DSCAM (DS cell adhesion molecule)

symbol:
DSCAM
locus group:
protein-coding gene
location:
21q22.2
gene_family:
Fibronectin type III domain containing|I-set domain containing|Immunoglobulin-like domain containing
alias symbol:
CHD2-42|CHD2-52
alias name:
None
entrez id:
1826
ensembl gene id:
ENSG00000171587
ucsc gene id:
uc002yyq.2
refseq accession:
NM_001389
hgnc_id:
HGNC:3039
approved reserved:
1998-06-10
21q22.2
基因染色体位置图

DSCAM(Down Syndrome Cell Adhesion Molecule)是一种重要的细胞粘附分子,属于免疫球蛋白超家族(IgSF)中的一员,同时也是DSCAM基因家族的成员。DSCAM基因家族在神经系统中高度保守,其成员通常参与细胞间的识别、粘附和信号传导,尤其在神经系统的发育过程中发挥关键作用,如轴突导向、突触形成和神经元迁移。DSCAM本身在果蝇和小鼠等模式生物中研究较多,其表达产物是一种跨膜蛋白,具有多个免疫球蛋白样结构域和纤维连接蛋白III型重复序列,能够通过同源或异源相互作用介导细胞间的特异性识别。DSCAM的功能异常与多种神经系统疾病相关,例如唐氏综合征(Down Syndrome),因为该基因位于人类21号染色体上,而唐氏综合征患者通常携带该染色体的三体性,导致DSCAM过表达。过表达的DSCAM可能干扰神经回路的正常形成,影响突触可塑性,进而导致认知障碍。此外,DSCAM的突变或表达异常还与自闭症谱系障碍(ASD)和精神分裂症等神经发育疾病有关。在果蝇中,DSCAM的多样性通过选择性剪接产生大量异构体,这种多样性对于神经回路的精确组装至关重要。如果DSCAM表达降低,可能会导致轴突导向错误、突触连接异常,甚至神经元凋亡。相反,过表达可能引起过度的自我回避或异常的神经元连接,破坏神经网络的平衡。DSCAM基因家族的共性包括编码具有多个免疫球蛋白结构域的跨膜蛋白,参与细胞间相互作用和信号传导,并在神经系统发育中起核心作用。该家族成员通常表现出高度的选择性剪接,以增加蛋白多样性,从而适应复杂的神经发育需求。研究DSCAM及其家族成员不仅有助于理解神经发育的分子机制,还为相关疾病的治疗提供潜在靶点。

This gene is a member of the immunoglobulin superfamily of cell adhesion molecules (Ig-CAMs), and is involved in human central and peripheral nervous system development. This gene is a candidate for Down syndrome and congenital heart disease (DSCHD). A gene encoding a similar Ig-CAM protein is located on chromosome 11. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2012]

这个基因是细胞粘附分子的免疫球蛋白超家族(免疫球蛋白的CAM)的成员,并且是参与人体中枢和外周神经系统的发育。这种基因是唐氏综合征和先天性心脏疾病(DSCHD)候选人。编码类似的Ig-CAM蛋白的基因位于染色体11可替代地剪接转录变体编码的多个同种型已被用于这个基因观察到。 [由RefSeq的,2012年10月提供]

DSCAM基因的碱基序列:[NCBI]
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DSCAM基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs2017995       rs2837592       rs2837593       rs2837594       rs2837595       rs2837596       rs2837597       rs2837598       rs2837599       rs2837600       rs2837601       rs4818128       rs7275762       rs7281126       rs8130598       rs11702564       rs16999717      

DSCAM基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAAGCCTTGAATGGAATTCTC
57
TTTAATCTCACCCAGCTCTC
57
GAATCTGCAGGTTCACTGC
59
AATGTATGAGGTCACCTGGC
60
ACTTGTCTCAGGATCTAGATTTCTC
60
GCAGCGGTAGTTATACAATCC
59
GAAGCCTTGAATGGAATTCTC
57
TTTAATCTCACCCAGCTCTC
57
GGAAGCCTTGAATGGAATTCTC
60
TTAATCTCACCCAGCTCTCC
59
GGAAGCCTTGAATGGAATTCTC
60
TTAATCTCACCCAGCTCTCC
59
GGAATCTGCAGGTTCACTG
59
ATGTATGAGGTCACCTGGC
59
CTTGTCTCAGGATCTAGATTTCTC
58
GCAGCGGTAGTTATACAATCC
59
CCAAAGAGGATGTTCCAGGT
60
GAAGCCAGGACACAAAGAC
59
CCAAAGAGGATGTTCCAGGT
60
GAAGCCAGGACACAAAGAC
59
      尚未收录相关数据

DSCAM基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

DSCAM基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005887
A0A087WUI7 (UniProtKB)
IEA
GO:0007155
A0A087WUI7 (UniProtKB)
IEA
GO:0007399
A0A087WUI7 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
O60469 (UniProtKB)
IPI
GO:0005576
O60469 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
O60469 (UniProtKB)
ISS
GO:0005886
O60469 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
O60469 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
O60469 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
O60469 (UniProtKB)
TAS
GO:0005887
O60469 (UniProtKB)
IEA
GO:0007155
O60469 (UniProtKB)
TAS
GO:0007156
O60469 (UniProtKB)
ISS
GO:0007162
O60469 (UniProtKB)
ISS
GO:0007399
O60469 (UniProtKB)
TAS
GO:0007416
O60469 (UniProtKB)
ISS
GO:0007626
O60469 (UniProtKB)
IEA
GO:0010842
O60469 (UniProtKB)
ISS
GO:0016020
O60469 (UniProtKB)
TAS
GO:0030054
O60469 (UniProtKB)
IEA
GO:0030424
O60469 (UniProtKB)
ISS
GO:0030426
O60469 (UniProtKB)
ISS
GO:0042327
O60469 (UniProtKB)
IDA
GO:0045202
O60469 (UniProtKB)
ISS
GO:0048813
O60469 (UniProtKB)
IEA
GO:0048842
O60469 (UniProtKB)
IDA
GO:0060060
O60469 (UniProtKB)
IEA
GO:0060219
O60469 (UniProtKB)
ISS
GO:0070593
O60469 (UniProtKB)
ISS
GO:0005887
Q8WY19 (UniProtKB)
IEA
GO:0007155
Q8WY19 (UniProtKB)
IEA
GO:0007399
Q8WY19 (UniProtKB)
IEA

可能调控 DSCAM基因的相关microRNA:     

Reactome

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Down Syndrome 0.125167327 11 0 BeFree_CTD_human_LHGDN
Substance-Related Disorders 0.12 1 0 CTD_human
Obesity 0.12 1 1 GWASCAT
Muscle Weakness 0.12 1 0 CTD_human
Major Depressive Disorder 0.12 1 1 GWASCAT
Bipolar Disorder 0.005362824 1 0 BeFree_GAD_LHGDN
Tobacco Use Disorder 0.004734064 2 0 GAD
Non-Small Cell Lung Carcinoma 0.002367032 1 1 GAD
Rheumatoid Arthritis 0.002367032 1 1 GAD
Epilepsy 0.001900093 7 0 BeFree

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