CWH43 (cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CWH43
locus group:
protein-coding gene
location:
4p11
gene_family:
alias symbol:
FLJ21511|CWH43-C|PGAP2IP
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None
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80157
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uc003gyv.4
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NM_025087
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HGNC:26133
approved reserved:
2009-07-28

基因染色体位置

基因染色体位置

4p11
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

CWH43（也称为SUR4）是酵母中一个重要的基因，编码一种跨膜蛋白，主要参与细胞壁的生物合成和维持细胞壁的完整性。该蛋白定位于内质网和高尔基体，通过调控糖基磷脂酰肌醇（GPI）锚定蛋白的合成和运输，影响细胞壁的组装和稳定性。CWH43属于SUR基因家族，该家族成员通常与膜运输和脂质代谢相关，尤其在鞘脂类和GPI锚定蛋白的合成中起关键作用。CWH43的功能缺失或突变会导致细胞壁缺陷，表现为对细胞壁压力（如高温、高渗或某些抗生素）的敏感性增加，并可能影响酵母的形态和生长速率。此外，CWH43的突变还与某些人类疾病相关，如神经退行性疾病和癌症，因为GPI锚定蛋白的异常与这些病理过程密切相关。如果CWH43过表达，可能会增强细胞壁的稳定性，提高酵母对环境压力的耐受性，但过度活跃的GPI锚定蛋白合成也可能干扰正常的膜运输和信号传导。相反，降低CWH43表达会导致细胞壁脆弱，增加细胞裂解的风险，并可能影响其他依赖GPI锚定蛋白的细胞过程，如免疫应答和细胞粘附。SUR基因家族的共性在于它们大多编码膜相关蛋白，参与脂质修饰和运输，尤其在鞘脂代谢和GPI锚定蛋白的生物合成中发挥核心作用。这一家族的基因在真核生物中高度保守，表明其在细胞膜结构和功能中的重要性。

None

无

OMIM数据库中对CWH43基因的介绍     Wikipedia数据库中对CWH43基因的介绍

基因序列

基因序列

CWH43基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CWH43基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs936134       rs936135       rs1051447       rs1350121       rs1350122       rs1350123       rs1350125       rs1378723       rs1840629       rs1840630       rs1840631       rs2085293       rs2260962       rs2355166       rs2355167       rs2572344       rs2605231      

基因表达

基因表达

CWH43基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGCTCAATGAAACAGGTGC
59
ACATGGTTAAGTCATTGTTCCC
59
CTAACCCATTTGGAGGTGC
59
AACCAGTACCACGAAACCA
59
ATCACTATTGGCAGCATAGC
58
ATCAGTGAGGAAGACACCC
59
CTAGAGAAAGATCAGATGTGCT
58
CAAATAGCATATTCAGCCCG
57
CTAACCCATTTGGAGGTGC
59
AACCAGTACCACGAAACCA
59
GCTCAATGAAACAGGTGCA
59
CCTAGCCACATGGTTAAGTC
58
GCTCAATGAAACAGGTGCA
59
ACATGGTTAAGTCATTGTTCCC
59
TAACCCATTTGGAGGTGCA
59
AACCAGTACCACGAAACCA
59
CACTATTGGCAGCATAGCC
59
TATCAGTGAGGAAGACACCC
59
GCTAGAGAAAGATCAGATGTGC
59
AAATAGCATATTCAGCCCGA
57

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CWH43基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CWH43基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
D6RDZ8 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
E7EQL2 (UniProtKB)
IEA
GO:0006506
Q9H720 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
Q9H720 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CWH43基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Hepatitis C, Chronic 0.002367032 1 1 GAD

基因相关服务

基因相关服务

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