DKK3 (dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 3)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
DKK3
locus group:
protein-coding gene
location:
11p15.3
gene_family:
alias symbol:
REIC|RIG|CRRL
alias name:
regulated in glioma|cardiomyocyte …
entrez id:
27122
ensembl gene id:
ENSG00000050165
ucsc gene id:
uc001mjw.4
refseq accession:
NM_013253
hgnc_id:
HGNC:2893
approved reserved:
2000-09-01

基因染色体位置

基因染色体位置

11p15.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

DKK3（Dickkopf相关蛋白3）是一种分泌型糖蛋白，属于DKK基因家族（Dickkopf家族）的成员，该家族包括DKK1、DKK2、DKK3和DKK4。DKK家族蛋白的共同特点是能够调节Wnt信号通路，尤其是通过结合LRP5/6受体来抑制经典的Wnt/β-catenin通路，从而影响细胞增殖、分化和胚胎发育等过程。DKK3在多种组织中表达，包括心脏、肾脏、血管和神经系统，其生物学功能涉及组织稳态、细胞凋亡抑制和血管生成调控。DKK3通过调节Wnt信号通路和非Wnt依赖的机制发挥作用，例如与细胞表面受体如Kremen或整合素相互作用，影响细胞黏附和迁移。DKK3的突变或表达异常与多种疾病相关，包括癌症、心血管疾病和纤维化疾病。在癌症中，DKK3可能发挥抑癌或促癌的双重作用，具体取决于肿瘤类型和微环境。例如，在前列腺癌和肝癌中，DKK3表达下调可能促进肿瘤进展，而在某些肺癌中，其过表达可能与不良预后相关。DKK3的缺失或降低表达可能导致Wnt信号通路的过度激活，促进细胞增殖和肿瘤发生，而DKK3过表达可能抑制Wnt信号，影响组织修复和再生。此外，DKK3在心血管疾病中具有保护作用，其表达减少可能加剧动脉粥样硬化和心肌纤维化。DKK3还与慢性肾病和肺纤维化相关，其表达水平的变化可能影响纤维化进程。DKK3基因家族的共性在于它们通过调节Wnt信号通路参与发育和疾病过程，但各成员的具体功能和调控机制存在差异。DKK3的独特之处在于其多功能性，不仅参与Wnt信号调控，还涉及其他细胞通路，因此在多种生理和病理过程中发挥关键作用。

This gene encodes a protein that is a member of the dickkopf family. The secreted protein contains two cysteine rich regions and is involved in embryonic development through its interactions with the Wnt signaling pathway. The expression of this gene is decreased in a variety of cancer cell lines and it may function as a tumor suppressor gene. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding the same protein. [provided by RefSeq, Jul 2008]

这个基因编码的蛋白质，它是dickkopf家族的一个成员。分泌的蛋白质含有两个半胱氨酸丰富的区域，并通过其与Wnt信号通路的相互作用参与胚胎发育。该基因的表达在多种癌细胞系被降低并且它可以作为肿瘤抑制基因发挥作用。在多个转录剪接的结果变体编码相同的蛋白质。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

DKK3基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs8169       rs751580       rs903014       rs911640       rs952932       rs962442       rs962443       rs962444       rs962445       rs977792       rs987663       rs987664       rs988666       rs988667       rs1012600       rs1038908       rs1038909      

基因表达

基因表达

DKK3基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ACAATGAGACCAACACAGAC
58
CTGGTTGTTGGTTATCTTGTG
58
CAATGAGATGTTCCGCGAG
59
TTCTGCCTCCATCTCTTCC
59
CCGAGAAATTCACAAGGAGG
59
CAGACAGGTGGTAGTTTGG
58
ACAATGAGACCAACACAGAC
58
CTGGTTGTTGGTTATCTTGTG
58
TCACAATGAGACCAACACAG
58
CGATGATGCACTCCTTGTG
59
ACAATGAGACCAACACAGAC
58
CTGGTTGTTGGTTATCTTGTG
58
TCCAGCATCACAGATGGAG
59
CATTGTGATAGCTGGGAGGT
60
CCATCTGTGACAACCAGAG
58
CTAGCTCCCAGGTGATGAG
59
AAAGGAGTCTGGTGGAGAG
58
TAACAAGAGCAGCTCATCCT
59
ACAATGAGACCAACACAGAC
58
CTGGTTGTTGGTTATCTTGTG
58

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
MYCN
DKK3
Repression
18059033; 21796614

基因本体信息

DKK3基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

DKK3基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005576
E9PHY3 (UniProtKB)
IEA
GO:0007275
E9PHY3 (UniProtKB)
IEA
GO:0030178
E9PHY3 (UniProtKB)
IEA
GO:0005576
E9PKW6 (UniProtKB)
IEA
GO:0007275
E9PKW6 (UniProtKB)
IEA
GO:0030178
E9PKW6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005576
F6SYF8 (UniProtKB)
IEA
GO:0007275
F6SYF8 (UniProtKB)
IEA
GO:0030178
F6SYF8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005615
Q9UBP4 (UniProtKB)
TAS
GO:0009653
Q9UBP4 (UniProtKB)
TAS
GO:0016055
Q9UBP4 (UniProtKB)
IEA
GO:0017015
Q9UBP4 (UniProtKB)
NAS
GO:0030325
Q9UBP4 (UniProtKB)
IEP
GO:0032348
Q9UBP4 (UniProtKB)
IDA
GO:0045892
Q9UBP4 (UniProtKB)
IDA
GO:0090090
Q9UBP4 (UniProtKB)
IDA
GO:1902613
Q9UBP4 (UniProtKB)
TAS
GO:2000065
Q9UBP4 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 DKK3基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Mammary Neoplasms 0.005720142 3 0 BeFree_LHGDN
melanoma 0.005720142 2 0 BeFree_LHGDN
Lung Neoplasms 0.0054487 2 0 LHGDN
Glioma 0.003810118 5 0 BeFree_LHGDN
Squamous cell carcinoma 0.003267234 3 0 BeFree_LHGDN
Renal Cell Carcinoma 0.003181358 3 1 BeFree_GAD
Stomach Neoplasms 0.002995792 1 0 BeFree_LHGDN
Bladder Neoplasm 0.002995792 1 0 BeFree_LHGDN
Colorectal Cancer 0.002909916 2 10 BeFree_GAD
Prostatic Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN

基因相关服务

基因相关服务

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电话： 0531-88819269

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