CTAGE5 (CTAGE family, member 5)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CTAGE5
locus group:
protein-coding gene
location:
14q21.1
gene_family:
Cutaneous T-cell-lymphoma-associated antigen family
alias symbol:
MEA6|cTAGE-5A|cTAGE-5B|cTAGE-5C|cTAGE-5D|MGEA11
alias name:
entrez id:
4253
ensembl gene id:
ENSG00000150527
ucsc gene id:
uc001wvg.4
refseq accession:
NM_005930
hgnc_id:
HGNC:7057
approved reserved:
1998-01-07T00:00:00Z

基因染色体位置

基因染色体位置

14q21.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

The protein encoded by this gene is a tumor-associated antigen found in cutaneous T-cell lymphoma and several other cancers. Autoantibodies against the encoded protein have been found in some cancers. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2011]

由该基因编码的蛋白质是在皮肤T细胞淋巴瘤和其他一些癌症中发现肿瘤相关抗原。针对所编码的蛋白质的自身抗体已在一些癌症被发现。已发现该基因编码不同亚型的几个抄本变形。 [由RefSeq的，2011年10月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CTAGE5基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs8177       rs373755       rs378162       rs387127       rs436691       rs449396       rs453968       rs956108       rs956109       rs1040810       rs1040811       rs1060878       rs1140952       rs1140959       rs1570132       rs1570133       rs1594842      

基因表达

基因表达

CTAGE5基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CAAGATGAATTGATGGCGGA
59
CAGCTACTTGTGATTTGAGGG
59
GACCTATAGAAAGCGAGCC
58
GAATCTTTGGCTCCTGGGA
59
TTGCTCTAATGCTTTCTGGA
57
CTCTACTTCATAGCCTTCATACTC
58
ATGTTTGGAGCTTCTCGAG
58
GTGGATAGACATTTCTCATTGC
58
GCCATGTTTGGAGCTTCTC
59
CATTTCTCATTGCAAATGGAGC
59
CAAGATGAATTGATGGCGGA
59
AGCTACTTGTGATTTGAGGGA
59
TTGCTCTAATGCTTTCTGGAC
59
CTCTACTTCATAGCCTTCATACTC
58
ACCTATAGAAAGCGAGCCA
58
AGAATCTTTGGCTCCTGGG
59
ACCTATAGAAAGCGAGCCA
58
GAATCTTTGGCTCCTGGGA
59
CAAGATGAATTGATGGCGG
57
AGCTACTTGTGATTTGAGGG
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CTAGE5基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CTAGE5基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
G3V3C4 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
G3V5K6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
O15320 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O15320 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O15320 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O15320 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O15320 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O15320 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O15320 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O15320 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O15320 (UniProtKB)
IPI
GO:0005789
O15320 (UniProtKB)
TAS
GO:0005789
O15320 (UniProtKB)
TAS
GO:0005789
O15320 (UniProtKB)
TAS
GO:0006888
O15320 (UniProtKB)
TAS
GO:0008047
O15320 (UniProtKB)
TAS
GO:0016020
O15320 (UniProtKB)
IDA
GO:0043085
O15320 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CTAGE5基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Meningioma 0.000814326 3 0 BeFree
Meningioma, benign, no ICD-O subtype 0.000814326 3 0 BeFree
Lymphoma, T-Cell, Cutaneous 0.000271442 1 0 BeFree
Colon Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Fahr's syndrome (disorder) 0.000271442 1 1 BeFree
melanoma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话： 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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