DDX53 (DEAD-box helicase 53)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
DDX53
locus group:
protein-coding gene
location:
Xp22.11
gene_family:
DEAD box polypeptides
alias symbol:
CAGE|CT26
alias name:
cancer associated gene|cancer/test…
entrez id:
168400
ensembl gene id:
ENSG00000184735
ucsc gene id:
uc004daj.4
refseq accession:
NM_182699
hgnc_id:
HGNC:20083
approved reserved:
2003-06-13

基因染色体位置

基因染色体位置

Xp22.11
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

This intronless gene encodes a protein which contains several domains found in members of the DEAD-box helicase protein family. Other members of this protein family participate in ATP-dependent RNA unwinding. [provided by RefSeq, Sep 2011]

此内含子基因编码包含在DEAD盒解旋酶蛋白家族成员中发现多个域的蛋白质。该蛋白质家族的其它成员参与ATP依赖的RNA解旋。 [由RefSeq的，2011年9月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

DDX53基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs781598715       rs781562382       rs781493806       rs781077232       rs781246826       rs780992934       rs780830568       rs780572425       rs780260278       rs780332722       rs780239895       rs779824742       rs780097081       rs779768341       rs778740345       rs778660059       rs778444531      

基因表达

基因表达

DDX53基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GATGCTAGTCCTTACACCC
57
CTTTGAACATTCAGCTTCCAC
58
ATGCTAGTCCTTACACCCAC
59
ACTTTGAACATTCAGCTTCCAC
60
TACACAGAGTAGGGTACATTGG
59
GTGATGAGGGTAACTGATGTG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

DDX53基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

DDX53基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003723
Q86TM3 (UniProtKB)
IEA
GO:0004004
Q86TM3 (UniProtKB)
IBA
GO:0005524
Q86TM3 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
Q86TM3 (UniProtKB)
IEA
GO:0010501
Q86TM3 (UniProtKB)
IBA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 DDX53基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Colon Carcinoma 0.013843535 51 0 BeFree
Malignant tumor of colon 0.004614512 17 0 BeFree
Liver carcinoma 0.003538676 3 0 BeFree_LHGDN
Colorectal Carcinoma 0.003528744 13 0 BeFree
Stomach Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN
Autistic Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Colorectal Cancer 0.002171535 8 0 BeFree
Stomach Carcinoma 0.001900093 7 0 BeFree
Adenocarcinoma of colon 0.001900093 7 0 BeFree
Malignant neoplasm of testis 0.001628651 6 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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