CT47A4 (cancer/testis antigen family 47 member A4)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CT47A4
locus group:
protein-coding gene
location:
Xq24
gene_family:
alias symbol:
CT47.4
alias name:
cancer/testis CT47 family, member 4
entrez id:
728075
ensembl gene id:
ENSG00000230594
ucsc gene id:
uc004etk.5
refseq accession:
NM_001080143
hgnc_id:
HGNC:33285
approved reserved:
2009-03-09

基因染色体位置

基因染色体位置

Xq24

基因简述

基因简述

CT47A4（癌症/睾丸抗原家族47成员A4）属于CT47基因家族，该家族由多个成员组成，主要特征是在正常组织中仅表达于睾丸，而在多种癌症中异常表达，因此被归类为癌症/睾丸抗原（CTA）基因家族。CT47基因家族的共性包括X染色体连锁、在生殖细胞中特异性表达以及在肿瘤中通过表观遗传学改变（如DNA去甲基化）被异常激活。CT47A4编码的蛋白功能尚未完全明确，但与其他CTA类似，可能参与肿瘤发生或免疫逃逸，其表达产物可能被免疫系统识别为肿瘤相关抗原，具有潜在的免疫治疗靶点价值。该基因的主要作用位点可能在细胞核或细胞质，推测参与转录调控或信号转导。突变对CT47A4功能的影响研究较少，但家族其他成员的异常表达与肿瘤进展、耐药性相关。CT47A4过表达常见于肺癌、乳腺癌等恶性肿瘤，可能促进细胞增殖或转移，而表达降低可能减弱肿瘤的免疫原性。它与癌症关联性强，尤其是表观遗传失调导致的再激活可能推动肿瘤发生。由于家族成员高度同源，功能可能存在冗余，单一基因敲除可能被其他成员补偿。目前针对该基因的研究仍在探索阶段，其具体机制和临床应用需进一步验证。

中文English

此轨迹表示癌症/睾丸基因家族47.这一家族的成员，也称为CT47，是由13在Xq24群集几乎相同的基因座。 [由RefSeq的，2010年9月提供]

OMIM数据库中对CT47A4基因的介绍     Wikipedia数据库中对CT47A4基因的介绍

基因序列

基因序列

CT47A4基因的碱基序列：[NCBI]
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编码蛋白质

编码蛋白质

蛋白质序列
1MSATGDRHPT QGDQEAPVSQ EGAQAEAAGA GNQEGGDSGP
41DSSDVVPAAE VVGVAGPVEG LGEEEGEQAA GLAAVPRGGS
81 AEEDSDIGP ATEEEEEEEG NEAANFDLAV VARRYPASGI
121HFVLLDMVHS LLHRLSHNDH ILIENRQLSR LMVGPHAAAR
161N LWGNLPPL LLPQRLGAGA AARAGEGLGL IQEAASVPEP
201AVPADLAEMA REPAEEAAEE KLSEEATEEP DAEEPATEEP
241TA QEATAPE EVTKSQPEKW DEEAQDAAGE EEKEQEKEKD
281AENKVKNSKG T
结构预测来自 AlphaFold DB（UniProt: Q5JQC4），颜色表示 pLDDT 置信度（深蓝高、黄橙低）。

基因突变

基因突变

CT47A4基因的碱基突变：           仅显示部分snp

基因表达

基因表达

CT47A4基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAGAAGCTCTCAGAGGAGG
59
AGATTTAGTGACTTCCTCTGGG
59
GGAGAAGCTCTCAGAGGAG
59
GATTTAGTGACTTCCTCTGGG
58
GAGAAGCTCTCAGAGGAGG
59
GATTTAGTGACTTCCTCTGGG
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CT47A4基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CT47A4基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CT47A4基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

String
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关联基因 作用方式 资源库来源/分值

基因通路

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疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
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