CTAG1B (cancer/testis antigen 1B)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CTAG1B
locus group:
protein-coding gene
location:
Xq28
gene_family:
alias symbol:
NY-ESO-1|LAGE2B|LAGE2A|ESO1|CT6.1
alias name:
None
entrez id:
1485
ensembl gene id:
ENSG00000184033
ucsc gene id:
uc004fmf.1
refseq accession:
NM_001327
hgnc_id:
HGNC:2491
approved reserved:
1998-06-22

基因染色体位置

基因染色体位置

Xq28
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

The protein encoded by this gene is an antigen that is overexpressed in many cancers but that is also expressed in normal testis. This gene is found in a duplicated region of the X-chromosome and therefore has a neighboring gene of identical sequence. [provided by RefSeq, Jan 2012]

由该基因编码的蛋白质是在许多癌症中过度表达，但是，可以在正常睾丸中表达的抗原。该基因在X染色体的复制区域被发现，因此具有相同的序列的相邻基因。 [由RefSeq的，2012年1月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CTAG1B基因的碱基突变：           仅显示部分snp

基因表达

基因表达

CTAG1B基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATACTGACTATCCGACTGACTG
59
ATCAACAGGGAAAGCTGCT
60
TGCTTGAGTTCTACCTCGC
60
AACTCCTTCAGAAGCACCC
60
TGCTTGAGTTCTACCTCGC
60
AACTCCTTCAGAAGCACCC
60
CTTGAGTTCTACCTCGCCA
59
GAACTCCTTCAGAAGCACC
58
CTTGAGTTCTACCTCGCCA
59
GAACTCCTTCAGAAGCACC
58
ACTGACTATCCGACTGACTG
59
CATCAACAGGGAAAGCTGC
60
CTTGAGTTCTACCTCGCCA
59
AACTCCTTCAGAAGCACCC
60
ACTGACTATCCGACTGACTG
59
ATCAACAGGGAAAGCTGCT
60
CTTGAGTTCTACCTCGCCA
59
AACTCCTTCAGAAGCACCC
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CTAG1B基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CTAG1B基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CTAG1B基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malignant neoplasm of testis 0.014386419 53 0 BeFree
melanoma 0.008696071 23 0 BeFree_LHGDN
ovarian neoplasm 0.008173051 3 0 LHGDN
Prostatic Neoplasms 0.0054487 2 0 LHGDN
Lung Neoplasms 0.0054487 2 0 LHGDN
Liver carcinoma 0.004624443 8 0 BeFree_LHGDN
Multiple Myeloma 0.004624443 8 0 BeFree_LHGDN
Esophageal Neoplasms 0.003538676 3 0 BeFree_LHGDN
Mammary Neoplasms 0.002995792 2 0 BeFree_LHGDN
Carcinosarcoma 0.00272435 1 0 LHGDN

基因相关服务

基因相关服务

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