GACAT3 (gastric cancer associated transcript 3)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
GACAT3
locus group:
non-coding RNA
location:
2p24.3
gene_family:
Long non-coding RNAs (published)
alias symbol:
lncRNA-AC130710
alias name:
None
entrez id:
104797537
ensembl gene id:
ENSG00000236289
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_126559
hgnc_id:
HGNC:50847
approved reserved:
2014-06-25

基因染色体位置

基因染色体位置

2p24.3
基因染色体位置图

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

GACAT3基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs934058       rs934059       rs1365970       rs1365971       rs1365972       rs1427682       rs1984431       rs2007559       rs2114797       rs4073262       rs4073263       rs4499395       rs4669034       rs4669035       rs6431753       rs6431754       rs6431755      

基因表达

基因表达

GACAT3基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CAGGAGGATAATAGCCAGC
57
ATGAGTTGATGGTTTCTAGGG
58
CAGGTGGAAGGTCTTAAGAG
57
AGCTGAAATTGAATCCACCT
58
TCAGGTGGAAGGTCTTAAGAG
59
CTGAAATTGAATCCACCTTTGG
58
GAGGATAATAGCCAGCTCCTG
60
GTCATGAGTTGATGGTTTCTAGG
59
GCAGGAGGATAATAGCCAG
57
TGAGTTGATGGTTTCTAGGG
57
CAGGTGGAAGGTCTTAAGAG
57
CTGAAATTGAATCCACCTTTGG
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

GACAT3基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

GACAT3基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 GACAT3基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malignant neoplasm of stomach 0.000271442 1 0 BeFree
Stomach Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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