CT47A6 (cancer/testis antigen family 47 member A6)

symbol:
CT47A6
locus group:
protein-coding gene
location:
Xq24
gene_family:
alias symbol:
CT47.6
alias name:
cancer/testis CT47 family, member 6
entrez id:
728062
ensembl gene id:
ENSG00000226023
ucsc gene id:
uc065ayf.1
refseq accession:
NM_001080141
hgnc_id:
HGNC:33287
approved reserved:
2009-03-09
Xq24

CT47A6(癌症/睾丸抗原家族47成员A6)属于CT47基因家族,该家族由多个高度相似的基因组成,主要特征是在正常组织中仅表达于睾丸(免疫豁免器官),而在多种癌症中异常激活,因此被归类为癌症/睾丸抗原(CTA)家族。这类基因通常具有以下共性:在正常组织中表达受限(主要限于生殖细胞),但在恶性肿瘤中广泛重新激活;编码的蛋白质可能含有重复序列结构域;其功能多与精子发生或肿瘤免疫逃逸相关。CT47A6的具体生物学功能尚未完全阐明,但研究表明其表达产物可能参与细胞增殖调控或免疫应答调节。该基因位于X染色体q24区域,其启动子区域常因去甲基化在癌症中异常激活。突变或表观遗传改变导致CT47A6过表达时,可能通过干扰免疫识别促进肿瘤进展,尤其在肺癌、乳腺癌和黑色素瘤中观察到其高表达与不良预后相关。相反,降低表达可能减弱肿瘤的免疫逃逸能力。值得注意的是,CT47A家族成员间序列相似度极高(>95%),这导致针对特定成员的研究存在技术挑战。目前认为该家族基因可能通过表达肿瘤特异性抗原影响免疫监视,但其确切分子机制仍需进一步研究。由于CT抗原在肿瘤特异性表达的特性,CT47A6及其家族成员被视为潜在的免疫治疗靶点,相关疫苗和CAR-T疗法正在探索中。

中文English

此轨迹表示癌症/睾丸基因家族47.这一家族的成员,也称为CT47,是由13在Xq24群集几乎相同的基因座。 [由RefSeq的,2010年9月提供]

CT47A6基因的碱基序列:[NCBI]
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蛋白质序列
1MSATGDRHPT QGDQEAPVSQ EGAQAEAAGA GNQEGGDSGP
41DSSDVVPAAE VVGVAGPVEG LGEEEGEQAA GLAAVPRGGS
81 AEEDSDIGP ATEEEEEEEG NEAANFDLAV VARRYPASGI
121HFVLLDMVHS LLHRLSHNDH ILIENRQLSR LMVGPHAAAR
161N LWGNLPPL LLPQRLGAGA AARAGEGLGL IQEAASVPEP
201AVPADLAEMA REPAEEAAEE KLSEEATEEP DAEEPATEEP
241TA QEATAPE EVTKSQPEKW DEEAQDAAGE EEKEQEKEKD
281AENKVKNSKG T
结构预测来自 AlphaFold DB(UniProt: Q5JQC4),颜色表示 pLDDT 置信度(深蓝高、黄橙低)。
CT47A6基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs775394054       rs769991736       rs774182008       rs765672028       rs765860787       rs768410726       rs769551097       rs760158041       rs760249519       rs761409447       rs753132845       rs754387926       rs369076692       rs372047737       rs749291393       rs199666705      

CT47A6基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAGAAGCTCTCAGAGGAGG
58
AGATTTAGTGACTTCCTCTGGG
59
GGAGAAGCTCTCAGAGGAG
58
GATTTAGTGACTTCCTCTGGG
57
GAGAAGCTCTCAGAGGAGG
58
GATTTAGTGACTTCCTCTGGG
57
      尚未收录相关数据

CT47A6基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CT47A6基因的本体(GO)信息:

可能调控 CT47A6基因的相关microRNA:     

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关联基因 作用方式 资源库来源/分值
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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