FUBP1 (far upstream element binding protein 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
FUBP1
locus group:
protein-coding gene
location:
1p31.1
gene_family:
alias symbol:
FBP
alias name:
FUSE binding protein 1
entrez id:
8880
ensembl gene id:
ENSG00000162613
ucsc gene id:
uc001dii.4
refseq accession:
NM_003902
hgnc_id:
HGNC:4004
approved reserved:
1999-01-06

基因染色体位置

基因染色体位置

1p31.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

FUBP1（Far Upstream Element Binding Protein 1）是一种重要的DNA/RNA结合蛋白，属于FUBP家族，该家族成员通常含有高度保守的KH（K homology）结构域，能够识别并结合特定的核酸序列以调控基因表达。FUBP1的主要功能是作为转录调控因子，通过结合靶基因启动子或增强子区域的富嘧啶序列（如FUSE元件）来激活或抑制转录，参与细胞增殖、分化、凋亡和DNA损伤修复等过程。FUBP1在多种组织中广泛表达，尤其在快速增殖的细胞（如干细胞和癌细胞）中表达较高。FUBP1的突变或异常表达与多种疾病相关，特别是癌症。例如，FUBP1的失活突变可能导致其抑癌功能丧失，促进肿瘤发生，尤其在少突胶质细胞瘤和肝细胞癌中常见。相反，FUBP1的过表达可能通过激活原癌基因（如MYC）或抑制凋亡通路，促进肿瘤细胞存活和增殖。此外，FUBP1还参与RNA代谢，影响mRNA的稳定性、剪接和翻译，从而间接调控其他基因的表达。在神经系统中，FUBP1功能异常可能与神经退行性疾病相关。FUBP家族成员（如FUBP3）也具有类似的核酸结合特性，但组织分布和靶基因可能不同。研究FUBP1的调控机制及其在疾病中的作用，有助于开发新的治疗策略，例如通过靶向FUBP1或其下游通路来抑制肿瘤生长。

None

无

OMIM数据库中对FUBP1基因的介绍     Wikipedia数据库中对FUBP1基因的介绍

基因序列

基因序列

FUBP1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

FUBP1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1325513       rs6657869       rs7545216       rs7548467       rs12401738       rs17101109       rs17101112       rs34128192       rs34954138       rs35083316       rs56884644       rs61729829       rs71244403       rs71590707       rs72685368       rs72933882       rs76576474      

基因表达

基因表达

FUBP1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CAAACTAATGGACAAGGAGATCAG
60
TGTAGTACTCTTCCCAAGCC
59
AAAGCACCAGAAACTACCC
58
TTACCTCAAGTCCAAGCTG
57
AATGTAGAAGAAACTACCCGTG
58
ATCTCCCTAAGACACTGTTCC
59
GAGTATTATAGACAACAAGCAGCC
60
AGCATCTTCAGCACTGAGG
60
ATACCAAGGCTTGGGAAGAG
60
TAATCTGGCTGACCACCTG
59
AATGTAGAAGAAACTACCCGTG
58
ATCTCCCTAAGACACTGTTCC
59
ACAACAAGCAGCCTATTATGC
59
TGGCTGGATCAAACCTGAG
60
AATGTAGAAGAAACTACCCGTG
58
ATCTCCCTAAGACACTGTTCC
59
CAAACTAATGGACAAGGAGATCAG
59
TGTAGTACTCTTCCCAAGCC
58
AATGTAGAAGAAACTACCCGTG
58
ATCTCCCTAAGACACTGTTCC
59

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
FUBP1
CDKN1A
Unknown
24117486
FUBP1
MYC
Unknown
11239393; 18193062; 24117486

基因本体信息

FUBP1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

FUBP1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003723
C9JSZ1 (UniProtKB)
IEA
GO:0005654
C9JSZ1 (UniProtKB)
IDA
GO:0003723
E9PEB5 (UniProtKB)
IEA
GO:0005654
E9PEB5 (UniProtKB)
IDA
GO:0003697
Q96AE4 (UniProtKB)
TAS
GO:0003700
Q96AE4 (UniProtKB)
TAS
GO:0005515
Q96AE4 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q96AE4 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q96AE4 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q96AE4 (UniProtKB)
IDA
GO:0005654
Q96AE4 (UniProtKB)
IDA
GO:0006355
Q96AE4 (UniProtKB)
IEA
GO:0006366
Q96AE4 (UniProtKB)
TAS
GO:0010628
Q96AE4 (UniProtKB)
IDA
GO:0044822
Q96AE4 (UniProtKB)
IDA
GO:0044822
Q96AE4 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 FUBP1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Liver carcinoma 0.003267234 3 0 BeFree_LHGDN
Schizophrenia 0.00272435 1 0 LHGDN
Parkinson Disease 0.00272435 1 0 LHGDN
Well Differentiated Oligodendroglioma 0.002171535 8 0 BeFree
oligodendroglioma 0.002171535 8 0 BeFree
Anaplastic Oligodendroglioma 0.001628651 6 0 BeFree
Glioma 0.000814326 3 0 BeFree
Astrocytoma 0.000814326 3 0 BeFree
Oligodendroglioma, Childhood 0.000271442 1 0 BeFree
Colorectal Cancer 0.000271442 1 0 BeFree

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基因相关服务

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