DEPDC1B (DEP domain containing 1B)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
DEPDC1B
locus group:
protein-coding gene
location:
5q12.1
gene_family:
alias symbol:
XTP1|BRCC3
alias name:
breast cancer cell 3
entrez id:
55789
ensembl gene id:
ENSG00000035499
ucsc gene id:
uc003jsh.4
refseq accession:
NM_018369
hgnc_id:
HGNC:24902
approved reserved:
2004-06-04

基因染色体位置

基因染色体位置

5q12.1
基因染色体位置图

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

DEPDC1B基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs206789       rs286148       rs286149       rs286150       rs286151       rs286152       rs286153       rs286154       rs286155       rs286156       rs286157       rs286158       rs286159       rs726268       rs897671       rs897672       rs1026418      

基因表达

基因表达

DEPDC1B基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TAATTCCAGCACTTTGGGAG
57
TCTCATTCCACATGTTGGTC
57
GAATGATCAGGACTACTTTGCA
58
GTAACAAACCTTCGTCACCT
58
CCAGAATGGAATGATCTCCC
57
ACCACATCTCAGAATTCATCAC
58
GTAATTCCAGCACTTTGGGAG
59
CTCATTCCACATGTTGGTCAG
59
GGTGACGAAGGTTTGTTACAG
59
CCTCATCAATAGCTGTAACTTTCTC
59
AGAATGGAATGATCTCCCACC
59
GTACCACATCTCAGAATTCATCAC
59
CAGAATGGAATGATCTCCCAC
58
ACCACATCTCAGAATTCATCAC
58
GGTGACGAAGGTTTGTTACAG
59
CTCATCAATAGCTGTAACTTTCTCC
59
AATTCCAGCACTTTGGGAG
58
TCTCATTCCACATGTTGGTC
57

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

DEPDC1B基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

DEPDC1B基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005096
Q8WUY9 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q8WUY9 (UniProtKB)
TAS
GO:0016477
Q8WUY9 (UniProtKB)
IMP
GO:0030177
Q8WUY9 (UniProtKB)
IMP
GO:0035556
Q8WUY9 (UniProtKB)
IEA
GO:0043547
Q8WUY9 (UniProtKB)
IEA
GO:0051056
Q8WUY9 (UniProtKB)
TAS

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 DEPDC1B基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Moyamoya Disease 0.000542884 2 0 BeFree
Lip and Oral Cavity Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of mouth 0.000271442 1 0 BeFree
Moyamoya disease 1 0.000271442 1 0 BeFree
Vascular Diseases 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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