EDAR (ectodysplasin A receptor)

symbol:
EDAR
locus group:
protein-coding gene
location:
2q13
gene_family:
Tumor necrosis factor receptor superfamily
alias symbol:
ED5|EDA3|ED1R|EDA1R
alias name:
None
entrez id:
10913
ensembl gene id:
ENSG00000135960
ucsc gene id:
uc002teq.4
refseq accession:
NM_022336
hgnc_id:
HGNC:2895
approved reserved:
1999-08-09
2q13
基因染色体位置图

EDAR(Ectodysplasin A receptor)是一种编码跨膜受体的基因,属于肿瘤坏死因子受体超家族(TNFRSF)的成员,主要参与外胚层发育和皮肤附属器官(如毛发、牙齿、汗腺等)的形成。EDAR基因通过结合其配体ectodysplasin A(EDA)激活NF-κB信号通路,调控细胞增殖、分化和凋亡,对胚胎发育至关重要。该基因的突变可能导致外胚层发育不良(EDA综合征),表现为毛发稀疏、牙齿缺失或畸形、汗腺发育不全等症状,严重时甚至影响体温调节。EDAR基因的某些特定突变(如370A等位基因)与东亚人群的粗直发、铲形门齿等特征相关,可能是自然选择的结果。过表达EDAR可能增强NF-κB信号活性,导致皮肤附属器官过度发育或炎症反应加剧;而表达降低则可能引发类似EDA综合征的表型。EDAR属于EDAR基因家族,该家族还包括EDARADD和EDA等基因,它们共同参与外胚层发育的信号传导网络,通过相似的分子机制调控组织形态发生。研究还发现EDAR与自身免疫性疾病(如类风湿性关节炎)可能存在关联,因其参与免疫调节功能。

This gene encodes a member of the tumor necrosis factor receptor family. The encoded transmembrane protein is a receptor for the soluble ligand ectodysplasin A, and can activate the nuclear factor-kappaB, JNK, and caspase-independent cell death pathways. It is required for the development of hair, teeth, and other ectodermal derivatives. Mutations in this gene result in autosomal dominant and recessive forms of hypohidrotic ectodermal dysplasia. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码的肿瘤坏死因子受体家族的一个成员。所编码的跨膜蛋白为可溶性配体ectodysplasin A中的受体,并且可以激活核因子-κB,JNK和胱天蛋白酶非依赖性细胞死亡途径。它需要的毛发,牙齿,以及其他外胚层衍生的发展。突变这个基因导致少汗型外胚层发育不良的常染色体显性和隐性形式。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

EDAR基因的碱基序列:[NCBI]
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EDAR基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs45478       rs45479       rs70664       rs87545       rs103855       rs154997       rs154998       rs155219       rs166346       rs166347       rs171857       rs183780       rs183781       rs260594       rs260595       rs260597       rs260598      

EDAR基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGTCGTGGAAGGTCTTAGC
59
AGAGTTGTACGTGGAGCTG
60
AGTCGTGGAAGGTCTTAGC
59
AGAGTTGTACGTGGAGCTG
60
AGTCGTGGAAGGTCTTAGC
59
AGAGTTGTACGTGGAGCTG
60
AGTCGTGGAAGGTCTTAGC
59
AGTTGTACGTGGAGCTGAG
60
AGTCGTGGAAGGTCTTAGC
59
AGTTGTACGTGGAGCTGAG
60
AGTCGTGGAAGGTCTTAGC
59
AGTTGTACGTGGAGCTGAG
60
GCCCACAAAGAACTCTCAG
59
GATGGCCATGATGAAGATGG
59
GCCCACAAAGAACTCTCAG
59
GATGGCCATGATGAAGATGG
59
GCCCACAAAGAACTCTCAG
59
GATGGCCATGATGAAGATGG
59
      尚未收录相关数据

EDAR基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

EDAR基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0001942
Q9UNE0 (UniProtKB)
IEA
GO:0004872
Q9UNE0 (UniProtKB)
IDA
GO:0004888
Q9UNE0 (UniProtKB)
NAS
GO:0005515
Q9UNE0 (UniProtKB)
IPI
GO:0005886
Q9UNE0 (UniProtKB)
IBA
GO:0005886
Q9UNE0 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
Q9UNE0 (UniProtKB)
TAS
GO:0006915
Q9UNE0 (UniProtKB)
IEA
GO:0008544
Q9UNE0 (UniProtKB)
TAS
GO:0010628
Q9UNE0 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
Q9UNE0 (UniProtKB)
NAS
GO:0030154
Q9UNE0 (UniProtKB)
IEA
GO:0033209
Q9UNE0 (UniProtKB)
TAS
GO:0042346
Q9UNE0 (UniProtKB)
IEA
GO:0042475
Q9UNE0 (UniProtKB)
IEA
GO:0043123
Q9UNE0 (UniProtKB)
IBA
GO:0043473
Q9UNE0 (UniProtKB)
IEA
GO:0045177
Q9UNE0 (UniProtKB)
IEA
GO:0046330
Q9UNE0 (UniProtKB)
IBA
GO:0060662
Q9UNE0 (UniProtKB)
IEA

可能调控 EDAR基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Ectodermal Dysplasia, Hypohidrotic, Autosomal Recessive 0.362171535 8 8 BeFree_CLINVAR_CTD_human_ORPHANET
Ectodermal Dysplasia 3, Anhidrotic 0.24 0 1 CLINVAR_CTD_human
ECTODERMAL DYSPLASIA 10B, HYPOHIDROTIC/HAIR/TOOTH TYPE, AUTOSOMAL RECESSIVE 0.2 6 0 MGD_UNIPROT
ECTODERMAL DYSPLASIA 10A, HYPOHIDROTIC/HAIR/NAIL TYPE, AUTOSOMAL DOMINANT 0.12 1 0 UNIPROT
Autosomal dominant hypohidrotic ectodermal dysplasia syndrome (disorder) 0.12 0 0 ORPHANET
Ectodermal Dysplasia 0.008987376 6 0 BeFree_LHGDN
Christ-Siemens-Touraine syndrome 0.004614512 17 0 BeFree
Alzheimer's Disease 0.002367032 1 1 GAD
Hypodontia 0.001085767 4 0 BeFree
Developmental absence of tooth 0.000814326 3 0 BeFree

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