CSRP2 (cysteine and glycine rich protein 2)

symbol:
CSRP2
locus group:
protein-coding gene
location:
12q21.2
gene_family:
alias symbol:
SmLIM|CRP2|LMO5
alias name:
None
entrez id:
1466
ensembl gene id:
ENSG00000175183
ucsc gene id:
uc001syl.2
refseq accession:
NM_001321
hgnc_id:
HGNC:2470
approved reserved:
1997-06-18
12q21.2
基因染色体位置图

CSRP2(Cysteine and Glycine-Rich Protein 2)属于CSRP基因家族,该家族还包括CSRP1、CSRP3等成员,它们共同的特点是含有富含半胱氨酸和甘氨酸的结构域(LIM结构域),能够介导蛋白质间的相互作用,参与细胞骨架组织、信号转导和基因表达调控等过程。CSRP2主要表达于平滑肌细胞和某些非肌肉细胞中,其编码的蛋白质(也称为肌肉LIM蛋白或MLP)通过与肌动蛋白等细胞骨架成分结合,调节细胞的形态、迁移和机械应力响应。在心血管系统中,CSRP2对心肌和平滑肌的发育与功能维持至关重要,它通过调控肌原纤维的组装和稳定性影响肌肉收缩功能。CSRP2的突变可能导致其功能丧失,与某些心肌病(如扩张型心肌病)和血管发育异常相关,表现为心脏收缩功能障碍或血管壁结构缺陷。若CSRP2过表达,可能增强细胞骨架的稳定性,但过度激活可能干扰正常的细胞迁移或分化,例如在肿瘤中可能与侵袭性增加有关;而降低表达时,会导致肌细胞结构紊乱、收缩力下降,甚至引发心力衰竭或血管畸形。此外,CSRP2与TGF-β等信号通路相互作用,影响组织纤维化进程。在基因家族中,CSRP成员均通过LIM结构域参与细胞机械传感和转录调控,但各亚型具有组织特异性,如CSRP3主要在心肌中发挥作用。研究还发现CSRP2与某些癌症的转移潜力相关,可能通过调控上皮-间质转化(EMT)促进肿瘤进展。

CSRP2 is a member of the CSRP family of genes, encoding a group of LIM domain proteins, which may be involved in regulatory processes important for development and cellular differentiation. CRP2 contains two copies of the cysteine-rich amino acid sequence motif (LIM) with putative zinc-binding activity, and may be involved in regulating ordered cell growth. Other genes in the family include CSRP1 and CSRP3. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jul 2014]

CSRP2是CSRP基因家族的一个成员,编码组LIM结构域的蛋白质,其可以参与发展和细胞分化的重要调节过程。 CRP2包含富含半胱氨酸的氨基酸序列基序(LIM)与推定的锌结合活性的两个副本,并可能参与调节有序细胞生长。在家庭中的其他基因包括CSRP1和CSRP3。选择性剪接结果在多个抄本变形。 [由RefSeq的,2014年7月提供]

CSRP2基因的碱基序列:[NCBI]
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CSRP2基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs762784       rs762785       rs762786       rs1587110       rs2047226       rs2047227       rs2071326       rs3223657       rs4315131       rs4421791       rs4421792       rs4604937       rs4761452       rs4761453       rs5799292       rs5799293       rs6539759      

CSRP2基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTTTCTCTGCATGGTTTGCA
60
GCAGGATTTGCAGTAGATCTC
59
TAATTGGAGCTGGAAAGCC
58
ACTCTTCCCACACTTTGCA
60
GAGGTGGAAACAAGTGTGG
59
TACTGCAGAGAAAGCAGCA
59
ATAATTGGAGCTGGAAAGCC
58
CTCTTCCCACACTTTGCAC
59
GGAGGTGGAAACAAGTGTG
59
TCACACTGCACCTCTTCTG
60
TTTCTCTGCATGGTTTGCAG
60
GCAGGATTTGCAGTAGATCTC
59
TTTCTCTGCATGGTTTGCA
58
GCAGGATTTGCAGTAGATCTC
59
GAGGTGGAAACAAGTGTGG
59
TCACACTGCACCTCTTCTG
60
TAATTGGAGCTGGAAAGCC
58
CTCTTCCCACACTTTGCAC
59
      尚未收录相关数据

CSRP2基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CSRP2基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0008270
F8VQR7 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
F8VW96 (UniProtKB)
IEA
GO:0003674
Q16527 (UniProtKB)
ND
GO:0005515
Q16527 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q16527 (UniProtKB)
NAS
GO:0005925
Q16527 (UniProtKB)
IDA
GO:0007275
Q16527 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
Q16527 (UniProtKB)
IEA
GO:0030154
Q16527 (UniProtKB)
NAS
GO:0045445
Q16527 (UniProtKB)
IEA

可能调控 CSRP2基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malignant neoplasm of breast 0.000271442 1 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

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