F9 (coagulation factor IX)

symbol:
F9
locus group:
protein-coding gene
location:
Xq27.1
gene_family:
alias symbol:
FIX
alias name:
Factor IX|plasma thromboplastic co…
entrez id:
2158
ensembl gene id:
ENSG00000101981
ucsc gene id:
uc004fas.2
refseq accession:
NM_000133
hgnc_id:
HGNC:3551
approved reserved:
2001-06-22
Xq27.1
基因染色体位置图

F9基因位于X染色体上,编码凝血因子IX(Factor IX),这是一种在血液凝固过程中起关键作用的丝氨酸蛋白酶。F9基因的表达产物主要在肝脏合成,随后分泌到血液中,参与内源性凝血途径。当血管受损时,因子IX被激活为因子IXa,与因子VIIIa、钙离子和磷脂表面形成复合物,进一步激活因子X,最终促进凝血酶生成和纤维蛋白形成,完成止血过程。F9基因突变可导致血友病B(又称Christmas病),这是一种X连锁隐性遗传病,表现为凝血功能障碍,患者容易出现关节、肌肉和内脏出血。突变类型包括错义突变、无义突变、缺失或插入,可能导致因子IX活性降低或完全缺失,严重程度与突变类型相关。F9基因过表达可能导致血栓形成风险增加,而表达降低则直接引发血友病B症状。F9属于凝血因子基因家族,该家族成员(如F2、F7、F10等)均编码参与凝血级联反应的蛋白酶或辅因子,具有相似的结构特征(如γ-羧基谷氨酸结构域)和功能关联,通过级联放大效应协同完成凝血功能。治疗上,血友病B患者可通过输注重组因子IX或基因疗法进行干预。研究还发现F9基因多态性与心血管疾病风险相关,其表达水平可能影响血栓性疾病的发生发展。

This gene encodes vitamin K-dependent coagulation factor IX that circulates in the blood as an inactive zymogen. This factor is converted to an active form by factor XIa, which excises the activation peptide and thus generates a heavy chain and a light chain held together by one or more disulfide bonds. The role of this activated factor IX in the blood coagulation cascade is to activate factor X to its active form through interactions with Ca+2 ions, membrane phospholipids, and factor VIII. Alterations of this gene, including point mutations, insertions and deletions, cause factor IX deficiency, which is a recessive X-linked disorder, also called hemophilia B or Christmas disease. [provided by RefSeq, Jul 2008]

这个基因编码维生素K依赖性凝血因子IX,在血液中循环作为无活性的酶原。这个因子被转换成由因子XIa,该切除激活肽和由此产生的重链和由一个或多个二硫键保持在一起的轻链的活性形式。在血液凝固级联此活化的因子IX的作用是通过与钙+2离子,膜磷脂,和因子VIII的相互作用以激活因子X至其活性形式。这个基因的改变,包括点突变,插入和缺失,导致因子IX缺乏症,这是一种隐性X连锁障碍,也叫做血友病B或圣诞节疾病。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

F9基因的碱基序列:[NCBI]
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F9基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs781638411       rs781590024       rs781382217       rs781184105       rs781257481       rs781094748       rs781093217       rs780897125       rs781060029       rs780827158       rs780797258       rs780634176       rs780516722       rs780520320       rs780483685       rs780347965       rs780435919      

F9基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AAATGGATTGTAACTGCTGCC
60
GTCTCCTCAATATTATGTTCACCTG
60
TCATGGCAGAATCACCAGG
60
AACTGTACATTCAGCACTGAG
58
AATCACCAGGCCTCATCAC
60
AAACTGTACATTCAGCACTGAG
59
AATGGATTGTAACTGCTGCC
59
GTCTCCTCAATATTATGTTCACCTG
60
AAATGGATTGTAACTGCTGCC
60
CTCCTCAATATTATGTTCACCTGC
60
AATCACCAGGCCTCATCAC
60
AACTGTACATTCAGCACTGAG
58
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
CEBPA
F9
Activation

F9基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

F9基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0004175
P00740 (UniProtKB)
IDA
GO:0004175
P00740 (UniProtKB)
IDA
GO:0004252
P00740 (UniProtKB)
IEA
GO:0005509
P00740 (UniProtKB)
IDA
GO:0005509
P00740 (UniProtKB)
IDA
GO:0005576
P00740 (UniProtKB)
NAS
GO:0005576
P00740 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
P00740 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
P00740 (UniProtKB)
TAS
GO:0005615
P00740 (UniProtKB)
IDA
GO:0005788
P00740 (UniProtKB)
TAS
GO:0005788
P00740 (UniProtKB)
TAS
GO:0005796
P00740 (UniProtKB)
TAS
GO:0005796
P00740 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
P00740 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
P00740 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
P00740 (UniProtKB)
TAS
GO:0006465
P00740 (UniProtKB)
TAS
GO:0006508
P00740 (UniProtKB)
IDA
GO:0006888
P00740 (UniProtKB)
TAS
GO:0007596
P00740 (UniProtKB)
IDA
GO:0007596
P00740 (UniProtKB)
IMP
GO:0007597
P00740 (UniProtKB)
TAS
GO:0007598
P00740 (UniProtKB)
TAS
GO:0017187
P00740 (UniProtKB)
TAS
GO:0031638
P00740 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
P00740 (UniProtKB)
IDA

可能调控 F9基因的相关microRNA:     

Reactome

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Hemophilia B 0.546171548 315 66 BeFree_CLINVAR_CTD_human_GAD_LHGDN_MGD_UNIPROT
Thrombophilia, X-Linked, Due To Factor Ix Defect 0.36 1 1 CLINVAR_CTD_human_UNIPROT
Hemophilia A 0.156655922 82 0 BeFree_CTD_human_GAD
Thrombosis 0.12 1 0 CTD_human
Coumarin Resistance 0.12 0 0 CTD_human
Thyroid carcinoma 0.020901024 77 1 BeFree
Hemophilia, NOS 0.014386419 53 0 BeFree
Venous Thrombosis 0.012192478 5 0 GAD_LHGDN
Papillary thyroid carcinoma 0.011943442 44 1 BeFree
Blood Coagulation Disorders 0.011400559 42 0 BeFree

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