FAM107A (family with sequence similarity 107 member A)

symbol:
FAM107A
locus group:
protein-coding gene
location:
3p14.3-p14.2
gene_family:
alias symbol:
DRR1|TU3A
alias name:
down-regulated in renal cell carci…
entrez id:
11170
ensembl gene id:
ENSG00000168309
ucsc gene id:
uc003dkm.5
refseq accession:
NM_007177
hgnc_id:
HGNC:30827
approved reserved:
2006-01-17
3p14.3-p14.2
基因染色体位置图

FAM107A(Family with sequence similarity 107 member A)是一个功能尚未完全明确的基因,属于FAM107基因家族。该家族成员通常编码小分子量蛋白质,并在细胞黏附、迁移和信号传导等过程中发挥作用。FAM107A基因在多种组织中表达,尤其在神经系统和某些上皮组织中表达较高。研究表明,FAM107A可能参与细胞骨架的重组和细胞运动的调控,其表达产物可能通过与微管或肌动蛋白相互作用来影响细胞形态和迁移能力。FAM107A的突变或表达异常可能与某些疾病相关,例如神经退行性疾病和癌症。在一些肿瘤中,FAM107A的表达水平降低,这可能与其抑癌功能有关,因为低表达可能导致细胞迁移和侵袭能力增强。相反,过表达FAM107A可能抑制肿瘤细胞的转移能力。此外,FAM107A的表达变化还可能影响其他基因的功能,例如参与细胞周期调控或凋亡相关基因的表达。FAM107基因家族的共性包括编码小分子量蛋白质,并在细胞黏附和迁移中发挥作用,部分成员还参与肿瘤抑制过程。尽管FAM107A的具体功能仍需进一步研究,但现有证据表明它在维持细胞稳态和疾病发生中可能扮演重要角色。

None

FAM107A基因的碱基序列:[NCBI]
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FAM107A基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs13673       rs715852       rs717323       rs728969       rs748025       rs753819       rs753820       rs753821       rs900871       rs900872       rs900880       rs900881       rs900882       rs935221       rs1043942       rs1043946       rs1043947      

FAM107A基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTCAGGCCAGATTTCATAGTG
59
TGGATCTCCGAGTACATGG
58
CTCATCAAGCCCAAGAAGC
59
CCCTTCTGTGGTTCATGAG
58
TCATCAAGCCCAAGAAGCT
59
TCTTGATGAGCTGGTTCCG
60
AGAAGAAGGAGGAGCTGGA
60
TCCTCTTCCTTCTCTGGTG
58
CTCCTTGCTAGTCTGGGAC
59
AGTACATGGCGGTTCTCAG
60
GAGTTAGACAATAAGGCCGC
59
TTGATGAGCTCCGGATTCC
60
TTGTGCCTGGGAGAATGAG
60
GTATAGGTCCATCCCAGCC
59
TCATCAAGCCCAAGAAGCT
59
TCTTGATGAGCTGGTTCCG
60
TCAGGCCAGATTTCATAGTG
57
TGGATCTCCGAGTACATGG
58
TTGTGCCTGGGAGAATGAG
60
TATAGGTCCATCCCAGCCA
60
      尚未收录相关数据

FAM107A基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

FAM107A基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0001558
O95990 (UniProtKB)
IDA
GO:0003674
O95990 (UniProtKB)
ND
GO:0005515
O95990 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O95990 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O95990 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O95990 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O95990 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O95990 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O95990 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O95990 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O95990 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
O95990 (UniProtKB)
IDA
GO:0043005
O95990 (UniProtKB)
IEA

可能调控 FAM107A基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Rheumatoid Arthritis 0.122367032 1 1 GAD_GWASCAT
Glioma 0.12 1 0 CTD_human
Renal Cell Carcinoma 0.00408156 5 0 BeFree_LHGDN
Malignant neoplasm of lung 0.000542884 2 0 BeFree
Non-Small Cell Lung Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000542884 2 0 BeFree
Carcinoma of lung 0.000542884 2 0 BeFree
Ulcerative Colitis 0.000271442 1 0 BeFree
Glioblastoma 0.000271442 1 0 BeFree

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