CYTH1 (cytohesin 1)

symbol:
CYTH1
locus group:
protein-coding gene
location:
17q25.3
gene_family:
Pleckstrin homology domain containing
alias symbol:
B2-1|D17S811E|cytohesin-1
alias name:
None
entrez id:
9267
ensembl gene id:
ENSG00000108669
ucsc gene id:
uc002jvw.4
refseq accession:
NM_004762
hgnc_id:
HGNC:9501
approved reserved:
1998-11-19
17q25.3
基因染色体位置图

CYTH1(也称为ARNO或 PSCD1)属于细胞分裂素交换因子(CYTH)基因家族,该家族成员主要作为鸟苷酸交换因子(GEFs)调控小G蛋白ARF的活性。CYTH家族共有四个成员(CYTH1-4),它们共享高度保守的Sec7结构域,负责催化ARF蛋白的GDP-GTP交换,从而激活ARF信号通路。CYTH1在细胞中广泛表达,尤其在脑、肾脏和免疫系统中丰度较高,其主要功能包括调控膜运输、细胞骨架重组和细胞迁移等过程。CYTH1通过激活ARF6等小G蛋白,影响内吞作用、突触囊泡循环和神经元发育。在免疫系统中,它参与T细胞受体信号传导和免疫突触形成。突变或异常表达可能导致功能紊乱,例如CYTH1过表达会增强ARF6活性,促进肿瘤细胞侵袭和转移,与乳腺癌、胶质瘤等癌症进展相关。而降低表达则可能损害神经元突触可塑性,影响学习记忆功能。此外,CYTH1与阿尔茨海默病相关,其表达异常可能导致淀粉样前体蛋白(APP)运输障碍,促进β-淀粉样蛋白积累。该基因还与迪乔治综合征部分表型相关,因其位于22q11.2缺失区域附近。CYTH家族成员的共性在于通过Sec7结构域激活ARF,但各成员的组织分布和ARF亚型偏好存在差异,例如CYTH1偏好ARF1/ARF6,而CYTH2更偏向ARF1。这种特异性使得家族成员在特定生理过程中发挥不同作用。

The protein encoded by this gene is a member of the PSCD family. Members of this family have identical structural organization that consists of an N-terminal coiled-coil motif, a central Sec7 domain, and a C-terminal pleckstrin homology (PH) domain. The coiled-coil motif is involved in homodimerization, the Sec7 domain contains guanine-nucleotide exchange protein activity, and the PH domain interacts with phospholipids and is responsible for association of PSCDs with membranes. Members of this family appear to mediate the regulation of protein sorting and membrane trafficking. This gene is highly expressed in natural killer and peripheral T cells, and regulates the adhesiveness of integrins at the plasma membrane of lymphocytes. A pseudogene of this gene has been defined on the X chromosome. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, May 2014]

由该基因编码的蛋白质是PSCD家族的一个成员。该家族的成员具有由N-末端卷曲螺旋基序,一个中央Sec7结构域和C-末端普列克底物蛋白同源(PH)结构域的相同的结构组织。卷曲螺旋基序参与同二聚化,该Sec7域包含鸟嘌呤核苷酸交换的蛋白质的活性,和PH结构域与磷脂相互作用并负责与膜PSCDs的关联。这个家庭的成员似乎介导蛋白排序和膜运输的监管。此基因在天然杀伤和外周T细胞中高度表达,并且在淋巴细胞质膜调节整联的密合性。该基因的假基因已在X染色体上被定义。选择性剪接结果在多个抄本变形。 [由RefSeq的,2014年5月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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CYTH1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs6728       rs900354       rs922838       rs1042289       rs1126607       rs1126611       rs1126612       rs1126615       rs1139101       rs1384365       rs1384366       rs1384367       rs1552173       rs1552174       rs1552175       rs1804434       rs1871935      

CYTH1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGTAAGGAAACAAGATGGTCCT
60
AGTTCTTGACGCTCCTCTG
59
CTTGGCCCTAGATACTCCT
58
GATCATCTTCCTGCTCCTG
57
GCCTTTACTACTTTGAGTATACCAC
59
AAAGCTCAAAGCAGTTTGGT
59
AGAGGAGCGTCAAGAACTG
59
CTATCTCATCCTTCAGCCTCTG
60
CACATGCTAGGCTGAAGGA
60
TACCTGTTTGTTCCTCTGCA
59
CTACGTTCCCAGTGACCTG
60
TACCTGAATGTCAGCCAGC
60
GGAACCACACTGTTTACCG
59
TGATGGCTGCTTTAATGCA
58
CCTTTACTACTTTGAGTATACCACG
59
AAAGCTCAAAGCAGTTTGGT
59
AGAGGAGCGTCAAGAACTG
59
TATCTCATCCTTCAGCCTCTG
59
GGGAACCACACTGTTTACC
58
GATGGCTGCTTTAATGCAC
58
      尚未收录相关数据

CYTH1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CYTH1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005086
K7EKA2 (UniProtKB)
IEA
GO:0032012
K7EKA2 (UniProtKB)
IEA
GO:0043547
K7EKA2 (UniProtKB)
IEA
GO:0005086
K7ENH6 (UniProtKB)
IEA
GO:0032012
K7ENH6 (UniProtKB)
IEA
GO:0043547
K7ENH6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005086
K7ENQ8 (UniProtKB)
IEA
GO:0032012
K7ENQ8 (UniProtKB)
IEA
GO:0043547
K7ENQ8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005086
K7ERV8 (UniProtKB)
IEA
GO:0032012
K7ERV8 (UniProtKB)
IEA
GO:0043547
K7ERV8 (UniProtKB)
IEA
GO:0000139
Q15438 (UniProtKB)
TAS
GO:0000139
Q15438 (UniProtKB)
TAS
GO:0005086
Q15438 (UniProtKB)
IDA
GO:0005515
Q15438 (UniProtKB)
IPI
GO:0005737
Q15438 (UniProtKB)
IDA
GO:0005829
Q15438 (UniProtKB)
ISS
GO:0005829
Q15438 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
Q15438 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
Q15438 (UniProtKB)
IDA
GO:0008289
Q15438 (UniProtKB)
IEA
GO:0016192
Q15438 (UniProtKB)
TAS
GO:0030155
Q15438 (UniProtKB)
IDA
GO:0031234
Q15438 (UniProtKB)
ISS
GO:0032012
Q15438 (UniProtKB)
IEA
GO:0043547
Q15438 (UniProtKB)
IEA
GO:0043547
Q15438 (UniProtKB)
IEA

可能调控 CYTH1基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Acute leukemia 0.000271442 1 0 BeFree

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