DDX11-AS1 (DDX11 antisense RNA 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
DDX11-AS1
locus group:
non-coding RNA
location:
12p11.21
gene_family:
alias symbol:
CONCR|SCAT4
alias name:
cohesion regulator noncoding RNA|S…
entrez id:
100506660
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ENSG00000245614
ucsc gene id:
uc001rjq.2
refseq accession:
NR_038927
hgnc_id:
HGNC:44176
approved reserved:
2012-06-30

基因染色体位置

基因染色体位置

12p11.21
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

DDX11-AS1（DEAD/H-Box Helicase 11 Antisense RNA 1）是一种长链非编码RNA（lncRNA），位于人类染色体12p11.21区域，与DDX11基因的启动子区域重叠并以反义方向转录。DDX11-AS1通过调控邻近基因DDX11的表达或其他机制参与多种生物学过程。DDX11属于DEAD-box RNA解旋酶家族，该家族成员具有保守的ATP依赖的RNA解旋酶活性，参与RNA代谢、剪接、核糖体生成等过程。DDX11-AS1可能通过顺式或反式作用影响DDX11的表达或功能，进而影响细胞增殖、DNA修复和基因组稳定性。研究表明，DDX11-AS1在多种癌症中异常表达，如肝细胞癌、胃癌和结直肠癌，其过表达可能通过促进肿瘤细胞增殖、迁移和侵袭参与癌症进展，而敲低DDX11-AS1可抑制这些恶性表型。此外，DDX11-AS1可能作为竞争性内源RNA（ceRNA）吸附miRNA，解除其对靶基因的抑制，从而影响下游信号通路（如Wnt/β-catenin或PI3K/AKT）。DDX11基因突变或功能缺失与遗传性疾病如Warsaw断裂综合征相关，表现为基因组不稳定性、生长迟缓和免疫缺陷，而DDX11-AS1的异常可能通过调控DDX11加剧这类表型。DEAD-box家族基因的共性包括含有保守的DEAD（Asp-Glu-Ala-Asp）结构域，利用ATP水解能量解开RNA二级结构或重塑RNA-蛋白复合物，在转录、翻译和应激响应中起核心作用。DDX11-AS1的功能研究仍处于早期阶段，其具体机制和临床潜力需进一步探索。

None

无

OMIM数据库中对DDX11-AS1基因的介绍     Wikipedia数据库中对DDX11-AS1基因的介绍

基因序列

基因序列

DDX11-AS1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

DDX11-AS1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs28567       rs28568       rs35018       rs35019       rs35020       rs35021       rs35022       rs35023       rs35024       rs35025       rs35026       rs35028       rs35029       rs35030       rs35031       rs35032       rs35033      

基因表达

基因表达

DDX11-AS1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TCAGAAAGTCTGGTTCTGGG
59
ACTCTCCATTACCTGTCATTCC
60
AAGAACAGAACACAAGAACGG
59
GCTTTCTCAAGGGTCTTATGTC
59
AGCGTGCTTATTATGTACCA
57
TTTCTGTTAGAGCTTCAGCC
58
TCAGAAAGTCTGGTTCTGGG
59
ACTCTCCATTACCTGTCATTCC
60
TTCAGAAAGTCTGGTTCTGG
58
CTCTCCATTACCTGTCATTCC
58
TTCAGAAAGTCTGGTTCTGG
58
CTCTCCATTACCTGTCATTCC
58
AGAACAGAACACAAGAACGG
59
GCTTTCTCAAGGGTCTTATGTC
59
AGCGTGCTTATTATGTACCA
57
TTCTGTTAGAGCTTCAGCC
57
GAAAGTCTGGTTCTGGGAG
58
CTCACTCTCCATTACCTGTC
57
AGCGTGCTTATTATGTACCA
57
TCTGTTAGAGCTTCAGCCC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

DDX11-AS1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

DDX11-AS1基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 DDX11-AS1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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