CT47A3 (cancer/testis antigen family 47 member A3)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CT47A3
locus group:
protein-coding gene
location:
Xq24
gene_family:
alias symbol:
CT47.3
alias name:
cancer/testis CT47 family, member 3
entrez id:
728082
ensembl gene id:
ENSG00000236126
ucsc gene id:
uc004etl.5
refseq accession:
NM_001080144
hgnc_id:
HGNC:33284
approved reserved:
2009-03-09

基因染色体位置

基因染色体位置

Xq24

基因简述

基因简述

CT47A3（癌症/睾丸抗原家族47成员A3）属于CT47基因家族，该家族由多个成员组成，主要特征是在正常组织中仅表达于睾丸，而在多种癌症中异常表达，因此被归类为癌症/睾丸抗原（CTA）家族。CT47基因家族的共性包括X染色体连锁、睾丸特异性表达模式以及在肿瘤发生中的潜在免疫原性。CT47A3编码的蛋白功能尚未完全阐明，但基于家族特性推测可能参与生殖细胞发育或肿瘤免疫逃逸。其主要作用位点可能在细胞核或细胞质，通过与特定蛋白相互作用调控基因表达或信号通路。CT47A3突变可能破坏其正常功能，导致细胞增殖异常，但具体机制仍需研究。该基因与多种恶性肿瘤相关，包括肺癌、乳腺癌和黑色素瘤，其异常表达可能作为肿瘤诊断标志物或免疫治疗靶点。当CT47A3过表达时，可能促进肿瘤细胞增殖、转移或免疫逃逸，而表达降低可能减弱这些效应。CT47A3的表达变化可能影响其他CTA家族成员或免疫相关基因（如MAGE、NY-ESO-1）的表达模式，形成协同或拮抗作用。由于CTA家族基因常通过表观遗传沉默在正常体细胞中失活，CT47A3的重新激活可能提示DNA甲基化或组蛋白修饰异常。目前针对CT47A3的研究仍处于早期阶段，其精确分子机制和临床应用价值需要进一步探索。

中文English

此轨迹表示癌症/睾丸基因家族47.这一家族的成员，也称为CT47，是由13在Xq24群集几乎相同的基因座。 [由RefSeq的，2010年9月提供]

OMIM数据库中对CT47A3基因的介绍     Wikipedia数据库中对CT47A3基因的介绍

基因序列

基因序列

CT47A3基因的碱基序列：[NCBI]
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编码蛋白质

编码蛋白质

蛋白质序列
1MSATGDRHPT QGDQEAPVSQ EGAQAEAAGA GNQEGGDSGP
41DSSDVVPAAE VVGVAGPVEG LGEEEGEQAA GLAAVPRGGS
81 AEEDSDIGP ATEEEEEEEG NEAANFDLAV VARRYPASGI
121HFVLLDMVHS LLHRLSHNDH ILIENRQLSR LMVGPHAAAR
161N LWGNLPPL LLPQRLGAGA AARAGEGLGL IQEAASVPEP
201AVPADLAEMA REPAEEAAEE KLSEEATEEP DAEEPATEEP
241TA QEATAPE EVTKSQPEKW DEEAQDAAGE EEKEQEKEKD
281AENKVKNSKG T
结构预测来自 AlphaFold DB（UniProt: Q5JQC4），颜色表示 pLDDT 置信度（深蓝高、黄橙低）。

基因突变

基因突变

CT47A3基因的碱基突变：           仅显示部分snp

基因表达

基因表达

CT47A3基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAGAAGCTCTCAGAGGAGG
59
AGATTTAGTGACTTCCTCTGGG
59
GGAGAAGCTCTCAGAGGAG
59
GATTTAGTGACTTCCTCTGGG
58
GAGAAGCTCTCAGAGGAGG
59
GATTTAGTGACTTCCTCTGGG
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CT47A3基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CT47A3基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CT47A3基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

String
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关联基因 作用方式 资源库来源/分值

基因通路

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疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
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