CTAGE3P (CTAGE family member 3, pseudogene)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CTAGE3P
locus group:
pseudogene
location:
13q14.3
gene_family:
Cutaneous T-cell-lymphoma-associated antigen family
alias symbol:
cTAGE-3
alias name:
cutaneous T-cell lymphoma-associat…
entrez id:
220112
ensembl gene id:
ENSG00000232872
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NG_006514
hgnc_id:
HGNC:24348
approved reserved:
2004-05-27

基因染色体位置

基因染色体位置

13q14.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

CTAGE3P（Cutaneous T-cell Lymphoma-Associated Antigen 3 Pseudogene）是一个假基因，属于CTAGE基因家族的一部分。假基因通常是由功能基因复制或逆转录转座产生的非功能性序列，缺乏完整的开放阅读框或调控元件，因此不编码功能性蛋白质。CTAGE基因家族主要与皮肤T细胞淋巴瘤（CTCL）相关，其成员通常编码跨膜蛋白，参与细胞间相互作用或信号传导。CTAGE3P作为假基因，可能通过调控其同源功能基因的表达或作为竞争性内源RNA（ceRNA）影响相关通路。目前关于CTAGE3P的具体生物学功能研究较少，但假基因通常可能在基因表达调控中发挥作用，例如通过竞争miRNA结合位点来影响功能基因的表达水平。CTAGE3P的突变或表达变化可能通过干扰其同源功能基因的调控网络间接影响细胞功能，但目前尚无明确证据表明其与特定疾病直接相关。CTAGE基因家族的共性包括与癌症（尤其是皮肤T细胞淋巴瘤）的潜在关联，以及编码的蛋白质可能参与免疫调节或细胞粘附过程。如果CTAGE3P过表达，可能通过ceRNA机制影响其同源功能基因或其他相关基因的表达，从而干扰正常细胞功能；而降低表达可能减弱这种调控作用。由于假基因的功能研究尚处于早期阶段，CTAGE3P的具体影响仍需进一步实验验证。

None

无

OMIM数据库中对CTAGE3P基因的介绍     Wikipedia数据库中对CTAGE3P基因的介绍

基因序列

基因序列

CTAGE3P基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CTAGE3P基因的碱基突变：           仅显示部分snp

基因表达

基因表达

CTAGE3P基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CCTGCTGGAAATGAAGTGAG
59
CTCTGATTGAAGCAAGAGGT
58
CCCTGCTGGAAATGAAGTG
59
TCTGATTGAAGCAAGAGGTG
58
TTCAGGAAAGCCAGAAACAG
58
TCACTCACTTGTTCTTTCCA
57

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CTAGE3P基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CTAGE3P基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005575
Q8IX95 (UniProtKB)
ND
GO:0008150
Q8IX95 (UniProtKB)
ND

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CTAGE3P基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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