FLG (filaggrin)

symbol:
FLG
locus group:
protein-coding gene
location:
1q21.3
gene_family:
EF-hand domain containing
alias symbol:
FLG1|FLG-1
alias name:
None
entrez id:
2312
ensembl gene id:
ENSG00000143631
ucsc gene id:
uc001ezu.1
refseq accession:
NM_002016
hgnc_id:
HGNC:3748
approved reserved:
1989-10-18
1q21.3
基因染色体位置图

FLG(filaggrin)基因编码丝聚蛋白,这是一种在皮肤屏障功能中起关键作用的蛋白质。FLG主要在表皮颗粒层表达,其前体蛋白profilaggrin被加工成多个丝聚蛋白单体,这些单体进一步分解为天然保湿因子(NMF),如尿刊酸和吡咯烷酮羧酸,帮助维持皮肤水合作用。FLG的主要作用位点是表皮角质层,它通过聚集角蛋白中间丝促进角质细胞扁平化,形成紧密的皮肤屏障以防止水分流失和外界病原体入侵。FLG基因突变会显著影响其功能,最常见的是功能丧失性突变,导致丝聚蛋白表达减少或缺失。这种突变与多种疾病密切相关,尤其是特应性皮炎(湿疹),约50%的中重度特应性皮炎患者携带FLG突变。FLG突变还增加患鱼鳞病(特别是寻常型鱼鳞病)、过敏性鼻炎、哮喘和食物过敏的风险,因为皮肤屏障缺陷使过敏原更易穿透。FLG属于S100融合蛋白家族(SFTP),该家族成员通常具有钙结合域和参与表皮分化及屏障形成的功能。FLG过表达的情况罕见,但理论上可能过度强化皮肤屏障;而降低表达或功能缺失则直接损害皮肤屏障,导致经皮水分丢失增加、pH值改变和微生物定植易感性升高。FLG表达下降还会影响下游炎症通路,如胸腺基质淋巴细胞生成素(TSLP)增加,促进Th2型免疫反应。此外,FLG缺陷可能间接影响其他表皮分化复合体(EDC)基因(如loricrin和involucrin)的表达模式。由于FLG突变的外显率不完全,环境因素(如湿度、洗涤频率)和修饰基因也影响其表型严重程度。

None

FLG基因的碱基序列:[NCBI]
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FLG基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1858479       rs2011331       rs2485517       rs2485518       rs2786682       rs2786683       rs2855072       rs2855077       rs3120651       rs3120652       rs3120653       rs3120654       rs3120655       rs3120656       rs3120657       rs3120658       rs3120659      

FLG基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AATCCTGAAGAATCCAGATGAC
58
TCAGAAGAAACTCAGTGAAGTC
58
TCCTGAAGAATCCAGATGACC
59
CATCAGAAGAAACTCAGTGAAGTC
60
ATCCTGAAGAATCCAGATGAC
57
TCAGAAGAAACTCAGTGAAGTC
58
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
HOPX
FLG
Activation

FLG基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

FLG基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005198
P20930 (UniProtKB)
NAS
GO:0005509
P20930 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
P20930 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
P20930 (UniProtKB)
IDA
GO:0005882
P20930 (UniProtKB)
NAS
GO:0007275
P20930 (UniProtKB)
NAS
GO:0030216
P20930 (UniProtKB)
TAS
GO:0036457
P20930 (UniProtKB)
IDA
GO:0036457
P20930 (UniProtKB)
IDA
GO:0043231
P20930 (UniProtKB)
IDA
GO:0061436
P20930 (UniProtKB)
IEP

可能调控 FLG基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Ichthyosis Vulgaris 0.272841923 57 4 BeFree_CLINVAR_CTD_human_GAD_LHGDN
Dermatitis, Atopic 0.26434821 183 7 BeFree_CTD_human_GAD_LHGDN
Dermatitis, Atopic, 2 0.24 0 1 CLINVAR_CTD_human
Eczema 0.204894088 180 7 BeFree_CTD_human_GAD_LHGDN
Contact Dermatitis 0.120271442 2 0 BeFree_CTD_human
Dermatitis, Atopic, 1 0.12 0 0 CTD_human
Asthma 0.061166481 41 1 BeFree_GAD_LHGDN
Hay fever 0.010011012 5 0 BeFree_GAD
Immediate hypersensitivity 0.009468128 4 0 GAD
Dermatitis, Allergic Contact 0.007915422 5 0 BeFree_GAD

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