ERC1 (ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1)

symbol:
ERC1
locus group:
protein-coding gene
location:
12p13.33
gene_family:
alias symbol:
ELKS|KIAA1081|CAST2|MGC12974
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None
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23085
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ENSG00000082805
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uc001qjb.3
refseq accession:
NM_015064
hgnc_id:
HGNC:17072
approved reserved:
2004-11-26
12p13.33
基因染色体位置图

ERC1(英文全称ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1)属于ELKS基因家族,该家族成员通常含有N端的卷曲螺旋结构域(coiled-coil domain,一种蛋白质相互作用的结构)和C端的保守序列,主要参与突触前活性区的组装和神经递质释放调控。ERC1编码的蛋白质是突触前活性区支架蛋白复合体(presynaptic active zone scaffold)的关键组分,通过与RIM(Rab3-interacting molecule)、Bassoon等蛋白相互作用,维持突触结构和功能,尤其在神经元突触小泡的锚定、释放及信号传递中起核心作用。其表达产物具有多结构域特性,能介导蛋白质-蛋白质相互作用,例如与RAB6(一种小GTP酶)结合调控囊泡运输。 若ERC1发生功能丧失性突变(loss-of-function mutation,指突变导致基因功能减弱或消失),可能导致突触传递异常,与神经发育障碍(如自闭症谱系障碍、智力障碍)或神经退行性疾病相关。相反,过表达ERC1可能增强突触活性,但过度激活可能破坏突触可塑性(synaptic plasticity,指突触强度适应性变化的能力),影响学习记忆功能。 在疾病关联方面,ERC1的异常表达或突变与精神分裂症、癫痫等神经系统疾病有关。其家族成员(如ERC2/CAST1)同样参与突触调控,共性包括维持突触活性区稳定性、调控神经递质释放。若ERC1表达降低,可能减少突触前蛋白复合体的形成,导致神经信号传递效率下降;而过表达可能干扰其他支架蛋白(如Munc13、Liprin-α)的平衡,影响突触发育。 专业术语解释: - **卷曲螺旋结构域**:蛋白质中由α螺旋缠绕形成的结构,介导蛋白相互作用。 - **突触前活性区**:神经元突触中负责神经递质释放的特化区域。 - **支架蛋白**:支撑其他分子组装的骨架蛋白。 - **突触可塑性**:突触根据活动强度调整功能的能力,是学习记忆的基础。 (注:ERC1曾用名包括CAST2或RIMBP2,需注意文献中的命名差异。)

The protein encoded by this gene is a member of a family of RIM-binding proteins. RIMs are active zone proteins that regulate neurotransmitter release. This gene has been found fused to the receptor-type tyrosine kinase gene RET by gene rearrangement due to the translocation t(10;12)(q11;p13) in thyroid papillary carcinoma. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jul 2014]

由该基因编码的蛋白质是一个家族的RIM结合蛋白中的一员。轮辋是调节神经递质的释放活动区域蛋白。该基因已经发现融合于通过基因重排的受体型酪氨酸激酶基因RET由于易位t(10; 12)(Q11; P13)在甲状腺乳头状癌。选择性剪接结果在多个抄本变形。 [由RefSeq的,2014年7月提供]

ERC1基因的碱基序列:[NCBI]
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ERC1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs721859       rs732064       rs732844       rs736098       rs739971       rs739972       rs757477       rs766095       rs766956       rs766957       rs768157       rs886539       rs886540       rs886541       rs929584       rs956408       rs969360      

ERC1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CCTATAACTTGGACGATGACC
58
CTAACTCATCCTGAAGCTGC
59
AATTACAGGCATGAGCCAC
58
CTGGATGATCTCTACAGATTGC
59
TTTCCAAGCTCACTCATGC
59
AGGTTAATCAGAAGAAGGTCCC
60
GTCAAATCCTTGCAGGCTG
60
CAATTGTCCGCTCTTTCTCTG
60
CTTAGGACTAGTGAAGCCG
57
AACTTCAAACTACCCTAACCC
58
CACAAATGTTAGAGGAGGCG
59
TCTTACGGAGACTGTCCTG
58
TGGAGATGAAGCAAGAAGC
58
TTAGAGGACGAAAGCTCCA
58
GAGATGCACGTTCATCACC
59
ACCTTCGATGCATCTCCTC
59
CCAGTTCTCAGATAGTAAACAGC
59
GAGCATCCACCTCAGTCTG
60
CCCAGACCAGATCATCCAG
59
TTATAGGAAGCTGGTGGAGTG
59
      尚未收录相关数据

ERC1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ERC1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0048786
A0A0U1RQD6 (UniProtKB)
IEA
GO:0048786
A0A0U1RQM4 (UniProtKB)
IEA
GO:0048786
A0A0U1RQN0 (UniProtKB)
IEA
GO:0048786
A0A0U1RR82 (UniProtKB)
IEA
GO:0048786
A0A0U1RRM0 (UniProtKB)
IEA
GO:0048786
G8JLD3 (UniProtKB)
IEA
GO:0048786
K7EIZ7 (UniProtKB)
IEA
GO:0048786
K7EKH8 (UniProtKB)
IEA
GO:0048786
K7EP25 (UniProtKB)
IEA
GO:0048786
K7EPD6 (UniProtKB)
IEA
GO:0048786
K7EPP6 (UniProtKB)
IEA
GO:0000139
Q8IUD2 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q8IUD2 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8IUD2 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8IUD2 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8IUD2 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8IUD2 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8IUD2 (UniProtKB)
IPI
GO:0005737
Q8IUD2 (UniProtKB)
ISS
GO:0005737
Q8IUD2 (UniProtKB)
TAS
GO:0006355
Q8IUD2 (UniProtKB)
NAS
GO:0007252
Q8IUD2 (UniProtKB)
IDA
GO:0007275
Q8IUD2 (UniProtKB)
NAS
GO:0008385
Q8IUD2 (UniProtKB)
IDA
GO:0015031
Q8IUD2 (UniProtKB)
IEA
GO:0017137
Q8IUD2 (UniProtKB)
ISS
GO:0030165
Q8IUD2 (UniProtKB)
ISS
GO:0042147
Q8IUD2 (UniProtKB)
ISS
GO:0042734
Q8IUD2 (UniProtKB)
TAS
GO:0043522
Q8IUD2 (UniProtKB)
NAS
GO:0045202
Q8IUD2 (UniProtKB)
ISS
GO:0048786
Q8IUD2 (UniProtKB)
IEA
GO:0051092
Q8IUD2 (UniProtKB)
TAS
GO:0048786
X6RLX0 (UniProtKB)
IEA
GO:0048786
X6RM00 (UniProtKB)
IEA

可能调控 ERC1基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Papillary thyroid carcinoma 0.120542884 2 0 BeFree_ORPHANET
Thyroid Neoplasm 0.00272435 1 0 LHGDN
Leukemia, Myelocytic, Acute 0.00272435 1 0 LHGDN
Alcoholic Intoxication, Chronic 0.002367032 1 0 GAD
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Apraxia, Developmental Verbal 0.000271442 1 0 BeFree
Thyroid carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

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