DNALI1 (dynein axonemal light intermediate chain 1)

symbol:
DNALI1
locus group:
protein-coding gene
location:
1p34.3
gene_family:
Dyneins, axonemal
alias symbol:
P28|hp28|dJ423B22.5
alias name:
inner dynein arm, homolog of chlam…
entrez id:
7802
ensembl gene id:
ENSG00000163879
ucsc gene id:
uc001cbj.3
refseq accession:
NM_003462
hgnc_id:
HGNC:14353
approved reserved:
2002-06-12
1p34.3
基因染色体位置图

DNALI1(DNA Ligase 1)是一种关键的DNA连接酶,属于ATP依赖型DNA连接酶家族(DNA ligase family),该家族成员的主要功能是通过催化磷酸二酯键的形成来修复DNA单链或双链断裂,确保DNA复制的完整性和基因组的稳定性。DNALI1在DNA复制、碱基切除修复(Base Excision Repair, BER)和核苷酸切除修复(Nucleotide Excision Repair, NER)等过程中发挥核心作用,其作用位点主要集中在细胞核内,参与DNA链的缝合。DNALI1的突变可能导致其功能丧失或减弱,引发DNA修复缺陷,进而增加基因组不稳定性,与某些遗传性疾病(如DNA连接酶Ⅰ缺乏症)和癌症(如结直肠癌、乳腺癌)的发生密切相关。若DNALI1过表达,可能通过过度修复DNA损伤而干扰正常的细胞周期调控,甚至促进肿瘤细胞的存活;而降低表达则会导致DNA损伤积累,诱发细胞凋亡或衰老,并可能影响其他依赖DNA完整性的基因功能(如抑癌基因TP53)。DNA连接酶家族的共性包括依赖ATP或NAD+作为能量来源、具有保守的催化结构域(如腺苷酸化结构域和OB-fold结构域),并在DNA代谢中扮演“分子缝合线”的角色。专业术语解释:磷酸二酯键(phosphodiester bond)是DNA骨架中连接核苷酸的化学键;碱基切除修复(BER)是修复小范围DNA损伤的机制;核苷酸切除修复(NER)负责修复大范围DNA损伤(如紫外线引起的嘧啶二聚体)。目前中文术语“DNA连接酶”翻译准确,无需标注英文。

This gene is the human homolog of the Chlamydomonas inner dynein arm gene, p28. The precise function of this gene is not known, however, it is a potential candidate for immotile cilia syndrome (ICS). Ultrastructural defects of the inner dynein arms are seen in patients with ICS. Immotile mutant strains of Chlamydomonas, a biflagellated algae, exhibit similar defects. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因是衣内动力蛋白臂基因,P28的人类同源。该基因的确切功能尚不清楚,但是,它是用于immotile纤毛综合征(ICS)的潜在候选。内动力蛋白臂的超微结构缺陷患者可见ICS。 Immotile衣,一个biflagellated藻类突变株,显示出类似的缺陷。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

DNALI1基因的碱基序列:[NCBI]
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DNALI1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs6619       rs11749       rs2268695       rs2273014       rs3856137       rs4653300       rs4653301       rs4653302       rs6692773       rs11577094       rs11585844       rs11586480       rs11586555       rs11586828       rs12096516       rs12117262       rs16824234      

DNALI1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTTTGCTCAAGTACGACACC
59
TGACTTTCAGTAGCCGAGC
60
TGAAGCGAACAAATCAGCAG
60
CACTTCTTTGGTGCAATAATGC
59
AAATCGCAGAATTGGAGACG
59
CTTCTTCTCCTCCACCTGC
60
GATCCTACAAAGCAGGCAG
58
CGGATCAACTCATCTTGGG
58
CAAATCAGCAGCTGAAGGC
60
CTCCCAAGTGTCTTGTTGG
58
TGAAGCGAACAAATCAGCAG
60
CACTTCTTTGGTGCAATAATGC
59
TGAAGCGAACAAATCAGCA
58
CACTTCTTTGGTGCAATAATGC
59
GAGATTCAGTTCCTGAAGCG
59
CAATAATGCCTTCCAGTTGGG
60
TTTGCTCAAGTACGACACC
58
CTGACTTTCAGTAGCCGAG
58
TGAAGCGAACAAATCAGCA
58
CACTTCTTTGGTGCAATAATGC
59
      尚未收录相关数据

DNALI1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

DNALI1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003777
O14645 (UniProtKB)
TAS
GO:0005515
O14645 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O14645 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O14645 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O14645 (UniProtKB)
IPI
GO:0005737
O14645 (UniProtKB)
IDA
GO:0005858
O14645 (UniProtKB)
TAS
GO:0005930
O14645 (UniProtKB)
IDA
GO:0006928
O14645 (UniProtKB)
TAS
GO:0007338
O14645 (UniProtKB)
TAS
GO:0030175
O14645 (UniProtKB)
IEA
GO:0045504
O14645 (UniProtKB)
IEA

可能调控 DNALI1基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Malignant neoplasm of breast 0.000542884 2 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Frontotemporal Lobar Degeneration 0.000271442 1 0 BeFree
Adult T-Cell Lymphoma/Leukemia 0.000271442 1 0 BeFree
B-Cell Lymphomas 0.000271442 1 0 BeFree
Hepatitis B 0.000271442 1 0 BeFree
Myopia 0.000271442 1 0 BeFree
Nonsyndromic Deafness 0.000271442 1 0 BeFree
Liver carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

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