GALNT2 (polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2)

symbol:
GALNT2
locus group:
protein-coding gene
location:
1q42.13
gene_family:
Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferases
alias symbol:
GalNAc-T2
alias name:
polypeptide GalNAc transferase 2
entrez id:
2590
ensembl gene id:
ENSG00000143641
ucsc gene id:
uc010pwa.2
refseq accession:
NM_004481
hgnc_id:
HGNC:4124
approved reserved:
1996-10-26
1q42.13
基因染色体位置图

GALNT2(多肽N-乙酰氨基半乳糖转移酶2)属于GALNT基因家族,该家族由20个成员组成,主要负责蛋白质的O-糖基化修饰。GALNT家族成员通过将N-乙酰氨基半乳糖(GalNAc)转移到蛋白质的丝氨酸或苏氨酸残基上,启动O-糖基化过程,这一修饰对蛋白质的稳定性、细胞间通讯和信号传导至关重要。GALNT2主要在肝脏、肾脏和肠道中高表达,其编码的酶参与多种生理过程,包括脂质代谢、炎症反应和细胞粘附。GALNT2通过糖基化修饰脂蛋白(如HDL和LDL)影响脂质代谢,研究表明其功能异常与动脉粥样硬化和心血管疾病风险相关。GALNT2突变可能导致酶活性降低,从而减少对载脂蛋白(如ApoC-III和ApoB)的糖基化修饰,进而影响脂蛋白的清除和代谢效率,增加高甘油三酯血症的风险。此外,GALNT2的过表达可能通过增强特定蛋白的糖基化而改善脂质代谢,但过度激活也可能干扰其他糖基化酶的平衡,导致代谢紊乱。相反,GALNT2表达降低可能减少对有害脂蛋白的修饰,但同时也可能削弱HDL的功能,增加心血管疾病风险。GALNT2还与癌症相关,其表达水平在某些肿瘤(如肝癌和结肠癌)中异常,可能通过影响细胞粘附和转移相关蛋白的糖基化促进肿瘤进展。GALNT家族成员的共性是依赖UDP-GalNAc作为底物,并具有底物特异性,但不同成员的组织分布和功能存在差异。GALNT2作为该家族的重要成员,其功能研究为代谢性疾病和癌症的机制探索提供了潜在靶点。

This gene encodes a member of the glycosyltransferase 2 protein family. Members of this family initiate mucin-type O-glycoslation of peptides in the Golgi apparatus. The encoded protein may be involved in O-linked glycosylation of the immunoglobulin A1 hinge region. This gene may influence triglyceride levels, and may be involved Type 2 diabetes, as well as several types of cancer. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, May 2014]

该基因编码糖基转移酶2蛋白家族的一个成员。这个家庭的成员发起高尔基体肽的粘蛋白型O型glycoslation。所编码的蛋白质可能参与了免疫球蛋白A 1铰链区的O-连接的糖基化。该基因可能影响甘油三酯水平,并可能涉及2型糖尿病,以及几种类型的癌症。选择性剪接结果在多个抄本变形。 [由RefSeq的,2014年5月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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GALNT2基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs7022       rs10005       rs11620       rs13490       rs13728       rs15273       rs549696       rs582233       rs584751       rs585361       rs586712       rs590820       rs598203       rs598965       rs600845       rs604769       rs606587      

GALNT2基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TCGCCTACTACATGTACTCG
58
CAGAGTCTGGAGCTTCCTG
59
TTTCTTTCTAGAAACACCCGC
58
CTCCAATCTGCTCTGAATATTTCC
59
AATATTCAGAGCAGATTGGAGC
58
TCTGGAACCCTTAACTCTGG
58
GAGGACTGGAATGAAATTGACC
59
GTACTTTCCCTGGAGGGAG
58
CGCCTACTACATGTACTCGG
59
CAGAGTCTGGAGCTTCCTG
59
AGGACTGGAATGAAATTGACC
58
GTACTTTCCCTGGAGGGAG
58
TTCTTTCTAGAAACACCCGC
58
CCAATCTGCTCTGAATATTTCC
57
ATATTCAGAGCAGATTGGAGCT
59
TCTGGAACCCTTAACTCTGG
58
ATATTCAGAGCAGATTGGAGC
58
TCTGGAACCCTTAACTCTGG
58
GCCTACTACATGTACTCGGG
59
CAGAGTCTGGAGCTTCCTG
59
      尚未收录相关数据

GALNT2基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

GALNT2基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000139
Q10471 (UniProtKB)
TAS
GO:0000139
Q10471 (UniProtKB)
TAS
GO:0000139
Q10471 (UniProtKB)
TAS
GO:0000139
Q10471 (UniProtKB)
TAS
GO:0002378
Q10471 (UniProtKB)
IDA
GO:0004653
Q10471 (UniProtKB)
IDA
GO:0004653
Q10471 (UniProtKB)
IDA
GO:0004653
Q10471 (UniProtKB)
IDA
GO:0004653
Q10471 (UniProtKB)
IDA
GO:0004653
Q10471 (UniProtKB)
IDA
GO:0004653
Q10471 (UniProtKB)
TAS
GO:0005515
Q10471 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q10471 (UniProtKB)
IPI
GO:0005789
Q10471 (UniProtKB)
TAS
GO:0005794
Q10471 (UniProtKB)
IDA
GO:0005794
Q10471 (UniProtKB)
IDA
GO:0005795
Q10471 (UniProtKB)
IDA
GO:0006493
Q10471 (UniProtKB)
IDA
GO:0006493
Q10471 (UniProtKB)
IDA
GO:0016020
Q10471 (UniProtKB)
IDA
GO:0016266
Q10471 (UniProtKB)
IDA
GO:0016266
Q10471 (UniProtKB)
TAS
GO:0018242
Q10471 (UniProtKB)
IDA
GO:0018242
Q10471 (UniProtKB)
IDA
GO:0018243
Q10471 (UniProtKB)
IDA
GO:0018243
Q10471 (UniProtKB)
IDA
GO:0018243
Q10471 (UniProtKB)
IDA
GO:0030145
Q10471 (UniProtKB)
IDA
GO:0030145
Q10471 (UniProtKB)
IDA
GO:0030173
Q10471 (UniProtKB)
NAS
GO:0030246
Q10471 (UniProtKB)
IEA
GO:0032580
Q10471 (UniProtKB)
IEA
GO:0048471
Q10471 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
Q10471 (UniProtKB)
IDA
GO:0005794
Q10471 (UniProtKB)
IDA

可能调控 GALNT2基因的相关microRNA:     

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Metabolic Syndrome X 0.122367032 1 1 GAD_GWASCAT
Hypertriglyceridemia 0.004734064 2 0 GAD
Hypertriglyceridemia result 0.004734064 2 0 GAD
Cerebrovascular accident 0.002638474 1 3 BeFree_GAD
Coronary Artery Disease 0.002638474 2 1 BeFree_GAD
Diabetes Mellitus, Non-Insulin-Dependent 0.002638474 2 0 BeFree_GAD
Lipid Metabolism Disorders 0.002367032 1 0 GAD
Dyslipidemias 0.002367032 1 0 GAD
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Brain Ischemia 0.002367032 1 0 GAD

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

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