GBP5 (guanylate binding protein 5)

symbol:
GBP5
locus group:
protein-coding gene
location:
1p22.2
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
None
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115362
ensembl gene id:
ENSG00000154451
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uc057iek.1
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NM_052942
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HGNC:19895
approved reserved:
2003-11-21
1p22.2
基因染色体位置图

GBP5(鸟苷酸结合蛋白5)属于干扰素诱导的鸟苷酸结合蛋白(GBP)家族,该家族成员具有GTP酶活性,参与先天免疫反应,特别是抗病毒和抗菌防御。GBP5主要定位于细胞质和细胞膜,通过与病原体膜结合或形成蛋白复合物来限制病原体复制。其生物学功能包括激活炎症小体、促进细胞焦亡(pyroptosis)以及干扰病原体生命周期。GBP家族共性在于含有保守的GTP结合结构域,能水解GTP产生能量,介导宿主防御反应。突变或表达异常可能导致免疫失调:GBP5功能丧失突变会削弱对细菌(如沙门氏菌)和病毒(如流感病毒)的清除能力,而过度表达可能引发过度炎症反应,与自身免疫疾病(如类风湿性关节炎)相关。研究显示GBP5在结核病中通过调控IL-1β分泌影响疾病进程,其表达水平与HIV感染者的疾病进展速度相关。此外,GBP5在多种癌症(如胶质瘤、乳腺癌)中异常表达,可能通过调节肿瘤微环境或细胞凋亡途径影响肿瘤发展。该基因的表达受干扰素-γ强烈诱导,因此与Th1型免疫应答密切相关。家族其他成员如GBP1和GBP2也参与类似免疫调控,但各自具有病原体特异性或信号通路偏好性。

None

GBP5基因的碱基序列:[NCBI]
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GBP5基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs519086       rs519909       rs535351       rs547544       rs553113       rs565577       rs588854       rs667942       rs670164       rs1061953       rs2147309       rs2147310       rs3795542       rs3806336       rs3806337       rs3806338       rs3806339      

GBP5基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AATACTGTGAACAGGCTGC
58
GTTATTAACAGTCCTCTGGGC
59
CAAGATCTTGTGGCTCTCAG
58
AGCCTGTTCTAAGAGGTGG
59
GGAGATGTAGAGAAGGCTGAC
60
GTACACAAAGGTGCTGCTC
59
CAACAGATGCAGGAACAGG
59
TATTAACAGTCCTCTGGGCG
59
AAATAGATGGGCAACTTGTCAC
59
GAACTCTTTGATCACTACCTTGC
60
AAAGAAGAAAGAGGCACAAGTG
60
CTCGTTCTGCCTTTGAATCG
60
AGATCTTGTGGCTCTCAGC
60
GCAGCCTGTTCTAAGAGGT
59
CAATGGATCTCGTCTAAAGAACC
59
GCATTCTCTATGCAAGGCAG
60
CAACAGATGCAGGAACAGG
59
ATTAACAGTCCTCTGGGCG
60
ACTCTTACTGAGCAGCACC
59
GTCACATTGTGCAGTAGGTC
59
      尚未收录相关数据

GBP5基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

GBP5基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003924
E7ETN8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005525
E7ETN8 (UniProtKB)
IEA
GO:0000139
Q96PP8 (UniProtKB)
IEA
GO:0003924
Q96PP8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q96PP8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005525
Q96PP8 (UniProtKB)
IEA
GO:0006954
Q96PP8 (UniProtKB)
IEA
GO:0016020
Q96PP8 (UniProtKB)
IDA
GO:0031410
Q96PP8 (UniProtKB)
IEA
GO:0042802
Q96PP8 (UniProtKB)
IPI
GO:0042802
Q96PP8 (UniProtKB)
IPI
GO:0045089
Q96PP8 (UniProtKB)
ISS
GO:0050702
Q96PP8 (UniProtKB)
IMP
GO:0051289
Q96PP8 (UniProtKB)
IDA
GO:0071346
Q96PP8 (UniProtKB)
IEA
GO:0072616
Q96PP8 (UniProtKB)
ISS
GO:1900017
Q96PP8 (UniProtKB)
ISS
GO:1900227
Q96PP8 (UniProtKB)
IDA

可能调控 GBP5基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
melanoma 0.00272435 1 0 LHGDN
Epstein-Barr Virus Infections 0.00272435 1 0 LHGDN
Heart Diseases 0.002367032 1 1 GAD

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