CTAG2 (cancer/testis antigen 2)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CTAG2
locus group:
protein-coding gene
location:
Xq28
gene_family:
alias symbol:
LAGE-1|CAMEL|LAGE1|ESO2|MGC3803|MGC138724|CT6.2a|CT6.2b|LAGE-1a|LAGE-1b
alias name:
CTL-recognized antigen on melanoma…
entrez id:
30848
ensembl gene id:
ENSG00000126890
ucsc gene id:
uc004fmh.3
refseq accession:
NM_020994
hgnc_id:
HGNC:2492
approved reserved:
2000-08-22

基因染色体位置

基因染色体位置

Xq28
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

This gene encodes an autoimmunogenic tumor antigen that belongs to the ESO/LAGE family of cancer-testis antigens. This protein is expressed in a wide array of cancers including melanoma, breast cancer, bladder cancer and prostate cancer. This protein is also expressed in normal testis tissue. An alternative open reading frame product of this gene has been described in PMID:10399963. This alternate protein, termed CAMEL, is a tumor antigen that is recognized by melanoma-specific cytotoxic T-lymphocytes. Alternate splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Sep 2013]

这个基因编码属于该ESO / LAGE家族癌症 - 睾丸抗原的autoimmunogenic肿瘤抗原。这种蛋白是在广泛的癌症，包括黑色素瘤，乳腺癌，膀胱癌和前列腺癌中表达。这种蛋白也以正常睾丸组织中表达。该基因的可替代开放阅读框架产品已在PMID已经描述：10399963。此替代的蛋白质，称为CAMEL，是受特定黑素瘤细胞毒性T淋巴细胞识别的肿瘤抗原。选择性剪接结果在多个抄本变形。 [由RefSeq的，2013年9月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CTAG2基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs782810865       rs782805111       rs782803654       rs782803839       rs782800450       rs782790185       rs782786808       rs782781877       rs782759822       rs782761748       rs782753339       rs782751176       rs782747935       rs782735777       rs782717473       rs782712717       rs782711002      

基因表达

基因表达

CTAG2基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGCTTGAGTTGCACATCAC
59
GTGAAGTCCTTCAGAACCG
58
CTGTTTATCCGACTGACTGC
59
ACATCAACAGGGAAAGCTG
58
TGCTTGAGTTGCACATCAC
59
GTGAAGTCCTTCAGAACCG
58
CTGTTTATCCGACTGACTGC
59
CATCAACAGGGAAAGCTGC
60
CTTGAGTTGCACATCACGA
58
GGTGAAGTCCTTCAGAACC
57
CTTGAGTTGCACATCACGA
59
GGTGAAGTCCTTCAGAACC
58
CTGTTTATCCGACTGACTGC
59
ATCAACAGGGAAAGCTGCT
60
CTTGAGTTGCACATCACGA
58
GTGAAGTCCTTCAGAACCG
58
CTTGAGTTGCACATCACGA
59
GTGAAGTCCTTCAGAACCG
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CTAG2基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CTAG2基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003674
O75638 (UniProtKB)
ND
GO:0005515
O75638 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O75638 (UniProtKB)
IPI
GO:0005813
O75638 (UniProtKB)
IDA
GO:0008150
O75638 (UniProtKB)
ND

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CTAG2基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
melanoma 0.004353001 6 0 BeFree_LHGDN
Multiple Myeloma 0.003267234 3 0 BeFree_LHGDN
Esophageal Neoplasms 0.002995792 1 0 BeFree_LHGDN
Adenocarcinoma 0.00272435 1 0 LHGDN
ovarian neoplasm 0.00272435 1 0 LHGDN
Squamous cell carcinoma 0.00272435 1 0 LHGDN
Stomach Neoplasms 0.002367032 1 0 GAD
Malignant neoplasm of testis 0.001085767 4 0 BeFree
Prostate carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Carcinoma, Transitional Cell 0.000542884 2 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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