FN1 (fibronectin 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
FN1
locus group:
protein-coding gene
location:
2q35
gene_family:
Endogenous ligands|Fibronectin type III domain containing
alias symbol:
MSF|CIG|LETS|GFND2|FINC|lnc-ABCA12-8
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migration-stimulating factor|cold-…
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2335
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ENSG00000115414
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uc002vfa.4
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NM_212476
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HGNC:3778
approved reserved:
2001-06-22

基因染色体位置

基因染色体位置

2q35
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

FN1基因编码纤维连接蛋白（Fibronectin），这是一种重要的细胞外基质糖蛋白，在细胞粘附、迁移、伤口修复、胚胎发育和凝血等过程中发挥关键作用。纤维连接蛋白由两个相似的亚基通过二硫键连接而成，含有多个功能域，可与胶原、肝素、纤维蛋白和整合素等分子结合，介导细胞与基质的相互作用。FN1主要在肝脏合成后分泌到血浆中，也可由成纤维细胞、内皮细胞和巨噬细胞等局部产生。FN1基因突变可能导致纤维连接蛋白功能异常，与多种疾病相关，如肾小球疾病（由于纤维连接蛋白在肾小球基底膜沉积）、纤维化疾病和某些癌症（通过促进肿瘤细胞迁移和侵袭）。FN1过表达常见于多种肿瘤，与肿瘤转移和不良预后相关，因其能增强肿瘤细胞粘附、迁移和侵袭能力；而FN1表达降低可能影响胚胎发育（导致心血管或骨骼畸形）或伤口愈合延迟。FN1属于纤维连接蛋白基因家族，该家族成员具有相似的结构特征（如III型重复序列）和功能（参与细胞-基质相互作用和组织修复）。纤维连接蛋白还通过调节TGF-β等生长因子的活性影响组织纤维化进程。在炎症反应中，FN1通过调控白细胞迁移参与免疫应答。此外，FN1的可变剪接产生多种亚型，具有组织特异性分布和功能差异。

None

无

OMIM数据库中对FN1基因的介绍     Wikipedia数据库中对FN1基因的介绍

基因序列

基因序列

FN1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

FN1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1263       rs1264       rs6782       rs11651       rs13652       rs724617       rs940738       rs940739       rs940740       rs1053238       rs1058361       rs1063272       rs1132741       rs1250201       rs1250203       rs1250204       rs1250207      

基因表达

基因表达

FN1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GTATGTGGTTAGTGTCTATGCT
58
CGATCAATGTTGGTTACTGC
58
AATGGCCAGATGATGAGCT
59
ATAACACGTTGCCTCATGAG
58
CCGAACAGAAATTGACAAACC
58
GTTACTCTGTAACCAGTAACAGG
59
GACCAATGCCAGGATTCAG
58
CCACTTGAGCTTGGATAGGT
59
CGAATGTAGGACAAGAAGCTC
59
TTCATCAGTGCCAACAGGA
59
GGTTCAGACTGCAGTAACC
58
TTAGGGCGATCAATGTTATGG
58
CGAATGTAGGACAAGAAGCTC
59
TTCATCAGTGCCAACAGGA
59
CCTTACAGTTCAGGGTTCCT
59
ACTATGACGTTGTAGGTGGC
59
AATGGCCAGATGATGAGCT
59
ATAACACGTTGCCTCATGAG
58
CAACAAACGGCTGTTCCTC
60
GACAACTCTGCAACATCTTCC
60

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
AR
FN1
Unknown
21055159
ATF2
FN1
Unknown
10471826
CEBPA
FN1
Unknown
1320003
EGR1
FN1
Activation
15608673; 9933644
EGR1
FN1
Unknown
10783396
KLF8
FN1
Repression
20728449
NFKB1
FN1
Activation
10649441; 10867646
NFKB1
FN1
Unknown
22223884
PARP1
FN1
Unknown
22223884
RELA
FN1
Activation
10649441; 10867646

基因本体信息

FN1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

FN1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005576
H0Y7Z1 (UniProtKB)
IEA
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P02751 (UniProtKB)
IEA
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P02751 (UniProtKB)
IEA
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IDA
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IPI
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IPI
GO:0002020
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IEA
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IDA
GO:0005178
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IEA
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IDA
GO:0031012
P02751 (UniProtKB)
ISS

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 FN1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
GLOMERULOPATHY WITH FIBRONECTIN DEPOSITS 2 (disorder) 0.240814326 4 3 BeFree_CLINVAR_UNIPROT
Mammary Neoplasms 0.123810118 6 0 BeFree_CTD_human_LHGDN
Diabetes Mellitus 0.123528744 14 0 BeFree_CTD_human
Crohn Disease 0.122995792 2 0 BeFree_CTD_human_LHGDN
Glioblastoma 0.121628651 7 0 BeFree_CTD_human
Hypertensive disease 0.120542884 4 0 BeFree_CTD_human
Aortic Valve Insufficiency 0.120271442 2 0 BeFree_CTD_human
Glomerulopathy with fibronectin deposits 0.12 0 0 CTD_human
Mammary Neoplasms, Experimental 0.12 1 0 CTD_human
Focal glomerulosclerosis 0.12 1 0 CTD_human

基因相关服务

基因相关服务

联系方式

山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话： 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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