DSG4 (desmoglein 4)

symbol:
DSG4
locus group:
protein-coding gene
location:
18q12.1
gene_family:
Major cadherins
alias symbol:
CDHF13|LAH
alias name:
None
entrez id:
147409
ensembl gene id:
ENSG00000175065
ucsc gene id:
uc002kwq.3
refseq accession:
NM_177986
hgnc_id:
HGNC:21307
approved reserved:
2003-06-04
18q12.1
基因染色体位置图

DSG4(Desmoglein-4)是钙黏蛋白超家族中桥粒芯糖蛋白(Desmoglein)基因家族的成员之一,该家族还包括DSG1、DSG2和DSG3等基因。DSG4基因家族的主要共性是编码桥粒的关键结构蛋白,这些蛋白在细胞间黏附中起重要作用,特别是在上皮组织和毛囊中维持组织完整性和机械强度。DSG4主要在毛囊的内根鞘和毛干中高表达,对毛发的生长和发育至关重要。DSG4蛋白通过钙依赖性方式与其他桥粒蛋白(如Desmocollin)相互作用,形成细胞间连接结构,确保毛囊细胞的稳定性和信号传递。DSG4的功能异常或突变会导致严重的毛发疾病,例如常染色体隐性遗传的单纯型少毛症(Hypotrichosis),表现为毛发稀疏、脆弱易断甚至完全缺失。某些DSG4突变还可能影响毛囊角质形成细胞的分化,导致毛发结构异常。DSG4的过表达研究较少,但推测可能干扰其他桥粒蛋白的平衡,影响细胞黏附功能;而表达降低或缺失会直接破坏毛囊结构的完整性,导致脱发或毛发发育障碍。此外,DSG4在部分肿瘤中的异常表达可能与癌症进展相关,但具体机制尚不明确。总体而言,DSG4是毛发健康的核心基因,其突变或表达失调会显著影响毛囊生物学功能,但与其他家族成员(如DSG3在黏膜中的作用)相比,DSG4的功能更具组织特异性。

This gene encodes a member of the desmoglein subgroup of desmosomal cadherins. The encoded protein is a transmembrane component in desmosomes and may play a role in cell-cell adhesion in epithelial cells. Mutations in the gene are associated with localized autosomal recessive hypotrichosis and potentially in other skin disorders. Alternate splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Sep 2009]

该基??因编码桥粒钙粘蛋白的桥粒芯蛋白的亚组的一个成员。所编码的蛋白质是在桥粒跨膜成分和上皮细胞可在细胞 - 细胞粘着的作用。在基因突变与局部常染色体隐性少毛症和可能在其它皮肤病症相关。选择性剪接结果在多个抄本变形。 [由RefSeq的,2009年09月提供]

DSG4基因的碱基序列:[NCBI]
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DSG4基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs922184       rs984526       rs984527       rs1020838       rs1020839       rs1031730       rs1031731       rs1031732       rs1290322       rs1299714       rs1350729       rs1350730       rs1460594       rs1460596       rs1460597       rs1460605       rs1813419      

DSG4基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TACTTCTCGGAGAAAGCGT
59
GTGGTCATAAATGAGCAAGC
58
GATTCCTCTGAAATCTACACCA
58
CATACCTGTGTTGAGCTCC
58
TACTTCTCGGAGAAAGCGT
59
GTGGTCATAAATGAGCAAGC
58
GGATTCCTCTGAAATCTACACC
58
TACCTGTGTTGAGCTCCAC
59
GCTACTTCTCGGAGAAAGC
58
GGTCATAAATGAGCAAGCAG
57
GCTACTTCTCGGAGAAAGC
58
GGTCATAAATGAGCAAGCAG
57
CTACTTCTCGGAGAAAGCGT
60
TGGTCATAAATGAGCAAGCAG
59
CTACTTCTCGGAGAAAGCGT
60
TGGTCATAAATGAGCAAGCAG
59
GATTCCTCTGAAATCTACACCA
58
ATACCTGTGTTGAGCTCCA
58
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
FOXN1
DSG4
Repression
HOXC13
DSG4
Repression
LEF1
DSG4
Repression

DSG4基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

DSG4基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0001942
Q86SJ6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005509
Q86SJ6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
Q86SJ6 (UniProtKB)
IEA
GO:0007156
Q86SJ6 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
Q86SJ6 (UniProtKB)
IEA
GO:0016337
Q86SJ6 (UniProtKB)
IEA
GO:0030057
Q86SJ6 (UniProtKB)
IEA
GO:0030216
Q86SJ6 (UniProtKB)
IEA
GO:0030509
Q86SJ6 (UniProtKB)
IEA

可能调控 DSG4基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Hypotrichosis 0.208987376 6 0 BeFree_CTD_human_LHGDN_RGD
Monilethrix 0.121628651 6 0 BeFree_ORPHANET
Hypotrichosis simplex 0.12 0 0 ORPHANET
HYPOTRICHOSIS 6 0.12 0 0 CLINVAR
Ichthyosis linearis circumflexa 0.08 0 0 MGD
Pemphigus 0.0054487 2 0 LHGDN
Staphylococcal Scalded Skin Syndrome 0.00272435 1 0 LHGDN
Total Hypotrichosis, Mari type 0.001900093 7 0 BeFree
Congenital Heart Defects 0.000271442 1 0 BeFree
Noonan Syndrome 0.000271442 1 0 BeFree

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