FICD (FIC domain protein adenylyltransferase)

symbol:
FICD
locus group:
protein-coding gene
location:
12q23.3
gene_family:
alias symbol:
HYPE|HIP13
alias name:
huntingtin interacting protein 13|…
entrez id:
11153
ensembl gene id:
ENSG00000198855
ucsc gene id:
uc001tmx.2
refseq accession:
NM_007076
hgnc_id:
HGNC:18416
approved reserved:
2007-12-04
12q23.3
基因染色体位置图

FICD(FIC domain containing)基因编码一种参与蛋白质修饰的酶,属于FIC蛋白家族。该家族的特征是含有FIC(Filamentation induced by cAMP)结构域,其成员通常具有腺苷酸转移酶活性,能够通过腺苷酸化(AMPylation)修饰靶蛋白,从而调控其功能。FICD的主要作用位点是内质网,它通过腺苷酸化修饰分子伴侣BiP(也称为GRP78或HSPA5),这是一种关键的内质网应激反应蛋白。FICD对BiP的修饰可调节其活性,影响蛋白质折叠、内质网稳态以及未折叠蛋白反应(UPR)。FICD的突变可能导致其酶活性异常,进而破坏BiP的功能,影响内质网应激反应,与神经退行性疾病、代谢紊乱和癌症等疾病相关。FICD过表达可能导致BiP过度腺苷酸化,抑制其分子伴侣功能,引发内质网应激和细胞凋亡;而FICD表达降低可能减弱对BiP的调控,导致未折叠蛋白反应失调,影响细胞存活。FICD基因属于FIC蛋白家族,该家族成员广泛存在于原核和真核生物中,其共性是具有保守的FIC结构域,能够通过腺苷酸化或磷酸化等翻译后修饰调控靶蛋白功能,参与细胞信号传导、应激反应和病原体-宿主相互作用等过程。

None

FICD基因的碱基序列:[NCBI]
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FICD基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1047974       rs2288380       rs2288381       rs2303634       rs7969198       rs7977789       rs10746125       rs11113965       rs11113966       rs11113967       rs11113968       rs11113969       rs11113970       rs11113971       rs11113972       rs11830142       rs28369348      

FICD基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTCTCCAGAAAGCAGGAGG
59
GGTATGCAGTCACTATCCGT
59
GTGCTGTACCTGAACACCT
59
TCATGCCTCGAATCATGGT
59
GACTGAACCGAAATGGGTC
58
TCTGGCTTCCAACTTACCC
59
GCCTCTCCAGGTAAGACAG
59
GTCTGTCTATCCAGTTAACAAGC
59
CTGTACCTGAACACCTATAGG
57
GTCATGCCTCGAATCATGG
58
CTGAACCGAAATGGGTCTC
58
CTCTGGCTTCCAACTTACC
57
CAGACATAGAATGTGTCATGTCC
59
GGCTGACTTGTTCACAATACC
59
CCTCTCCAGAAAGCAGGAG
59
TGCAGTCACTATCCGTGTG
59
CTCTCCAGAAAGCAGGAGG
59
TGCAGTCACTATCCGTGTG
59
CTGAACCGAAATGGGTCTC
58
TCTGGCTTCCAACTTACCC
59
      尚未收录相关数据

FICD基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

FICD基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005524
Q9BVA6 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
Q9BVA6 (UniProtKB)
IEA
GO:0018117
Q9BVA6 (UniProtKB)
IDA
GO:0034260
Q9BVA6 (UniProtKB)
TAS
GO:0070733
Q9BVA6 (UniProtKB)
IDA
GO:0070733
Q9BVA6 (UniProtKB)
IDA

可能调控 FICD基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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