FAP (fibroblast activation protein alpha)

symbol:
FAP
locus group:
protein-coding gene
location:
2q24.2
gene_family:
alias symbol:
DPPIV
alias name:
seprase
entrez id:
2191
ensembl gene id:
ENSG00000078098
ucsc gene id:
uc002ucd.3
refseq accession:
NM_001291807
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HGNC:3590
approved reserved:
1995-03-28
2q24.2
基因染色体位置图

FAP(Fibroblast Activation Protein)是一种属于II型跨膜丝氨酸蛋白酶的基因,其编码的蛋白质在成纤维细胞活化过程中发挥重要作用。FAP基因位于人类染色体2q23.3,属于脯氨酸特异性肽酶家族(S9B亚家族),与二肽基肽酶-4(DPP4)具有相似的结构和酶活性。FAP蛋白的主要功能是通过其内肽酶和外肽酶活性参与细胞外基质(ECM)的降解和重塑,在组织修复、伤口愈合和炎症反应中起关键作用。FAP通常在活化的成纤维细胞中高表达,特别是在肿瘤相关成纤维细胞(CAFs)中显著上调,与肿瘤微环境的形成和癌症进展密切相关。FAP的突变可能导致其酶活性异常,影响ECM的动态平衡,进而促进肿瘤侵袭和转移。研究表明,FAP过表达与多种癌症(如胰腺癌、乳腺癌、结肠癌)的恶性程度、预后不良和耐药性相关,其通过促进血管生成、免疫逃逸和转移来支持肿瘤生长。相反,FAP表达降低或抑制其活性可减少肿瘤生长和转移,改善治疗效果。此外,FAP还参与纤维化疾病(如肝纤维化、肺纤维化)的发病机制,其过表达会加剧纤维化进程。FAP基因家族的成员通常具有保守的催化三联体结构(Ser、Asp、His),并能切割含有脯氨酸或丙氨酸的肽键。由于FAP在肿瘤和纤维化中的重要作用,它已成为潜在的诊断标志物和治疗靶点,针对FAP的抑制剂和抗体药物正在开发中。

The protein encoded by this gene is a homodimeric integral membrane gelatinase belonging to the serine protease family. It is selectively expressed in reactive stromal fibroblasts of epithelial cancers, granulation tissue of healing wounds, and malignant cells of bone and soft tissue sarcomas. This protein is thought to be involved in the control of fibroblast growth or epithelial-mesenchymal interactions during development, tissue repair, and epithelial carcinogenesis. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Apr 2014]

由该基因编码的蛋白质是属于丝氨酸蛋白酶家族同源二聚体整合膜明胶。它是在上皮癌,伤口愈合的肉芽组织,骨的恶性细胞和软组织肉瘤的反应性基质成纤维细胞中选择性表达。这种蛋白质被认为是参与成纤维细胞生长或发育过程中的上皮 - 间充质相互作用,组织修复,和上皮致癌作用的控制。已发现该基因编码不同亚型选择性剪接转录变异体。 [由RefSeq的,2014年4月提供]

FAP基因的碱基序列:[NCBI]
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FAP基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs977907       rs980012       rs1030093       rs1042135       rs1468916       rs1978378       rs2075302       rs2268881       rs2268882       rs2268883       rs2284867       rs2300750       rs2300751       rs2300752       rs2302770       rs2389682       rs3216639      

FAP基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGATAGCACAAAGATGCCCA
60
TTCCTCTTTAGGCAGCTGG
59
CAAATTACAAGTGGCAAGTGG
58
AACAGTGAATCCTGTGTTACTC
58
GGTCCTATGGAGGATACGT
58
TAGACAGACGCGTAATATTCC
58
CTTGCATCTGGAACTGGTC
59
GTAGACAGACGCGTAATATTCC
59
AGAATTCAACTGTGATGGCA
58
AGTGCACATTATCCTGAGC
58
AGAATTCAACTGTGATGGCA
58
GAAAGTGCACATTATCATCTGC
59
GCTTCAAATTACGGCTTATCAC
59
CCTCTTACAAATTCTCCATTGC
58
GAACCATGCTTTGGAGATACTC
59
GACGAGGAAGCTCATTTCC
58
CCCTTCAAGAGTTCATAACTCTG
59
TTGTCCTGAAATCCAGTTTGG
59
CAGGAATACAGTTCTCTGCC
58
TAGTTGGAAGCTGAAGCCA
59
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
EGR1
FAP
Activation
EGR1
FAP
Repression

FAP基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

FAP基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0004252
A0A0D9SEN1 (UniProtKB)
IEA
GO:0006508
A0A0D9SEN1 (UniProtKB)
IEA
GO:0004252
B4DLR2 (UniProtKB)
IEA
GO:0006508
B4DLR2 (UniProtKB)
IEA
GO:0006508
C9J131 (UniProtKB)
IEA
GO:0008233
C9J131 (UniProtKB)
IEA
GO:0006508
F8WF29 (UniProtKB)
IEA
GO:0008233
F8WF29 (UniProtKB)
IEA
GO:0006508
H0YG61 (UniProtKB)
IEA
GO:0008236
H0YG61 (UniProtKB)
IEA
GO:0001525
Q12884 (UniProtKB)
IEA
GO:0002020
Q12884 (UniProtKB)
IPI
GO:0004175
Q12884 (UniProtKB)
IDA
GO:0004222
Q12884 (UniProtKB)
TAS
GO:0004252
Q12884 (UniProtKB)
IDA
GO:0005178
Q12884 (UniProtKB)
IPI
GO:0005178
Q12884 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q12884 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q12884 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q12884 (UniProtKB)
IPI
GO:0005615
Q12884 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q12884 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
Q12884 (UniProtKB)
NAS
GO:0005886
Q12884 (UniProtKB)
IDA
GO:0005925
Q12884 (UniProtKB)
IDA
GO:0006508
Q12884 (UniProtKB)
IDA
GO:0007155
Q12884 (UniProtKB)
IEA
GO:0008233
Q12884 (UniProtKB)
IDA
GO:0008233
Q12884 (UniProtKB)
IDA
GO:0008236
Q12884 (UniProtKB)
IDA
GO:0008236
Q12884 (UniProtKB)
NAS
GO:0008236
Q12884 (UniProtKB)
IMP
GO:0008236
Q12884 (UniProtKB)
NAS
GO:0008239
Q12884 (UniProtKB)
IDA
GO:0008239
Q12884 (UniProtKB)
NAS
GO:0009986
Q12884 (UniProtKB)
ISS
GO:0010710
Q12884 (UniProtKB)
IDA
GO:0010716
Q12884 (UniProtKB)
IDA
GO:0016021
Q12884 (UniProtKB)
NAS
GO:0030027
Q12884 (UniProtKB)
IDA
GO:0030027
Q12884 (UniProtKB)
IDA
GO:0031258
Q12884 (UniProtKB)
IEA
GO:0032587
Q12884 (UniProtKB)
NAS
GO:0042803
Q12884 (UniProtKB)
IDA
GO:0042803
Q12884 (UniProtKB)
NAS
GO:0043542
Q12884 (UniProtKB)
IDA
GO:0045177
Q12884 (UniProtKB)
IEA
GO:0045178
Q12884 (UniProtKB)
IEA
GO:0046983
Q12884 (UniProtKB)
NAS
GO:0051603
Q12884 (UniProtKB)
IDA
GO:0051917
Q12884 (UniProtKB)
IC
GO:0060244
Q12884 (UniProtKB)
ISS
GO:0071158
Q12884 (UniProtKB)
ISS
GO:0071438
Q12884 (UniProtKB)
IDA
GO:0071850
Q12884 (UniProtKB)
ISS
GO:0097325
Q12884 (UniProtKB)
ISS
GO:1900119
Q12884 (UniProtKB)
ISS
GO:1902362
Q12884 (UniProtKB)
ISS
GO:1903054
Q12884 (UniProtKB)
IDA

可能调控 FAP基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
IGA Glomerulonephritis 0.12 1 0 CTD_human
Neoplasm Metastasis 0.008715934 5 0 BeFree_LHGDN
Adenomatous Polyposis Coli 0.005700279 21 0 BeFree
Colorectal Neoplasms 0.0054487 2 0 LHGDN
Colorectal Cancer 0.003800186 14 0 BeFree
Colorectal Carcinoma 0.003528744 13 0 BeFree
melanoma 0.003267234 3 0 BeFree_LHGDN
Adenocarcinoma 0.003267234 3 0 BeFree_LHGDN
Amyloid Neuropathies, Familial 0.003257302 12 0 BeFree
Degenerative polyarthritis 0.002995792 1 0 BeFree_LHGDN

联系方式

山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

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