CTIF (cap binding complex dependent translation initiation factor)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CTIF
locus group:
protein-coding gene
location:
18q21.1
gene_family:
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None
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9811
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ENSG00000134030
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uc002ldc.4
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NM_014772
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HGNC:23925
approved reserved:
2003-12-15

基因染色体位置

基因染色体位置

18q21.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

CTIF（cap-binding complex-dependent translation initiation factor）是一个在真核生物中参与蛋白质翻译起始的关键基因，属于翻译起始因子家族。它的主要功能是与帽子结合复合物（CBC）相互作用，促进mRNA的5'端帽子结构识别，从而启动翻译过程。CTIF通过与CBP80（帽子结合蛋白80）结合，帮助核糖体正确结合到mRNA上，确保翻译的准确性和效率。CTIF在细胞质中发挥作用，特别是在神经元等高度依赖翻译调控的细胞类型中尤为重要。CTIF的突变可能导致翻译起始缺陷，影响蛋白质合成，进而引发神经发育障碍或神经退行性疾病。研究表明，CTIF的功能异常可能与某些神经系统疾病如自闭症谱系障碍（ASD）和肌萎缩侧索硬化症（ALS）有关。当CTIF过表达时，可能增强翻译起始效率，导致某些蛋白质的过量产生，可能影响细胞稳态或信号通路；而CTIF表达降低则可能导致翻译效率下降，影响细胞生长、分化和功能，特别是在神经元中可能引起突触可塑性和认知功能的障碍。CTIF属于翻译起始因子家族，该家族的成员通常参与mRNA的识别、核糖体组装和翻译起始的调控，共同特点是能够与mRNA的特定结构（如5'帽子或内部核糖体进入位点IRES）结合，并与其他翻译起始因子协同作用。CTIF的功能与其他翻译起始因子如eIF4E和eIF4G有部分重叠，但其依赖CBC的特性使其在特定mRNA的翻译调控中具有独特作用。

CTIF is a component of the CBP80 (NCBP1; MIM 600469)/CBP20 (NCBP2; MIM 605133) translation initiation complex that binds cotranscriptionally to the cap end of nascent mRNA. The CBP80/CBP20 complex is involved in a simultaneous editing and translation step that recognizes premature termination codons (PTCs) in mRNAs and directs PTC-containing mRNAs toward nonsense-mediated decay (NMD). On mRNAs without PTCs, the CBP80/CBP20 complex is replaced with cytoplasmic mRNA cap-binding proteins, including EIF4G (MIM 600495), and steady-state translation of the mRNAs resumes in the cytoplasm (Kim et al., 2009 [PubMed 19648179]).[supplied by OMIM, Dec 2009]

CTIF是CBP80的一个组成部分（NCBP1; MIM 600469）/ CBP20（NCBP2; MIM 605133）翻译起始的cotranscriptionally结合到新生的mRNA的帽结束复杂。的CBP80 / CBP20复杂涉及同时编辑和翻译步骤，在mRNA的识别提前终止密码子（PTC）的，并指示含有PTC-朝向无义介导降解（NMD）的mRNA。上没有的PTC的mRNA，所述CBP80 / CBP20复合置换细胞质mRNA帽结合蛋白，包括EIF4G（MIM 600495），并在细胞质中恢复的mRNA的稳态翻译（Kim等人，2009 [搜索PubMed 19648179] ）[由OMIM，2009年12月提供]

OMIM数据库中对CTIF基因的介绍     Wikipedia数据库中对CTIF基因的介绍

基因序列

基因序列

CTIF基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CTIF基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs58964       rs169936       rs172500       rs177259       rs182457       rs184186       rs188497       rs190957       rs299702       rs299703       rs299704       rs299705       rs299706       rs299707       rs299708       rs299709       rs299710      

基因表达

基因表达

CTIF基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AAGGTACCGGATGAAGTGG
59
CATGCTGTTCAGGATCTCG
58
AACAGAAGAATGGACAGCG
58
GAGAGTTGTCTTTGCTGCC
59
CTTCATCGACAGCTACGTG
58
TGTCTTTGCTGCCATTCTG
58
CCATCTACACCTGCCTCAG
60
ACTCTGCAGCTCCATAGAG
59
CCATCTACACCTGCCTCAG
60
ACTCTGCAGCTCCATAGAG
59
CTTCGATTCCTTCAGTGGTG
59
ATTCAGGTTGATGCCATCC
58
CACATCTCCCAGTGGACAG
60
GAAGGAATCGAAGGTGTTGG
59
CACATCTCCCAGTGGACAG
60
TTGTCTTTGCTGCCATTCTG
60
CACCCATGAAAGGCTTAACAG
59
TTGTCTTTGCTGCCATTCTG
59
TAGCCAATTAGGGTGTGGA
58
TTCAGGTAAACTTGTGCCC
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CTIF基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CTIF基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000184
O43310 (UniProtKB)
IMP
GO:0003723
O43310 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
O43310 (UniProtKB)
IPI
GO:0005737
O43310 (UniProtKB)
IDA
GO:0006446
O43310 (UniProtKB)
IMP
GO:0048471
O43310 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CTIF基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Parkinson Disease 0.002367032 1 1 GAD
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD

基因相关服务

基因相关服务

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