CYP27B1 (cytochrome P450 family 27 subfamily B member 1)

symbol:
CYP27B1
locus group:
protein-coding gene
location:
12q14.1
gene_family:
Cytochrome P450s
alias symbol:
CYP1|P450c1
alias name:
VDDR I|1alpha(OH)ase|25-Hydroxyvit…
entrez id:
1594
ensembl gene id:
ENSG00000111012
ucsc gene id:
uc001spz.2
refseq accession:
NM_000785
hgnc_id:
HGNC:2606
approved reserved:
1998-03-24
12q14.1
基因染色体位置图

CYP27B1基因属于细胞色素P450超家族(CYP基因家族),该家族成员主要编码参与药物代谢和类固醇合成的酶。CYP27B1编码25-羟基维生素D3 1α-羟化酶,负责将25-羟基维生素D转化为具有生物活性的1,25-二羟基维生素D(骨化三醇),这是维生素D代谢的关键步骤。该酶主要在肾脏近端小管细胞中表达,但也存在于其他组织如皮肤、免疫细胞和甲状旁腺中。1,25-二羟基维生素D通过与维生素D受体结合调节钙磷代谢、骨骼发育、免疫调节和细胞分化等重要生理过程。CYP27B1基因突变会导致维生素D依赖性佝偻病1A型(VDDR1A),表现为低钙血症、低磷血症、佝偻病和继发性甲状旁腺功能亢进。突变可能使酶活性降低或丧失,导致1,25-二羟基维生素D合成不足。CYP27B1过表达可能导致1,25-二羟基维生素D水平升高,引起高钙血症、肾结石和组织钙化;而表达降低则与维生素D缺乏、骨质疏松和免疫功能异常相关。该基因受甲状旁腺激素(PTH)、低血钙和低血磷的正向调节,而1,25-二羟基维生素D本身通过负反馈抑制其表达。CYP27B1还与多种疾病相关,包括慢性肾病(继发性维生素D缺乏)、自身免疫性疾病(如多发性硬化)和某些癌症。在CYP基因家族中,成员共享典型的血红素结合结构域,利用分子氧催化各种底物的羟基化反应,但各成员具有不同的组织分布和底物特异性。

This gene encodes a member of the cytochrome P450 superfamily of enzymes. The cytochrome P450 proteins are monooxygenases which catalyze many reactions involved in drug metabolism and synthesis of cholesterol, steroids and other lipids. The protein encoded by this gene localizes to the inner mitochondrial membrane where it hydroxylates 25-hydroxyvitamin D3 at the 1alpha position. This reaction synthesizes 1alpha,25-dihydroxyvitamin D3, the active form of vitamin D3, which binds to the vitamin D receptor and regulates calcium metabolism. Thus this enzyme regulates the level of biologically active vitamin D and plays an important role in calcium homeostasis. Mutations in this gene can result in vitamin D-dependent rickets type I. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码的酶的细胞色素P450超家族的成员。细胞色素P450蛋白是能催化涉及药物代谢和胆固醇,类固醇和其他脂类的合成许多反应单加氧酶。由该基因编码的蛋白质定位于线粒体内膜的地方羟化25-羟基维生素D3在1α的位置。这个反应来合成1α的,25二羟基维生素D3,维生素D3,其结合到维生素D受体和调节钙的代谢活性形式。因此,这个酶调节生物活性的维生素D的水平和起着钙稳态中起重要作用。在这个基因的突变可导致维生素D依赖性佝偻病I型[由RefSeq的,2008年7月提供]

CYP27B1基因的碱基序列:[NCBI]
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CYP27B1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs703842       rs2229103       rs2307096       rs2427640       rs2454751       rs3782130       rs4646536       rs4646537       rs7965963       rs8176339       rs8176340       rs8176342       rs8176343       rs8176344       rs8176345       rs8176346       rs8176347      

CYP27B1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CCCAGGTATCCAAGTGTCC
60
GAGCCTTTGCCATTCTTCG
60
TTGGCCCAGATCCTAACAC
59
CCTTTCAGGTACCAGGACAG
60
CCTCGACCGAGATGATCAG
60
GAGCCTTTGCCATTCTTCG
60
GATGTTTGCATTTGCTCAGAG
59
CAGACTCCAGGTCCTTCTC
59
TCTCTTAAAGAAGGTGCAGGG
60
GAGCCTTTGCCATTCTTCG
60
TTGGCCCAGATCCTAACAC
59
CCTTTCAGGTACCAGGACAG
60
ACTCAGAGATCACAGCTGC
60
CACAGGGTACAGTCTTAGCA
59
GATGTTTGCATTTGCTCAGAG
58
CAGACTCCAGGTCCTTCTC
58
CTCGACCGAGATGATCAGAG
60
GAGCCTTTGCCATTCTTCG
60
TGTTTGCATTTGCTCAGAGG
60
CAGACTCCAGGTCCTTCTC
59
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
GFI1
CYP27B1
Repression
NFKB1
CYP27B1
Unknown
RELA
CYP27B1
Unknown

CYP27B1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CYP27B1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0004497
F8VWR7 (UniProtKB)
IEA
GO:0005506
F8VWR7 (UniProtKB)
IEA
GO:0016705
F8VWR7 (UniProtKB)
IEA
GO:0020037
F8VWR7 (UniProtKB)
IEA
GO:0055114
F8VWR7 (UniProtKB)
IEA
GO:0004498
O15528 (UniProtKB)
IDA
GO:0004498
O15528 (UniProtKB)
IDA
GO:0004498
O15528 (UniProtKB)
IDA
GO:0004498
O15528 (UniProtKB)
IDA
GO:0004498
O15528 (UniProtKB)
TAS
GO:0005506
O15528 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
O15528 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
O15528 (UniProtKB)
IDA
GO:0005739
O15528 (UniProtKB)
ISS
GO:0005739
O15528 (UniProtKB)
TAS
GO:0005741
O15528 (UniProtKB)
TAS
GO:0006766
O15528 (UniProtKB)
TAS
GO:0006816
O15528 (UniProtKB)
ISS
GO:0008285
O15528 (UniProtKB)
IDA
GO:0010956
O15528 (UniProtKB)
IDA
GO:0010980
O15528 (UniProtKB)
IDA
GO:0020037
O15528 (UniProtKB)
IEA
GO:0030282
O15528 (UniProtKB)
IEP
GO:0030308
O15528 (UniProtKB)
IMP
GO:0030500
O15528 (UniProtKB)
IMP
GO:0032496
O15528 (UniProtKB)
IDA
GO:0033280
O15528 (UniProtKB)
IDA
GO:0034341
O15528 (UniProtKB)
IDA
GO:0036378
O15528 (UniProtKB)
IDA
GO:0036378
O15528 (UniProtKB)
IDA
GO:0036378
O15528 (UniProtKB)
IDA
GO:0036378
O15528 (UniProtKB)
IDA
GO:0042359
O15528 (UniProtKB)
IDA
GO:0042359
O15528 (UniProtKB)
TAS
GO:0042369
O15528 (UniProtKB)
IEA
GO:0043627
O15528 (UniProtKB)
IEP
GO:0045618
O15528 (UniProtKB)
IMP
GO:0046697
O15528 (UniProtKB)
IEP
GO:0055074
O15528 (UniProtKB)
IMP
GO:0055114
O15528 (UniProtKB)
IEA
GO:0070314
O15528 (UniProtKB)
IMP
GO:0070564
O15528 (UniProtKB)
IDA
GO:0005506
V9GYP0 (UniProtKB)
IEA
GO:0016705
V9GYP0 (UniProtKB)
IEA
GO:0020037
V9GYP0 (UniProtKB)
IEA
GO:0055114
V9GYP0 (UniProtKB)
IEA

可能调控 CYP27B1基因的相关microRNA:     

IntAct

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Vitamin D-dependent rickets, type 1 0.445428837 22 14 BeFree_CLINVAR_CTD_human_MGD_UNIPROT
Multiple Sclerosis 0.132258492 21 1 BeFree_GAD_GWASCAT
Rickets 0.125428837 21 0 BeFree_CTD_human
Hypercalcemia 0.121085767 5 0 BeFree_CTD_human
Polymyositis 0.12 1 0 CTD_human
Acute kidney injury 0.08 1 0 RGD
Hepatolenticular Degeneration 0.08 1 0 RGD
Nephrosis 0.08 1 0 RGD
Acidosis 0.08 1 0 RGD
Diabetes Mellitus, Experimental 0.08 1 0 RGD

联系方式

山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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