CT47A9 (cancer/testis antigen family 47 member A9)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CT47A9
locus group:
protein-coding gene
location:
Xq24
gene_family:
alias symbol:
CT47.9
alias name:
cancer/testis CT47 family, member 9
entrez id:
728042
ensembl gene id:
ENSG00000226600
ucsc gene id:
uc004etc.4
refseq accession:
NM_001080138
hgnc_id:
HGNC:33290
approved reserved:
2009-03-09

基因染色体位置

基因染色体位置

Xq24

基因简述

基因简述

CT47A9（癌症/睾丸抗原家族47成员A9）属于CT抗原基因家族，这是一类在多种癌症中异常表达但在正常组织中仅限于睾丸和胎盘表达的基因家族。CT抗原家族成员通常具有高度免疫原性，在肿瘤发生、免疫逃逸和癌症进展中起重要作用。CT47A9位于X染色体上，其编码的蛋白质功能尚未完全明确，但与其他CT抗原类似，它可能参与细胞增殖、分化或免疫调节。研究表明CT47A9在多种恶性肿瘤如肺癌、乳腺癌和黑色素瘤中过表达，可能与肿瘤的恶性表型相关。该基因的突变或表达异常可能影响肿瘤细胞的免疫原性，使其逃避免疫监视。CT47A9过表达可能促进肿瘤生长、转移或耐药性，而降低其表达可能抑制肿瘤进展。由于CT抗原在正常组织中表达受限，CT47A9被认为是潜在的癌症免疫治疗靶点。目前关于CT47A9的具体分子机制和下游通路仍需进一步研究，但它在癌症诊断、预后评估和靶向治疗方面具有重要价值。CT抗原家族成员的共性包括：癌症特异性表达模式、多基因家族特征、位于X染色体上以及可能参与生殖细胞发育和肿瘤发生。

中文English

此轨迹表示癌症/睾丸基因家族47.这一家族的成员，也称为CT47，是由13在Xq24群集几乎相同的基因座。 [由RefSeq的，2010年9月提供]

OMIM数据库中对CT47A9基因的介绍     Wikipedia数据库中对CT47A9基因的介绍

基因序列

基因序列

CT47A9基因的碱基序列：[NCBI]
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编码蛋白质

编码蛋白质

蛋白质序列
1MSATGDRHPT QGDQEAPVSQ EGAQAEAAGA GNQEGGDSGP
41DSSDVVPAAE VVGVAGPVEG LGEEEGEQAA GLAAVPRGGS
81 AEEDSDIGP ATEEEEEEEG NEAANFDLAV VARRYPASGI
121HFVLLDMVHS LLHRLSHNDH ILIENRQLSR LMVGPHAAAR
161N LWGNLPPL LLPQRLGAGA AARAGEGLGL IQEAASVPEP
201AVPADLAEMA REPAEEAAEE KLSEEATEEP DAEEPATEEP
241TA QEATAPE EVTKSQPEKW DEEAQDAAGE EEKEQEKEKD
281AENKVKNSKG T
结构预测来自 AlphaFold DB（UniProt: Q5JQC4），颜色表示 pLDDT 置信度（深蓝高、黄橙低）。

基因突变

基因突变

CT47A9基因的碱基突变：           仅显示部分snp

基因表达

基因表达

CT47A9基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAGAAGCTCTCAGAGGAGG
59
AGATTTAGTGACTTCCTCTGGG
59
GGAGAAGCTCTCAGAGGAG
59
GATTTAGTGACTTCCTCTGGG
58
GAGAAGCTCTCAGAGGAGG
59
GATTTAGTGACTTCCTCTGGG
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CT47A9基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CT47A9基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CT47A9基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

String
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关联基因 作用方式 资源库来源/分值

基因通路

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