CT55 (cancer/testis antigen 55)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CT55
locus group:
protein-coding gene
location:
Xq26.3
gene_family:
alias symbol:
FLJ20527
alias name:
None
entrez id:
54967
ensembl gene id:
ENSG00000169551
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NM_017863
hgnc_id:
HGNC:26047
approved reserved:
2004-11-08

基因染色体位置

基因染色体位置

Xq26.3
基因染色体位置图

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CT55基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs782819590       rs782811891       rs782805119       rs782808130       rs782804609       rs782790948       rs782788824       rs782785117       rs782785322       rs782779795       rs782780501       rs782777436       rs782777276       rs782763383       rs782759019       rs782757854       rs782756251      

基因表达

基因表达

CT55基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATATTCCACTGAGCCAGGC
60
AGTAATGCAGACCTCTTCCG
60
ATATTCCACTGAGCCAGGC
59
AGTAATGCAGACCTCTTCCG
59
AGTGCATAAATCCAGCAGC
59
TTAAATGCTTTGGCTCCGAC
59
GAATATTCCACTGAGCCAGG
58
TAATGCAGACCTCTTCCGT
58
AGTGCATAAATCCAGCAGC
59
TTAAATGCTTTGGCTCCGA
58
GAATATTCCACTGAGCCAGG
58
TAATGCAGACCTCTTCCGT
58
ATATTCCACTGAGCCAGGC
59
GTAATGCAGACCTCTTCCGT
59
AGTGCATAAATCCAGCAGC
59
TAAATGCTTTGGCTCCGAC
59
ATATTCCACTGAGCCAGGC
60
GTAATGCAGACCTCTTCCGT
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CT55基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CT55基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005515
Q8WUE5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8WUE5 (UniProtKB)
IPI

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CT55基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Breast Carcinoma 0.000814326 3 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000814326 3 0 BeFree
FANCONI ANEMIA, COMPLEMENTATION GROUP A (disorder) 0.000271442 1 0 BeFree
Ovarian Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Breast Cancer, Familial 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of ovary 0.000271442 1 0 BeFree
Prostate cancer, familial 0.000271442 1 0 BeFree
Fanconi Anemia 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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