FKBP1A-SDCBP2 (FKBP1A-SDCBP2 readthrough (NMD candidate))

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FKBP1A-SDCBP2
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20p13
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HGNC:41997
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2011-05-31
20p13
基因染色体位置图

FKBP1A-SDCBP2是一个融合基因,由FKBP1A(FK506结合蛋白1A)和SDCBP2(多配体聚糖结合蛋白2)两个基因的部分序列融合而成。FKBP1A属于免疫亲和素家族,编码一种肽基脯氨酰异构酶,参与蛋白质折叠和信号转导,尤其在免疫抑制和神经保护中发挥作用。SDCBP2编码的蛋白是一种跨膜蛋白,参与细胞粘附和信号传导,与肿瘤发生和转移相关。当这两个基因发生融合时,可能会产生一种异常的嵌合蛋白,影响细胞内的信号通路和蛋白质相互作用。FKBP1A-SDCBP2融合基因的突变或异常表达可能导致细胞增殖失控或凋亡受阻,与某些癌症的发生和发展相关。如果该融合基因过表达,可能会增强肿瘤细胞的侵袭性和转移能力,而降低表达则可能抑制这些恶性表型。FKBP1A属于FKBP基因家族,该家族成员通常具有肽基脯氨酰异构酶活性,参与蛋白质折叠和信号转导。SDCBP2属于SDCBP基因家族,其成员多与细胞粘附和信号传导有关。这两个基因家族的共性在于它们都参与重要的细胞过程,如信号转导和细胞间相互作用。研究FKBP1A-SDCBP2融合基因有助于理解其在肿瘤发生中的作用,并为相关癌症的诊断和治疗提供潜在靶点。

This locus represents naturally occurring read-through transcription between the neighboring FK506 binding protein 1A, 12kDa and syndecan binding protein (syntenin) 2 genes on chromosome 20. The read-through transcript is a candidate for nonsense-mediated mRNA decay (NMD), and is unlikely to produce a protein product. [provided by RefSeq, Dec 2010]

这一位点代表自然发生的周边FK506结合蛋白1A,12kDa和聚糖结合蛋白(syntenin)2基因位于染色体20之间通读转录的通读成绩单是无义介导的mRNA降解的候选人( NMD),并且不可能产生的蛋白质产物。 [由RefSeq的,2010年12月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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FKBP1A-SDCBP2基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs7466       rs8392       rs11449       rs11712       rs376197       rs395071       rs396721       rs733232       rs733233       rs747611       rs751523       rs751524       rs751525       rs754363       rs912111       rs912112       rs912113      

FKBP1A-SDCBP2基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
      尚未收录相关数据

FKBP1A-SDCBP2基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

FKBP1A-SDCBP2基因的本体(GO)信息:

可能调控 FKBP1A-SDCBP2基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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