FRAT1 (FRAT regulator of WNT signaling pathway 1)

基因基本信息

基因基本信息

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FRAT1
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protein-coding gene
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10q24.1
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None
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10023
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HGNC:3944
approved reserved:
2000-04-13

基因染色体位置

基因染色体位置

10q24.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

FRAT1（Frequently Rearranged in Advanced T-cell lymphomas 1）是一个在多种生物学过程中起关键作用的基因，属于FRAT基因家族。该家族成员（包括FRAT1和FRAT2）的共同特点是编码的蛋白质能够调节Wnt/β-catenin信号通路，这是细胞增殖、分化和发育中至关重要的通路。FRAT1蛋白通过与GSK-3β（糖原合成酶激酶3β）相互作用，阻止其磷酸化β-catenin，从而稳定β-catenin并促进其核转位，激活下游靶基因的转录。FRAT1在胚胎发育、细胞命运决定和干细胞自我更新中发挥重要作用。FRAT1的突变或异常表达可能对机体产生显著影响。例如，FRAT1的过表达可能导致Wnt/β-catenin信号通路的持续激活，这与多种癌症（如结直肠癌、肝癌和T细胞淋巴瘤）的发生和发展密切相关。过表达还可能促进细胞增殖、抑制凋亡，并增强肿瘤细胞的侵袭和转移能力。相反，FRAT1表达降低可能导致Wnt/β-catenin信号通路活性下降，影响正常细胞增殖和组织再生，甚至可能导致发育缺陷。FRAT1在T细胞淋巴瘤中经常发生重排，这表明它在淋巴瘤的发生中可能起重要作用。此外，FRAT1的异常表达还与神经退行性疾病和某些代谢紊乱有关。FRAT1基因家族成员在结构上具有高度保守性，特别是在与GSK-3β结合的区域。FRAT1和FRAT2在功能上有一定的冗余性，但FRAT1在多数组织中表达更广泛，且在癌症中的作用更为突出。研究FRAT1不仅有助于理解Wnt信号通路的调控机制，还可能为相关疾病的治疗提供新的靶点。

None

无

OMIM数据库中对FRAT1基因的介绍     Wikipedia数据库中对FRAT1基因的介绍

基因序列

基因序列

FRAT1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

FRAT1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1334891       rs1334892       rs1932002       rs3740512       rs3740513       rs3740514       rs3758583       rs3781373       rs3824786       rs3832695       rs3832696       rs7070246       rs11189126       rs11189127       rs11189129       rs35717991       rs61746141      

基因表达

基因表达

FRAT1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ACAGAGTAGCCAGGTTCTG
59
ATGAACAAGCCATTGACGA
58
GAAACCTCATCAAGGAGGC
58
GAAGCTTTGCACGTAACTG
58
GACAGAGTAGCCAGGTTCTG
60
AACAAGCCATTGACGAAGC
60
GAAACCTCATCAAGGAGGC
58
AAGCTTTGCACGTAACTGC
60
AAACCTCATCAAGGAGGCC
60
AAGCTTTGCACGTAACTGC
60
ACAGAGTAGCCAGGTTCTG
59
AACAAGCCATTGACGAAGC
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

FRAT1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

FRAT1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005829
Q92837 (UniProtKB)
TAS
GO:1904886
Q92837 (UniProtKB)
TAS

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 FRAT1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Esophageal Neoplasms 0.002995792 2 0 BeFree_LHGDN
Adenocarcinoma 0.002995792 1 0 BeFree_LHGDN
Carcinogenesis 0.001357209 5 0 BeFree
Malignant tumor of cervix 0.000542884 2 0 BeFree
Glioma 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of stomach 0.000542884 2 0 BeFree
Non-Small Cell Lung Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Stomach Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Carcinoma of lung 0.000542884 2 0 BeFree
Secondary malignant neoplasm of lymph node 0.000542884 2 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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