ERGIC3 (ERGIC and golgi 3)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
ERGIC3
locus group:
protein-coding gene
location:
20q11.22
gene_family:
alias symbol:
CGI-54|PRO0989|NY-BR-84|Erv46
alias name:
None
entrez id:
51614
ensembl gene id:
ENSG00000125991
ucsc gene id:
uc002xcs.4
refseq accession:
NM_015966
hgnc_id:
HGNC:15927
approved reserved:
2001-07-31

基因染色体位置

基因染色体位置

20q11.22
基因染色体位置图

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

ERGIC3基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs8825       rs224411       rs224412       rs224413       rs224414       rs224415       rs224416       rs224417       rs224418       rs224419       rs224420       rs224421       rs224422       rs1058805       rs2104417       rs3790136       rs6058258      

基因表达

基因表达

ERGIC3基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CAAGCCTCCATGATGTTCC
58
TTTCCTGTTGAGCCTCTCC
59
CATGCCTTGTGCCTATCTG
58
GTTGCTTGAACAGGTTGTG
57
AGAAGCACAGGTCCTTCAC
59
GAGCGAATCGATGAGTCCA
59
AGATATCAAGTGCTGTAACACC
58
GTATCTGGGTTCTTGAAGGC
58
CTAATGACGCCTTCTCCCT
58
ATCATGGAGGGTTGTCAAGG
59
CATGCCTTGTGCCTATCTG
58
CTTGAACAGGTTGTGTTCCA
58
GAAGATATCAAGTGCTGTAACACC
59
ATCTGGGTTCTTGAAGGCC
59
AGAAGCACAGGTCCTTCAC
59
AGCGAATCGATGAGTCCAG
59
AAGCCTCCATGATGTTCCA
59
TTTCCTGTTGAGCCTCTCC
59
ACTAATGACGCCTTCTCCC
59
TCATGGAGGGTTGTCAAGG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

ERGIC3基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ERGIC3基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
A0A0C4DH46 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
A6PVJ2 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
H0Y5K5 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
H0Y621 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
H0Y6Z0 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
H0Y802 (UniProtKB)
IEA
GO:0005789
Q9Y282 (UniProtKB)
IEA
GO:0005794
Q9Y282 (UniProtKB)
IEA
GO:0016020
Q9Y282 (UniProtKB)
IDA
GO:0016021
Q9Y282 (UniProtKB)
IEA
GO:0016192
Q9Y282 (UniProtKB)
IEA
GO:0033116
Q9Y282 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 ERGIC3基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Carcinoma of lung 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of lung 0.000542884 2 0 BeFree
Liver carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Non-Small Cell Lung Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Adenocarcinoma of lung (disorder) 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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电话： 0531-88819269

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