个基因编码与GCM-基序的DNA结合蛋白(神经胶质细胞缺少基序)。所编码的蛋白质是果蝇神经胶质细胞缺失基因(GCM)的同源物。该蛋白质结合的GCM基序(A / G)CCCGCAT,DNA结合蛋白的已知的目标之间的新的序列。 N-末端DNA结合结构域赋予该蛋白的独特的DNA结合活性。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

GCM1基因的碱基序列:[NCBI]
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GCM1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1129069       rs1129070       rs2518572       rs2518573       rs2518574       rs2518576       rs2518577       rs2518578       rs2518579       rs2518580       rs2816337       rs2816338       rs2816339       rs2816340       rs2816341       rs2816342       rs2816343      

GCM1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGAAGAAAGTGAACACAGCAC
59
TTTCACCTGGAAGAGACCTG
59
TGAAGAAAGTGAACACAGCA
58
TTTCACCTGGAAGAGACCT
57
GTGAAACTGCCACAGAACG
59
CGAGCTGTAGATGTGTTTGG
59
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
GCM1
ERVFRD-1
Unknown
GCM1
ERVW-1
Activation
GCM1
MFSD2A
Unknown
GCM1
PGF
Activation
HDAC3
GCM1
Unknown
KCNIP3
GCM1
Repression
POU2F1
GCM1
Unknown

GCM1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

GCM1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000978
Q9NP62 (UniProtKB)
IDA
GO:0000981
Q9NP62 (UniProtKB)
IDA
GO:0001077
Q9NP62 (UniProtKB)
IDA
GO:0003677
Q9NP62 (UniProtKB)
TAS
GO:0003700
Q9NP62 (UniProtKB)
IDA
GO:0005515
Q9NP62 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q9NP62 (UniProtKB)
IDA
GO:0005667
Q9NP62 (UniProtKB)
IDA
GO:0006355
Q9NP62 (UniProtKB)
IDA
GO:0006366
Q9NP62 (UniProtKB)
IDA
GO:0008134
Q9NP62 (UniProtKB)
IPI
GO:0008270
Q9NP62 (UniProtKB)
IEA
GO:0009653
Q9NP62 (UniProtKB)
TAS
GO:0042826
Q9NP62 (UniProtKB)
IPI
GO:0045944
Q9NP62 (UniProtKB)
IDA
GO:0060018
Q9NP62 (UniProtKB)
IEA
GO:0060143
Q9NP62 (UniProtKB)
IEA
GO:0060670
Q9NP62 (UniProtKB)
IEA
GO:0060706
Q9NP62 (UniProtKB)
IEA

可能调控 GCM1基因的相关microRNA:     

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Pre-Eclampsia 0.0054487 2 0 LHGDN
Placenta Disorders 0.00272435 1 0 LHGDN
Cardiovascular Diseases 0.002367032 1 1 GAD
IGA Glomerulonephritis 0.002367032 1 0 GAD
Alzheimer's Disease 0.002367032 1 0 GAD
Eclampsia 0.000814326 3 0 BeFree
Hypertensive disease 0.000271442 1 0 BeFree
Hyperparathyroidism, Primary 0.000271442 1 0 BeFree
Virus Diseases 0.000271442 1 0 BeFree
Choriocarcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

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