DCAF12 (DDB1 and CUL4 associated factor 12)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
DCAF12
locus group:
protein-coding gene
location:
9p13.3
gene_family:
WD repeat domain containing|DDB1 and CUL4 associated factors
alias symbol:
DKFZP434O125|MGC1058|CT102|TCC52
alias name:
cancer/testis antigen 102
entrez id:
25853
ensembl gene id:
ENSG00000198876
ucsc gene id:
uc003ztt.3
refseq accession:
NM_015397
hgnc_id:
HGNC:19911
approved reserved:
2003-11-21

基因染色体位置

基因染色体位置

9p13.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

This gene encodes a WD repeat-containing protein that interacts with the COP9 signalosome, a macromolecular complex that interacts with cullin-RING E3 ligases and regulates their activity by hydrolyzing cullin-Nedd8 conjugates. [provided by RefSeq, Jul 2009]

该基因编码与COP9 signalosome，与滞-RING E3连接酶相互作用，通过水解滞-NED??D8结合物调节其活性的大分子复杂交互的WD重复含蛋白质。 [由RefSeq的，2009年7月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

DCAF12基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1378       rs1052656       rs1052694       rs1980886       rs1980887       rs2275003       rs2296897       rs2297609       rs3814509       rs4878553       rs4879741       rs4879742       rs4879743       rs4879744       rs4879745       rs4879747       rs4879748      

基因表达

基因表达

DCAF12基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GTAATTCACATTGTTTGGCTGG
59
CGGTTCTTCAAGTAGTATACTAAGG
59
CATCATACAACGTCAAGTCTGTC
59
AACTCACTGACCGGATTCC
59
GTGTAGGAGATGATGGACAC
58
ATAGAACCATCACGTGAGC
57
GTGTAGGAGATGATGGACAC
58
ATAGAACCATCACGTGAGC
57
TAAAGTGTTTGCATCTCAGTGG
59
GACATCTACGACAAATAGCGTG
59
ACAACGTCAAGTCTGTCTG
58
TAGAAACTCACTGACCGGA
58
CTTGTTATGGGTCCAAGCC
59
TTTCATCATGATTCAGCCAGC
59
TAGGAGATGATGGACACAAGG
59
CCATAGAACCATCACGTGAG
58
TAGGAGATGATGGACACAAGG
59
CCATAGAACCATCACGTGAG
58
AAAGTGTTTGCATCTCAGTGG
59
GACATCTACGACAAATAGCGTG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

DCAF12基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

DCAF12基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005737
Q5T6F0 (UniProtKB)
IDA
GO:0005813
Q5T6F0 (UniProtKB)
IDA
GO:0016567
Q5T6F0 (UniProtKB)
IEA
GO:0016567
Q5T6F0 (UniProtKB)
IC
GO:0080008
Q5T6F0 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 DCAF12基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Prostate carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinoma of lung 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of lung 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of prostate 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of testis 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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